Postdoc en Microbiologie Évolutive et Bioinformatique

Pégase - Pôle pilote de formation des enseignants et de recherche pour l'éducation; La Tronche; Sur place; EUR 29 000 - 35 000; Plein temps

Résumé du poste

Le TIMC, laboratoire interdisciplinaire en biologie et santé affilié CNRS/UGA, recrute un Chercheur post-doctoral en microbiologie évolutive. Vous intégrerez l’équipe TrEE composée de biochimistes, microbiologistes et bioinformaticiens et travaillerez en collaboration avec le CHU de Grenoble sur l’évolution microbienne et la biologie computationnelle.

Ce poste en CDD de 1 an renouvelable est basé à La Tronche.

Qualifications

• Solide formation et maîtrise en bioinformatique et en analyse de séquences.
• Compétences avérées en annotation des génomes et du métabolisme.
• Maîtrise de la phylogénétique et de la génomique comparative.
• Compétences en programmation avec Python et en scripting Bash/shell.
• Maîtrise de Linux et des outils de gestion de version (Git, GitHub, GitLab).
• Connaissances sur le métabolisme procaryote et en génomique évolutive.
• Notions en machine learning appréciées.

Responsabilités

• Développer des outils d’annotation de voies métaboliques dans les génomes procaryotes.
• Proposer des prédictions pour compléter des voies de biosynthèse et des validations expérimentales.
• Étudier l’évolution du métabolisme énergétique bactérien et archéen par phylogénomique.
• Collecter les séquences de référence et cartographier les résultats sur des arbres phylogénétiques.
• Rédiger des articles et communiquer les résultats lors de conférences.

Connaissances

Bioinformatique

Annotation génomes

Métabolisme procaryote

Phylogénétique

Génomique comparative

Python

Bash/Shell

Linux

Git

Machine learning

Formation

Doctorat en bioinformatique

Outils

GitHub

GitLab

Cluster Linux

Description du poste

Le TIMC, laboratoire interdisciplinaire en biologie et santé affilié CNRS/UGA, recrute un Chercheur post-doctoral en microbiologie évolutive. Vous intégrerez l’équipe TrEE composée de biochimistes, microbiologistes et bioinformaticiens et travaillerez en collaboration avec le CHU de Grenoble sur l’évolution microbienne et la biologie computationnelle.

Ce poste en CDD de 1 an renouvelable est basé à La Tronche.