Stage M2: Modèles Épidémiologiques Spatiaux et Inférence ABC

INRAE; Avignon; On-site; EUR 5,500 - 8,300; Full time

Job summary

INRAE Avignon recrute un stagiaire M2 en mathématiques ou mathématiques appliquées pour développer un cadre probabiliste d’épidémiologie spatiale, adapté à des données génétiques pathogènes. Le candidat étendra les modèles, analysera la structuration spatiale et contribuera à la mise en place d’un pipeline d’inférence par ABC.

Le stage, encadré par l’équipe BioSP, peut déboucher sur une thèse dans le cadre de l’ANR JCJC PAstae.

Qualifications

• Formation en mathématiques ou mathématiques appliquées exigée.
• Connaissances en probabilités et modèles stochastiques indispensables.
• Compétences en programmation Python et/ou R requises.

Responsibilities

• Étendre le cadre de modélisation pour intégrer la diversité génétique des pathogènes.
• Analyser l’évolution de la structuration spatiale de la diversité génétique et déduire des prédictions sur la persistance locale et globale.
• Utiliser le cadre dual pour simuler de grands jeux d’échantillons et initier un pipeline d’inférence ABC.

Skills

Probabilités

Martingales

Processus stochastiques

Génétique des populations

Python

R

Education

M1 en mathématiques

M2 en mathématiques appliquées

Tools

Python

R

Job description

INRAE Avignon recrute un stagiaire M2 en mathématiques ou mathématiques appliquées pour développer un cadre probabiliste d’épidémiologie spatiale, adapté à des données génétiques pathogènes. Le candidat étendra les modèles, analysera la structuration spatiale et contribuera à la mise en place d’un pipeline d’inférence par ABC.

Le stage, encadré par l’équipe BioSP, peut déboucher sur une thèse dans le cadre de l’ANR JCJC PAstae.