Ingénieur Modélisation Métabolique – Cyanobactéries Marines

Université de Nantes

Nantes

On-site

EUR 42,000 - 56,000

Full time

14 days+

Get a reply from this employer

Your resume and cover letter, tailored to exactly what they’re hiring for.

Get past ATS filters

Job summary

L'équipe ComBi du LS2N à Nantes recrute un ingénieur(e) en modélisation de processus biologiques pour reconstruire et valider des métaboliques à l'échelle du génome des cyanobactéries et modéliser leur métabolisme et leurs interactions avec l'environnement.

Vous collecterez et annoterez des données génomiques (KEGG, MetaCyc, UniProt), identifierez les réactions et gènes, puis construirez les réseaux métaboliques avec RAVEN, CarveMe ou COBRApy et intégrerez ces GEMs dans des analyses FBA/FVA afin

Qualifications

Diplôme Bac+5 ingénieur(e) généraliste avec compétence en biologie numérique et environnement marin.
Expérience en modélisation métabolique et analyse de réseaux.
Maîtrise des outils de reconstruction et de simulation (FBA/FVA) apprécié.

Responsibilities

Reconstituer et valider des métodés métaboliques à l'échelle du génome pour des cyanobactéries.
Collecter et annoter les données génomiques à partir de bases de référence (KEGG, MetaCyc, UniProt) et identifier les réactions et gènes.
Construire les réseaux métaboliques avec outils dédiés (RAVEN, CarveMe, COBRApy) et vérifier la cohérence.
Intégrer ces métédés dans des analyses de flux (FBA, FVA) pour simuler le comportement métabolique.
Présenter les résultats à la communauté scientifique et documenter les modèles.
Participer à la diffusion et à la veille méthodologique sur les outils de reconstruction.