Stage écotoxicologie microbienne eaux souterraines

BRGM; Centre-Val de Loire; On-site; EUR 12,000 - 16,000; Part time

Job summary

Le BRGM, Centre-Val de Loire, propose un stage en écotoxicologie microbienne des eaux souterraines dans le cadre du projet DEEPTHOUGHT (Water4All). Le stagiaire travaillera sur la dénitrification et la diversité des communautés microbiennes des aquifères, en lien avec des paramètres physico-chimiques, au sein de l'équipe Qualité des Eaux Souterraines.

Le candidat recherché est en Master 1, avec des compétences en microbiologie et en bioinformatique; autonomie et esprit d'équipe seront appréciés.

Qualifications

• Titre requis: Master 1 en écologie ou écotoxicologie microbienne de l'environnement.
• Maitrise des approches expérimentales classiques de microbiologie et de biologie moléculaire souhaitable.
• Bonne maitrise des traitements statistiques et notions de bioinformatique favorables.

Responsibilities

• Étudier le processus de dénitrification dans les aquifères.
• Mettre en place et suivre des expérimentations sur le cycle de l'azote et les perturbations anthropiques.
• Analyser des données physico-chimiques et microbiologiques; interpréter les résultats et contribuer à des publications.

Skills

Biologie moléculaire

Expérience labo

Bioinformatique

Education

Master 1 en écologie ou écotoxicologie microbienne

Job description

Identifiant (email, de type [e-mail])

Mots clés (ex : ingénieur commercial Paris)

Stage écotoxicologie microbienne eaux souterraines

Métier

F01 Biologie - Ingénieur·e / Chercheur·e

Intitulé du poste

Stage écotoxicologie microbienne eaux souterraines

Durée du contrat

6 mois

Rejoindre le Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM), c'est intégrer l'établissement public de référence dans les sciences de la Terre rassemblant 1000 personnes expertes et passionnées, réparties dans 25 entités implantées en Hexagone et d'Outre-Mer). L'activité du BRGM a pour objectif la connaissance géologique et la compréhension des phénomènes liés au sol et au sous-sol, avec un enjeu : répondre aux défis des changements environnementaux à travers des projets innovants, à enjeux sociétaux.
Le BRGM recherche pour sa direction DE (Direction de l'Eau) unité QES (Qualité des eaux souterraines) une/un stagiaire pour étudier le processus de dénitrification lié à une fonction de la communauté microbienne dans les aquifères. Dans un contexte de changement global, ou les pressions anthropiques sont de plus en plus importantes, mieux comprendres les services ecosystémiques fourni par les aquifères est primordial pour préserver au mieux cette ressource en eau.

Description de la mission

Le projet de recherche DEEPTHOUGHT (Water4All) a pour objectif de mieux comprendre les dynamiques des nitrates dans les eaux souterraines en lien avec les pressions anthropiques (pollution, changement climatique). En particulier, l'équipe de projet du BRGM s'intéresse à la caractérisation des communautés microbiennes et leur activité dans la nappe de Beauce au nord d'Orléans. Au sein de l'équipe Qualité des Eaux Souterraines de la direction de l'eau du BRGM, ce projet de stage aura pour objectif de travailler sur la mise en place et le suivi d'expérimentations ciblés sur le cycle de l'azote en lien avec des perturbations anthropiques (pollution agricole ou géogénique, apports de matière organique).
Mieux comprendre le service écosystémique de la dénitrification dans les eaux souterraines dans un contexte de changement global est un enjeu majeur pour la préservation cette ressource en eau. Faisant varier les conditions expérimentales (gradient Eh, gradient d'oxygène, quantité de matière organique, pesticides…), soit en systèmes fermés soit en colonne, l'étudiant suivera des paramètres physico-chimiques (Eh, pH, NO3…) ainsi que les communautés microbiennes, par des approches moléculaires (Extraction ADN, PCR, qPCR, séquençage Nanopore), afin de mieux comprendre la diversité fonctionnelle des communautés microbiennes dans ces écosystèmes et de caractériser celles responsables de la dénitrification et autres cycles biogéochimiques majeurs. L'analyse de données de metabarcoding en lien avec les données biologiques et hydro-géochimiques feront également partie du projet et pourront être réaliser dans le cadre de ce stage. L'analyse et l'interprétation des résultats ainsi que leurs potentiels valorisation sous forme de publications dans des revues scientifiques pourront également être attendues.

Le candidat F/H doit être titulaire d'un master 1 en écologie ou écotoxicologie microbienne de l'environnement. La maitrise des approches expérimentales classiques de microbiologie et de biologie moléculaire est souhaitable, ainsi qu'une expérience en expérimentation en laboratoire. Une bonne maitrise de traitements des données par approches statistiques ainsi que des bases de bioinformatiques pourront être un plus. Il est également attendu que le candidat soit capable de planifier des expérimentation et leurs analyses, le tout avec une relativement bonne autonomie.

Spécificité du poste

• Stage en fin d'études : Master, ingénieur
• Niveau d'études requis : Master 1
• Durée du stage : 6 mois
• Période de stage : Janvier-Juillet 2027
• Le poste est à pourvoir au 04/01/2027.
• Votre lettre de motivation en langue française et un CV sont à adresser jusqu'au 14/12/2027.

Localisation du poste

France, Centre-Val de Loire, Loiret (45)