Senior AI Scientist- Molecular Discovery- CDI- F/M

Pierre Fabre Group; Toulouse; On-site; EUR 90,000 - 130,000; Full time

Job summary

Pierre Fabre recherche un Senior AI Scientist - Molecular Discovery à Toulouse pour concevoir et maintenir des workflows IA génératives et des protocoles basés sur les données afin de soutenir nos programmes de découverte de médicaments.

Le candidat dirigera le développement de méthodes d'exploration de l'espace moléculaire et d'optimisation moléculaire dans notre pipeline oncologie, avec une forte interaction entre chimie médicinale et data science.

Qualifications

• :Doctorat en informatique/IA/cheminformatique ou discipline associée
• :Expérience en ML/IA appliquée à la découverte moléculaire
• :Connaissance des modèles diffusion et de la modélisation structurale
• :Intégration de contraintes physico-chimiques dans des cadres ML

Responsibilities

• :Concevoir et mettre en place des pipelines IA pour la découverte moléculaire
• :Intégrer IA et physique pour la prédiction de structures biomoléculaires
• :Développer des protocoles d'échantillonnage conformationnel avec ML
• :Automatiser des tâches computationnelles avec Python et libraries associées

Skills

Machine learning

Diffusion models

Graph Neural Networks

Attention models

Python

PyTorch

RDKit

NumPy

SciPy

Git

Education

PhD in Computer Science, AI, Cheminformatics or related Computational Science

Tools

PyTorch Geometric

RDKit

NumPy

SciPy

Git

UNIX/Linux

HPC

Job description

Qui sommes-nous ?

Pierre Fabre est le 2ème laboratoire dermo-cosmétique mondial, le 2ème groupe pharmaceutique privé français et le leader des produits vendus hors prescription dans les pharmacies en France. Son portefeuille compte plusieurs franchises médicales et marques internationales dont Pierre Fabre Oncologie, Pierre Fabre Dermatologie, Eau Thermale Avène, Klorane, Ducray, René Furterer, A-Derma, Naturactive et Pierre Fabre Oral Care. Implanté depuis toujours en région Occitanie, fabricant plus de 95% de ses produits en France, le groupe emploie près de 10 000 collaborateurs dans le monde et distribue ses produits dans quelque 130 pays. Pierre Fabre est détenu à 86% par la Fondation Pierre Fabre, une fondation reconnue d’utilité publique, et secondairement par ses collaborateurs à travers un plan d’actionnariat salarié. En 2021, Ecocert Environnement a évalué la démarche de responsabilité sociétale et environnementale du Groupe selon la norme ISO 26000 du développement durable et lui a attribué le niveau « Excellence ». Pierre Fabre est reconnu comme l’un des « Meilleurs Employeurs du Monde 2021 » par Forbes. Notre groupe est classé dans le Top 6 de l’industrie cosmétique et dans le Top 7 de l’industrie pharmaceutique dans le monde. Nous sommes convaincus que notre engagement et notre passion font préserver notre indépendance et vivre notre raison d'être.

Votre mission

We are seeking a Senior AI Scientist- Molecular Discovery, to design, build, and maintain generative AI workflows and data-driven protocols to support our drug discovery programs. The successful candidate plays a pivotal role in accelerating the identification of high-quality drug candidates by leading the development of machine learning methodologies to chemical space exploration and molecular optimization within our oncology pipeline. Your role within a pioneering company in full expansion:

• AI-Driven Discovery Architecture: Designing and implementing robust, automated pipelines that combine AI-driven methods with physics-based simulations.
• AI-Physics Integration & Structural Modeling: Bridge the gap between machine learning and molecular physics by developing workflows for the accurate structure prediction of biomolecular interactions. This involves implementing state-of-the-art diffusion models to characterize the interactions between proteins, nucleic acids, and small molecules.
• AI-Driven Conformational Sampling: Implement and refine AI-based protocols for sampling protein-ligand conformations. This includes utilizing deep learning methods to accelerate or replace traditional molecular dynamics, enabling the rapid exploration of the conformational landscape with high fidelity.
• Methodological Innovation: Evaluating and incorporating emerging methods from peer-reviewed literature to enhance the accuracy and efficiency of the discovery platform.
• Protocol Automation: Developing production-grade Python scripts and libraries to automate routine computational tasks, ensuring reproducibility across all discovery programs.
• Cross-Functional Technical Support: Acting as a technical bridge between medicinal chemistry and data science, ensuring that automated protocols are effectively applied by the computational chemistry team.

This position is based in Toulouse, with plenty of flexibility for remote work. We offer an attractive remuneration/benefits package: Incentives, profit-sharing, Pierre Fabre shareholding with matching contribution, health and provident insurance, 16 days of holidays (RTT) in addition to 25 days of personal holidays, public transport participation, very attractive CE...

Qui êtes-vous ?

Your skills at the service of innovative projects:

• Education: A PhD in Computer Science, Artificial Intelligence, Cheminformatics, or a related Computational Science. Candidates from a CS/DS background should demonstrate a significant track record of applying these techniques to molecular systems or drug design.
• Machine Learning Expertise: Proven proficiency in designing or deploying deep learning architectures, specifically diffusion models, Graph Neural Networks (GNNs), or Attention-based models, applied to structural biology or chemistry.
• Physics-Aware AI: Experience with the integration of physical principles into ML models, including knowledge of AI-driven structural prediction and techniques for sampling biomolecular ensembles.
• Advanced Programming: Expert-level command of Python and its scientific/AI ecosystem (PyTorch, PyTorch Geometric, RDKit, NumPy, SciPy) for the development of complex discovery workflows.
• Chemistry & Drug Design Awareness: A strong understanding of chemical informatics and the ability to integrate physical constraints, such as synthetic accessibility or valency, into machine learning frameworks.
• Software Engineering: Strong experience in Unix/Linux environments, high-performance computing (HPC) management, and professional version control practices (Git).
• Communication: Excellent written and oral communication skills, with the ability to document technical protocols clearly for a multi-disciplinary audience.

Nous sommes convaincus que la diversité est une source d’épanouissement, d’équilibre social et de complémentarité pour nos collaborateurs, nos offres sont donc ouvertes à toutes et tous sans restriction. Les Laboratoires Pierre Fabre sont la 2ème entreprise dermo-cosmétique au monde et l’un des principaux laboratoires pharmaceutiques européens. Notre portefeuille Dermo-Cosmétique & Personal Care est composée de marques internationales dont Eau Thermale Avène, Ducray, Klorane, A-Derma, René Furterer, Même Cosmetics, Darrow et Elgydium. Notre activité Medical Care couvre 5 domaines thérapeutiques principaux : l’oncologie, la dermatologie, les maladies rares, les maladies chroniques et la santé familiale. En nous rejoignant, vous intégrez une entreprise riche de sens, où la dimension humaine est essentielle. Vous devenez acteur du « We Care Movement », un mouvement qui valorise l'excellence et l'innovation au sein d'équipes passionnées. Ensemble, nous repoussons les limites de la science pour unir santé et beauté au bénéfice de tous, car à chaque fois que nous prenons soin d’une seule personne, nous rendons le monde meilleur.