Stage en modélisation moléculaire - Prédiction de résistance

Pierre Fabre; Toulouse; Hybride; EUR 11 000 - 16 000; Plein temps

Avantages offerts par ce poste

Restauration d’entreprise

Titres-restaurants

Télétravail 1 jour/semaine

Gratification attractive

Résumé du poste

Le laboratoire Pierre Fabre à Toulouse, site Langlade, propose un stage de chimie computationnelle en modélisation moléculaire dans le cadre de la recherche en oncologie. Vous travaillerez sur le développement d'une pipeline de prédiction de résistance et contribuerez à la construction de jeux de données publics et internes, avec une mission d'évaluation et de documentation.

Ce stage offre une gratification attractive, un jour de télétravail par semaine après intégration, et des échanges avec

Qualifications

• Master 2 en chimie computationnelle, chimie computationnelle, biologie structurale, biologie computationnelle, bioinformatique ou domaine équivalent.
• Bonne compréhension des interactions protéine–ligand.
• Bonne connaissance des bases COSMIC, cBioPortal et TCGA.
• Connaissance de la base de données MdrDB est un plus.
• Bonnes connaissances en biologie structurale et en modélisation de protéines.
• Bases en génomique du cancer et en biologie moléculaire (mutations somatiques, mécanismes de résistance).
• Notions de base en manipulation de fichiers de séquences/structures (FASTA, PDB).
• Savoir travailler avec Linux et coder en Python.
• Rigueur, autonomie et esprit critique, notamment pour la validation méthodologique.
• Bon niveau de rédaction scientifique (français et/ou anglais).

Responsabilités

• Concevoir et tester une pipeline de prédiction de résistance.
• Créer un jeu de données public et interne pour validation.
• Exécuter les outils de prédiction et évaluer les performances (sensibilité, spécificité, faux positifs/négatifs).
• Identifier les limites et développer une méthode applicable à différentes cibles thérapeutiques.
• Documenter le protocole et les résultats, et formuler des recommandations sur l'usage des outils.
• Présenter l'avancement et les conclusions à l'équipe tout au long du stage.

Connaissances

Protein–ligand interactions

Python

Linux

Biologie structurale

Cancer Genomics

Data handling

Formation

Master 2 en chimie computationnelle

Outils

COSMIC

cBioPortal

TCGA

MdrDB

Description du poste

Le laboratoire Pierre Fabre à Toulouse, site Langlade, propose un stage de chimie computationnelle en modélisation moléculaire dans le cadre de la recherche en oncologie. Vous travaillerez sur le développement d'une pipeline de prédiction de résistance et contribuerez à la construction de jeux de données publics et internes, avec une mission d'évaluation et de documentation.

Ce stage offre une gratification attractive, un jour de télétravail par semaine après intégration, et des échanges avec