Chimiste, Modélisation Moléculaire — Prédiction de Résistance

INSTITUT DE RECHERCHE PIERRE FABRE SAS; Pechbusque; Sur place; EUR 12 000 - 18 000; Plein temps

Avantages offerts par ce poste

Diverses missions

Gratification attractive

Télétravail 1 jour/semaine

Dotations produits

Restaurant d'entreprise

Résumé du poste

Le stage se déroule au sein de Pierre Fabre Laboratories, acteur international de dermo-cosmétique et de pharma, sur des activités de recherche en oncologie à Toulouse (Langlade). Vous contribuerez au développement d'une méthode de prédiction des mutations de résistance et à une pipeline applicable à diverses cibles thérapeutiques.

Vos missions incluent la création d'un jeu de données, l'évaluation d'outils de prédiction et la documentation des résultats.

Qualifications

• Étudiant en Master 2 dans les domaines indiqués.
• Bonne compréhension des interactions protéine-ligand.
• Savoir exploiter COSMIC, cBioPortal, TCGA; connaissance de MdrDB est un plus.
• Bonnes connaissances en biologie structurale et en modélisation de protéines.
• Connaissances en génomique du cancer et biologie moléculaire.
• Notions en manipulation de fichiers de séquences (FASTA) et structures (PDB).
• Maîtrise de Linux et Python.
• Rigueur, autonomie et esprit critique.
• Bonnes compétences rédactionnelles en français et/ou anglais.

Responsabilités

• Construire un jeu de données publiques et internes pour la validation des outils.
• Exécuter les outils de prédiction et évaluer leurs performances (sensibilité, spécificité, faux positifs/négatifs).
• Identifier les limites et développer une méthode applicable à différentes cibles thérapeutiques.
• Documenter le protocole et les résultats, et formuler des recommandations sur l'usage des outils (cas d'application, limites).
• Présenter l'avancement et les conclusions à l'équipe tout au long du stage.

Connaissances

Protein–ligand interactions

Autonomie

Rigueur

Esprit critique

Rédaction scientifique

Connaissance Linux

Python

Biologie structurale

Modélisation de protéines

Génomique du cancer

Formation

Master 2 en chimie informatique / chimie computationnelle / biologie structurale / biologie computationnelle / bio-informatique

Outils

Linux

Python

COSMIC

cBioPortal

TCGA

MdrDB

Description du poste

Le stage se déroule au sein de Pierre Fabre Laboratories, acteur international de dermo-cosmétique et de pharma, sur des activités de recherche en oncologie à Toulouse (Langlade). Vous contribuerez au développement d'une méthode de prédiction des mutations de résistance et à une pipeline applicable à diverses cibles thérapeutiques.

Vos missions incluent la création d'un jeu de données, l'évaluation d'outils de prédiction et la documentation des résultats.