Ingénieur.e modélisation et data / construction de jumeaux numériques cardiovasculaires

INRIA; Palaiseau; Sur place; EUR 35 000 - 55 000; Plein temps

Résumé du poste

Une équipe innovante recherche un ingénieur pour développer des jumeaux numériques en médecine, axés sur le monitorage cardiovasculaire. Ce poste offre l'opportunité de travailler sur des projets pluridisciplinaires, en collaboration avec des professionnels de santé, tout en améliorant des outils existants en Python. Vous contribuerez à des avancées significatives dans le domaine de l'anesthésie-réanimation, avec la possibilité de télétravail et des congés généreux. Rejoignez une mission passionnante qui allie technologie et santé pour un impact réel sur les soins médicaux.

Prestations

Restauration subventionnée

Transports publics remboursés partiellement

7 semaines de congés annuels

10 jours de RTT

Possibilité de télétravail

Équipements professionnels à disposition

Prestations sociales, culturelles et sportives

Qualifications

• Motivation pour le travail pluridisciplinaire et apprentissage.
• Expérience en développement Python et simulation numérique.

Responsabilités

• Développer des outils pour les jumeaux numériques en santé.
• Interaction avec les médecins pour définir les besoins.

Connaissances

Python

Mathématiques appliquées

Modélisation

Simulation numérique

Outils de manipulation de données

Conduite de projet

Capacité à rédiger et présenter

Formation

Diplôme en ingénierie ou en sciences

Outils

Pandas

ToolboxDigitalTwin

Description du poste

L'équipe-projet M3DISIM développe depuis une vingtaine d'années des modèles mathématiques et biomécaniques du coeur et du système cardiovasculaire, et des méthodes de simulation numérique adaptées à ces modèles. Les modèles en question sont de différents types, allant des équations aux dérivées partielles en 3D pour les plus fins, à des versions simplifiées sous forme de systèmes d'équations aux dérivées ordinaires, dits "modèles 0D".

Les modèles 0D permettent des simulations numériques très rapides - potentiellement en temps réel - tout en rendant compte des "aspects systèmes" des modèles cardiovasculaires, c'est à dire des couplages entre les différentes composantes du système cardiovasculaire (coeur, artères, veines, voire poumons, etc.). L'équipe développe notamment des applications de monitorage cardiovasculaire augmenté fondées sur des "jumeaux numériques", en particulier pour l'anesthésie-réanimation, qui exploitent de tels modèles.

Dans le cadre du projet i-Démo intitulé "MediTwin" qui vise à développer des méthodes permettant de construire des jumeaux numériques en médecine, avec diverses applications sur lesquelles ces méthodes donneront lieu à des preuves de concept, l'équipe M3DISIM est responsable d'une tâche visant à développer une bibliothèque logicielle permettant la simulation numérique de modèles simplifiés du système cardiovasculaire, et de tester cette bibliothèque sur un cas d'usage correspondant à une application clinique. Le cas d'usage choisi ici concernera le monitorage cardiovasculaire en anesthésie-réanimation.

Mission confiée

L'ingénieur.e recruté.e, pour une durée de 6 mois , aura un rôle mixte entre ingénieur.e modélisation et ingénieur.e data. Elle ou il aura pour mission développer des outils utiles à lamise en œuvre de jumeaux numériques du système cardiovasculaire et cardiopulmonaire pour le monitorage augmenté en anesthésie-réanimation. La personne recrutée sera rattachée à l'équipe M3DISIM du centre Inria de Saclay et travaillera en collaboration avec le département d'anesthésie-réanimation de l'hôpital Lariboisière (AP-HP).

Les principales missions seront les suivantes :

• Constitution d'une base de données adaptées à la validation des jumeaux numériques, à partir d'une analyse des données disponibles à l'hôpital Lariboisière.
• Amélioration d'un outil pré-existant en Python, nommé ToolboxDigitalTwin, pour permettre à des médecins de mettre en oeuvre les outils de monitorage augmenté à base de jumeau numérique du système cardiovasculaire / cardiopulmonaire. L'usage prévu est de permettre aux médecins de construire les jumeaux numériques afin de réaliser des étapes de leur validation clinique. En particulier, ces outils seront utilisés pour réaliser les objectifs du projet MediTwin. Dans un second temps, ils pourront également être diffusés à d'autres médecins partenaires (dans le département d'anesthésie-réanimation ou à l'extérieur) pour leur projet de recherche où le jumeau numérique n'est pas l'objet de l'étude mais un moyen.

Principales activités

• Interaction avec les médecins du département d'anesthésie-réanimation pour la définition de leurs besoins.
• Développement de la bibliothèque ToolboxDigitalTwin en Python.
• Mise en place de tests unitaires, de tests d’intégration et de tests fonctionnels dans une démarche d'intégration continue pour les codes développés.
• Rédaction et présentation de documentation.
• Réalisation de tutoriels.

Compétences

• Motivation pour le travail sur un projet pluridisciplinaire et pour se former sur les axes du projet où les compétences seraient moins solides.
• Mathématiques appliquées, modélisation, simulation numérique.
• Outils de manipulation de données (e.g. Pandas).
• Experience en développement Python.
• Expérience de développement souhaitable dans le champ de la simulation numérique.
• Connaissances en développement logiciel souhaitables : architecture logicielle et paradigmes de programmation, génie logiciel, bonnes pratiques et outils de développement logiciel (versioning, documentation, packaging, CI, CD …).
• Aptitude à la conduite de projet.
• Capacité à rédiger, à publier et à présenter, en français voire en anglais.
• Capacité à comprendre les contextes et besoins scientifiques, et à les traduire dans des implémentations technologiques.
• Appétence pour le travail dans le domaine de la santé et en interaction avec des personnels soignants.
• Savoir être : ouverture d'esprit, goût pour le travail en équipe.
• Restauration subventionnée
• Transports publics remboursés partiellement
• Congés : 7 semaines de congés annuels + 10 jours de RTT (base temps plein) + possibilité d'autorisations d'absence exceptionnelle (ex : enfants malades, déménagement)
• Possibilité de télétravail et aménagement du temps de travail
• Équipements professionnels à disposition (visioconférence, prêts de matériels informatiques, etc.)
• Prestations sociales, culturelles et sportives (Association de gestion des œuvres sociales d'Inria)