Stage M2: Métabarcoding du plancton Indo-Pacifique

SFBI; Roscoff; Presencial; EUR 10.000 - 15.000; Jornada completa

Descripción de la vacante

Stage M2 à la Station Biologique de Roscoff (ABiMS) est destiné à analyser des données de métabarcoding ADN collectées lors de la Mission Bougainville. Le stagiaire utilisera des pipelines reproductibles et travaillera sur la gestion des données dans une optique FAIR.

Sous la supervision de Nicolas Henry et en collaboration avec Colomban de Vargas, vous contribuerez à une première biogéographie moléculaire des eaux indo-pacifiques et à la rédaction d’un data paper.

Formación

• Master 2 (Bac+5) exigé.
• Analyse rigoureuse et reproductible de données de metabarcoding.
• Connaissance des pipelines bioinformatiques reproductibles.
• Gestion des données et PGD dans une perspective FAIR.

Responsabilidades

• Réaliser une analyse des données de metabarcoding récoltées lors de la mission Bougainville.
• Assembler des tables d’ASVs et utiliser les pipelines ABiMS.
• Vérifier la qualité des données et la complétude des métadonnées (environnement, échantillonnage).
• Réaliser des analyses écologiques descriptives et illustrer les jeux de données.
• Contribuer à l’amélioration du PGD et préparer la publication des données (data paper).

Educación

Master ABiMS

Descripción del empleo

Stage M2 à la Station Biologique de Roscoff (ABiMS) est destiné à analyser des données de métabarcoding ADN collectées lors de la Mission Bougainville. Le stagiaire utilisera des pipelines reproductibles et travaillera sur la gestion des données dans une optique FAIR.

Sous la supervision de Nicolas Henry et en collaboration avec Colomban de Vargas, vous contribuerez à une première biogéographie moléculaire des eaux indo-pacifiques et à la rédaction d’un data paper.