Stage Master 2 : Dashboard interactif pour la curation MAGs

SFBI; Arrondissement d'Évry; Sur place; EUR 6 700 - 10 000; Plein temps

Avantages offerts par ce poste

Gratification de stage

Résumé du poste

Stage Master 2 à LABGeM (Genoscope, Evry) pour développer un tableau de bord interactif et robuste de curation MAGNET. Vous utiliserez Dash/Python pour une sélection interactive des contigs et une inspection visuelle des MAGs, avec intégation de CheckM/CheckM2 pour guider les décisions.

Le stage de 6 mois débute le 1er février 2027, dans un environnement de recherche dédié à la génomique environnementale, avec une gratification légale de stage M2 et des perspectives de contribution à des

Qualifications

• Étudiant en Master 2 en Bioinformatique ou équivalent.
• Compétences en Python (Pandas/Plotly/Dash) et Bash.
• Connaissances en génomique et analyses de séquences; bases en microbiologie et SQL.

Responsabilités

• Optimiser et designer le tableau de bord MAGNET pour la curation MAGs.
• Intégrer des outils d’évaluation de qualité (CheckM/CheckM2) au workflow.
• Tester sur des données métagénomiques environnementales et valider la qualité des MAGs.

Connaissances

Python

Pandas

Plotly

Dash

SQL

Bash

Formation

Master 2 en Bioinformatique

Outils

Git

CheckM

CheckM2

Description du poste

Stage Master 2 à LABGeM (Genoscope, Evry) pour développer un tableau de bord interactif et robuste de curation MAGNET. Vous utiliserez Dash/Python pour une sélection interactive des contigs et une inspection visuelle des MAGs, avec intégation de CheckM/CheckM2 pour guider les décisions.

Le stage de 6 mois débute le 1er février 2027, dans un environnement de recherche dédié à la génomique environnementale, avec une gratification légale de stage M2 et des perspectives de contribution à des