Scène

Université de La Rochelle; La Tremblade; On-site; EUR 7,800 - 12,000; Part time

Job summary

L'Université de La Rochelle propose un stage de Master 2 sur l’évaluation de l’état de santé de l’huître creuse M. gigas, à La Tremblade, pour une durée de six mois (janvier 2027 – juin 2027).

Le projet vise à caractériser les contaminants, tester des traitements de l’eau et étudier l’état physiologique des mollusques. Le candidat réalisera des enregistrements de signaux biologiques (respiration, filtration, ECG, métabolisme) et analysera les données statistiques pour définir des valeurs de

Qualifications

• Connaissances en biologie et écologie marines.
• Maîtrise de l’anglais.
• Connaissance des règles de sécurité et des bonnes pratiques en laboratoire.
• Réaliser des manipulations expérimentales (biochimie et physiologie) en suivant un protocole établi.
• Connaissance en analyses statistiques et dans l’utilisation d’un logiciel statistique (R/RStudio ou équivalent)

Responsibilities

• Réaliser des enregistrements de signaux biologiques (respiration, filtration, ECG, respiration mitochondriale, métabolisme).
• Analyser les données et effectuer un traitement statistique combiné.
• Évaluer l’impact d’un stress thermique sur les fonctions physiologiques.
• Travailler au sein des équipes AMARE et EMA/Ifremer et assurer le reporting.

Skills

Biologie marine

Maîtrise de l’anglais

Manipulations expérimentales

Analyse statistique

Education

Master 2 en biologie/écologie marine

Tools

R/RStudio

Job description

Intitulé du projet : Evaluation de l’état de santé de l’huître creuse M. gigas

Type de contrat : stage de Master 2

Durée : 6 mois (janv 2027 - juin 2027) – 26 semaines

Les enjeux liés à la qualité de l’eau sont au cœur des problématiques de l’activité aquacole, dans la mesure où la qualité physico-chimique et biologique de l’eau conditionne la biologie des espèces aquacoles. Dans ce contexte, il apparait essentiel de mieux comprendre les conséquences des variations de la qualité de l’eau sur leur santé et leur survie. Ce stage de Master 2 s’inscrit dans un projet plus large visant à améliorer par différentes techniques le traitement de l’eau alimentant, en particulier, un secteur de la production aquacole : les écloseries. Le projet dans lequel s’inscrit le stage de Master 2 a pour objectif 1). de caractériser les contaminants présents dans l’eau utilisée pour les élevages, 2). d’utiliser différents traitements de cette eau afin d’éliminer ces contaminants et 3). de tester leur efficacité en s’intéressant à l’état de santé de différents mollusques bivalves.

Le stage de Master concerne le point 3 de ce projet

et vise à développer une approche intégrée afin d’étudier de manière coordonnée différentes fonctions physiologiques (performance cardiaque, filtration et métabolisme) d’un modèle d’intérêt, ici l’huître creuse, et ce à différentes échelles. Le but est de définir des valeurs de référence à partir de différents signaux biologiques enregistrés. L’analyse combinée de ces valeurs permettra de qualifier l’état de santé des organismes. La méthodologie pourra ensuite être appliquée à des organismesstabulés dans de l’eau ayant subi différents traitements.

Plus précisément, dans le cadre du stage de M2, l’objectif premier sera de déterminer des valeurs de référence et leurs intervalles dans des conditions environnementales qualifiées de stables et non contraignantes. Pour cela, des enregistrements de signaux biologiques propres à chaque fonction seront effectués chez le modèle d’intérêt :

• respiration et filtration ; mesure à l’échelle individuelle,
• électrocardiogramme : participation à la mise au point ; mesure à l’échelle individuelle,
• mesure de la respiration mitochondriale
• dosages biochimiques en lien avec le métabolisme.

Dans un 2nd temps, pour tester notre approche, nous chercherons à mieux comprendre l’impact d’un évènement qualifié de stressant, donc contraignant du point de vue physiologique, sur ces fonctions. Pour cela, nous proposons de soumettre les individus étudiés à des augmentations aigües et/ou chroniques de la température de l’eau, simulant des vagues de chaleur. Les mesures réalisées précédemment seront à nouveau effectuées. L’ensemble des données fera l’objet d’un traitement statistique combiné.

Compétences requises :

• Connaissances en biologie et écologie marines.
• Maîtrise de l’anglais
• Connaissance des règles de sécurité et des bonnes pratiques en laboratoire – savoir les appliquer.
• Réaliser des manipulations expérimentales (biochimie et physiologie) en suivant un protocole établi.
• Connaissance en analyses statistiques et dans l’utilisation d’un logiciel statistique (R/RStudio ou équivalent)

Responsables du stage : Cyrile FRANCOIS & Nathalie IMBERT AUVRAY

L’encadrement sera assuré scientifique par Cyrile FRANCOIS, Elisa THORAL, Valérie Huet et Nathalie IMBERT AUVRAY selon les techniques mises en œuvre.

Le candidat travaillera au sein :

• de l’équipe AMARE du laboratoire LIENSs qui est une Unité́ Mixte de Recherche (CNRS/La Rochelle Université)
• du laboratoire EMA, Ifremer La Tremblade

Le lieu de stage privilégié sera le laboratoire d’Ifremer La Tremblade (Lab. EMA) mais certaines expérimentations pourront se dérouler au LIENSs (à discuter).