Stage M2: eDNA et conservation des échantillons

Asnr; Saint-Paul-lès-Durance; On-site; EUR 10,000 - 12,000; Full time

Job summary

ASNR, situé à Saint-Paul-lez-Durance, propose un stage Master 2 sur l’influence des méthodes de conservation sur la reconstruction de la biodiversité par ADN environnemental. Le stagiaire réalisera des amplifications PCR et préparera des librairies NGS dans le cadre du projet MITI RISE eDNA.

Vous travaillerez sur des échantillons prélevés en 2026 et étudierez l’impact des méthodes de conservation, avec une analyse bio-informatique incluant OBITools et metabaR.

Qualifications

• Première expérience en biologie moléculaire et/ou en analyse de données bio-informatiques (formation incluse).
• Maîtrise du langage R et première expérience de l’environnement Linux.
• Une expérience en métabarcoding serait un plus.

Responsibilities

• Réaliser des amplifications par PCR sur des échantillons d’ADN déjà extraits.
• Préparer les librairies de séquençage NGS et lancer les analyses pipelines pré-définis.
• Analyser les données de séquençage et interpréter les résultats en contexte biodiversité.

Skills

Biologie moléculaire

Bio-informatique

R

Linux

Métabarcoding

Education

Master 2

Tools

OBITools

metabaR

Job description

ASNR, situé à Saint-Paul-lez-Durance, propose un stage Master 2 sur l’influence des méthodes de conservation sur la reconstruction de la biodiversité par ADN environnemental. Le stagiaire réalisera des amplifications PCR et préparera des librairies NGS dans le cadre du projet MITI RISE eDNA.

Vous travaillerez sur des échantillons prélevés en 2026 et étudierez l’impact des méthodes de conservation, avec une analyse bio-informatique incluant OBITools et metabaR.