Stage: Développe et validez une plateforme phénotypage haut débit

CTIFL; Prigonrieux; On-site; EUR 7,800 - 10,000; Full time

Benefits offered by this job

Hébergement possible

Job summary

CTIFL recherche un stagiaire pour participer au développement et à la validation de Fruitech, plateforme de phénotypage à haut débit des cultures fruitières. Vous contribuerez à l’acquisition, au traitement et à l’analyse des données, avec intégration de mesures physiologiques de référence et appui sur les essais MATCHA.

Formation: Licence/Bachelor/M2 ou dernière année d’école d’ingénieur en bio-informatique ou sciences des données appliquées au végétal.

Qualifications

• Connaissances en physiologie végétale.
• Appétence pour le phénotypage et l'instrumentation.
• Compétences en analyse et traitement de données.
• Bonnes connaissances de R et/ou Python.
• Connaissances en traitement d'images appréciées.
• Autonomie, rigueur et intérêt pour le travail expérimental.

Responsibilities

• Réaliser une synthèse bibliographique sur les méthodes de phénotypage moyen et haut débit appliquées aux cultures fruitières et à l'étude des stress abiotiques : imagerie, capteurs, indicateurs morphologiques et physiologiques et méthodes de traitement des données.
• Prise en main et caractérisation des différents équipements de la plateforme Fruitech : compréhension des données produites par les capteurs, définition des conditions d'acquisition et identification des paramètres pertinents pour la caractérisation des plantes.
• Rédaction de procédures et recommandations d'utilisation de Fruitech : protocoles d'acquisition, règles de contrôle qualité, organisation des données et méthodes d'analyse.
• Développement et validation de la chaîne de traitement des données, depuis les données brutes jusqu'à l'extraction d'indicateurs phénotypiques : organisation des données, contrôle qualité, automatisation des traitements, extraction de variables et analyse statistique.
• Appui sur des essais expérimentaux dans le cadre du projet MATCHA et de projets pommier, permettant de tester la plateforme sur du matériel végétal soumis à des conditions environnementales contrastées.
• Des mesures physiologiques de référence seront réalisées parallèlement afin d'évaluer la pertinence biologique des indicateurs issus du phénotypage.

Skills

Physiologie végétale

Phénotypage

Analyse de données

R et Python

Traitement d'images

Autonomie et rigueur

Education

Licence ou équivalent

Tools

R

Python

Imagerie

Job description

CTIFL recherche un stagiaire pour participer au développement et à la validation de Fruitech, plateforme de phénotypage à haut débit des cultures fruitières. Vous contribuerez à l’acquisition, au traitement et à l’analyse des données, avec intégration de mesures physiologiques de référence et appui sur les essais MATCHA.

Formation: Licence/Bachelor/M2 ou dernière année d’école d’ingénieur en bio-informatique ou sciences des données appliquées au végétal.