Stage Bioinfo: Analyse de la méthylation cfDNA

SFBI

Lyon

In loco

EUR 8900 - 13.000

Part-time

3 giorni fa

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Descrizione del lavoro

Le Laboratoire Commun de Recherche (LCR) Hospices Civils de Lyon – bioMérieux, situé à l’Hôpital Édouard Herriot, propose un stage Master 2 de 6 mois à Lyon et Marcy-l'Étoile. Le projet porte sur l’analyse des profils de méthylation du cfDNA à partir de données de séquençage et le développement de pipelines reproductibles.

Le candidat travaillera sur le traitement des données brutes, l’analyse du signal de séquençage et l’évaluation de différentes approches analytiques, en collaboration avec une

Competenze

Étudiant(e) en Master 2 de bioinformatique ou discipline proche.
Bonne maîtrise de Python et connaissance de R et Linux conseillés.
Intérêt pour l’épigénétique et le développement de méthodes bioinformatiques.

Mansioni

Prendre en main les données de séquençage et les outils bioinformatiques associés.
Mettre en place les étapes de contrôle qualité et de traitement des données cfDNA.
Explorer les approches de distinctinon humain/microbien et d’extraction des profils de méthylation.
Comparer les méthodes d’analyse et évaluer la robustesse des résultats avec des données de référence.
Contribuer à la mise en place d’un pipeline reproductible et à l’interprétation des résultats.

Conoscenze

Python

Linux

Formazione

Master 2 en bioinformatique

Descrizione del lavoro

Le candidat travaillera sur le traitement des données brutes, l’analyse du signal de séquençage et l’évaluation de différentes approches analytiques, en collaboration avec une

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