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INRAE; Narbonne; Sur place; EUR 35 000 - 55 000; Plein temps

Résumé du poste

Un établissement de recherche de premier plan recherche un expert en microbiologie pour rejoindre une équipe dynamique à Narbonne. Ce poste implique la gestion de microcosmes pour étudier la dissémination de l'antibiorésistance dans l'environnement. Les candidats doivent posséder un doctorat en microbiologie ou écologie microbienne, avec des compétences en extraction d'ADN, qPCR et bioinformatique. En plus d'un environnement de travail moderne, l'institut offre des avantages tels que 30 jours de congés, un soutien à la parentalité et des horaires flexibles. Rejoignez une équipe engagée à développer des solutions durables et innovantes dans le domaine des biotechnologies environnementales.

Prestations

30 jours de congés

Soutien à la parentalité

Restauration

Horaires flexibles

Installations sportives

Environnement agréable

Qualifications

• Doctorat requis en microbiologie ou écologie microbienne.
• Compétences en extraction d’ADN et bioinformatique souhaitées.

Responsabilités

• Suivre les microcosmes et réaliser des prélèvements et analyses.
• Quantifier les gènes de résistance et analyser les données.

Connaissances

Microbiologie

Écologie microbienne

Culture bactérienne

Extraction d’ADN

qPCR

Bioinformatique

Analyses statistiques

Séquençage 16S

Anglais

Formation

Doctorat en microbiologie

Doctorat en écologie microbienne

Outils

R

Description du poste

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres en France. INRAE se positionne parmi les leaders mondiaux en sciences agricoles, alimentaires, végétales et animales. Ses recherches visent à développer des solutions pour une agriculture performante, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources.

Environnement de travail, missions et activités

Présentation du LBE

Le Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement (LBE), situé à Narbonne, est une unité de recherche du centre Occitanie-Montpellier de l’INRAE. Il se concentre sur le développement du concept de bioraffinerie environnementale, valorisant résidus, déchets, effluents organiques et biomasses en produits industriels tout en minimisant l’impact environnemental et sanitaire. Les recherches couvrent microbiologie, écologie microbienne, génie biologique, génie des procédés, modélisation, automatique et transfert industriel. Le laboratoire dispose de 4757 m² d’espace, dont 1882 m² de halle expérimentale, et d’équipements scientifiques avancés.

Contexte scientifique

Ce poste s’inscrit dans le projet ATBR-SOL, financé par l’ANSES, qui étudie la dissémination de l’antibiorésistance lors du retour au sol de produits résiduaires organiques. L’objectif est de comprendre comment la gestion de ces produits influence la présence et la transmission de gènes de résistance dans l’environnement, en étudiant notamment l’impact de l’historique d’amendement du sol, la microbiologie du digestat, et la dynamique de transfert de gènes.

Missions et activités

Vous serez responsable de l’étude des points i à iii, utilisant des stratégies en microcosmes de sol :

• Mettre en route et suivre les microcosmes, réaliser des prélèvements et analyses.
• Quantifier les gènes de résistance et éléments mobiles, caractériser la diversité microbienne.
• Analyser les données pour comprendre la prévalence et la dissémination de l’antibiorésistance.
• Étudier la coalescence microbienne entre digestat et sol.

Une partie des expérimentations se déroulera à Toulouse au CRBE, dans l’équipe « Ecotoxicologie intégrative », et le reste à Narbonne, en collaboration avec l’unité INTHERES.

Formations et compétences recherchées

- Doctorat en microbiologie ou écologie microbienne.

- Compétences en écologie microbienne, culture bactérienne, extraction d’ADN, qPCR, bioinformatique, analyses statistiques, séquençage 16S sous R. La connaissance de l’écosystème sol est un plus.

- Aptitudes : autonomie, esprit d’initiative, organisation, travail en équipe, bon niveau d’anglais, capacités rédactionnelles.

Votre qualité de vie à INRAE

- Environnement équipé des dernières technologies en biotechnologie environnementale, avec accès partagé aux installations.

- Mentorat, formation continue, collaboration avec une équipe dynamique, possibilités de développement professionnel, participation à des ateliers et séminaires.

- Conditions de travail avantageuses : 30 jours de congés, soutien à la parentalité, restauration, horaires flexibles, installations sportives, environnement agréable.

Les agents d’INRAE sont soumis au Code de la fonction publique, notamment en matière de neutralité et de laïcité. Plus d’informations : site fonction publique.gouv.fr