Ingénieur·e en production, traitement et analyse de données

Université de Lille; Hauts-de-France; Sur place; EUR 35 000 - 55 000; Plein temps

Résumé du poste

L'Université de Lille recherche un ingénieur·e en production, traitement et analyse de données pour rejoindre sa plateforme de bioinformatique. Le poste implique l'encadrement technique d'ingénieurs juniors et la gestion de projets d'analyse de données au service de la recherche en biologie et santé. Une expertise en bioinformatique et une bonne maîtrise de la programmation en environnement Linux sont nécessaires. Télétravail partiel possible.

Qualifications

• Expertise en bioinformatique pour l’analyse de données avec au moins 24 mois d’expérience.
• Capacité à interagir avec divers profils (biologistes, bioinformaticiens).
• Anglais technique (B2) requis.

Responsabilités

• Encadrer les projets d’analyse de données biologiques réalisés par une équipe d’ingénieurs.
• Participer à la rédaction de projets collaboratifs et à l'organisation de la plateforme.
• Assurer la veille scientifique et technologique dans son domaine.

Connaissances

Bioinformatique

Programmation (Python, R, bash)

Gestion de projets

Communication

Analyse de données

Formation

Master/diplôme d'ingénieur en bioinformatique ou doctorat en biologie

Outils

Nextflow

Snakemake

Conda

Docker

RMarkdown

Description du poste

Ingénieur·e en production, traitement et analyse de données

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• Fonction publique : Fonction publique de l'État
• Employeur : Université de Lille
  Université de LilleFaculté des Sciences et TechnologiesAv. Paul Langevin Bâtiment A18, 59650 Villeneuve-d'Ascq
• Localisation : Av. Paul Langevin Bâtiment A18, 59650 Villeneuve-d'Ascq

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• Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
• Nature du contrat

  CDD de 3 ans

• Expérience souhaitée Non renseigné
Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels Non renseignée Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
• Catégorie Catégorie A+ (Encadrement supérieur - Emplois de direction)
• Management Non renseigné
• Télétravail possible Non renseigné

Contribuer à l'activité de la plateforme de bioinformatique Bilille principalement au travers de l'encadrement technique et scientifique d'ingénieurs juniors pour la réalisation de projets d'analyse de données au service des unités de recherche en Biologie et Santé de la métropole Lilloise. Contribuer au développement de la plateforme : montage de projets, veille scientifique/technologique et conception des offres de formation en lien avec l’Institut Français de Bioinformatique (IFB).

Activités principales :

- Conduire et encadrer les projets d’analyse de données biologiques (génomique, transcriptomique, protéomique, ...) réalisés par 3 à 4 ingénieurs d’étude présents sur la plateforme

- Participer au montage et à la rédaction de projets collaboratifs

- Contribuer à l’organisation de la plateforme et à son développement

- Assurer et organiser la veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité

Activités associées :

- S’investir dans le travail collectif de la plateforme (formation, animation)

- Contribuer à l’activité de développement de ressources originales (packages, logiciels, workflows) au service de la communauté de recherche en biologie et santé, à l’échelle locale, nationale et internationale

- Assurer le support aux utilisateurs pour l’utilisation des ressources HPC (cloud, cluster...).

Profil recherché

Compétences attendues et savoir-faire opérationnels :

- Expertise dans le choix et l’utilisation des approches de bioinformatique pour l’analyse de données

- Maîtrise de la programmation dans un environnement Linux (Python, R, bash)

- Bonnes pratiques d’analyse et de reproductibilité (Nextflow, Snakemake, Conda, Docker, RMarkdown, ...)

- Notions avancées en biologie (biologie moléculaire et cellulaire, génomique et génétique)

- Interaction avec des profils variés (biologistes, bioinformaticiens, biostatisticiens)

- Capacité d’encadrement et de gestion de projets

- Anglais technique (B2)

Spécificités et environnement du poste :

La personne recrutée sera amenée à travailler sur les 3 sites d’implantation de Bilille (accessibles facilement par les transports en commun). Réalisation d’un à deux jours de télétravail par semaine possible.

master/diplôme d’ingénieur en bioinformatique ou doctorat en biologie avec une forte composante en bioinformatique

Au moins 24 mois d’expérience réussie en encadrement d’équipe

Niveau d'études minimum requis

• Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents

Localisation

Localisation : Av. Paul Langevin Bâtiment A18, 59650 Villeneuve-d'Ascq

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Qui sommes-nous?

Ambitieuse et innovante, l'Université de Lille réunit facultés, instituts et écoles de renom.
Notre objectif : Construire une université internationale, rayonnante et attractive, ancrée dans son territoire et moteur du développement économique et socio-culturel.
Faire le choix de l’Université de Lille, c’est rejoindre une communauté résolument tournée vers l’avenir et engagée pour l’excellence académique.

Descriptif du service

Merci de déposer votre candidature : https://univ-lille.nous-recrutons.fr/poste/bl3xrsw3ft-ingenieur-e-biologiste-en-analyse-de-donnees/

- Rotation des ingénieurs sur les 3 sites lillois: Cité scientifique, Campus santé et Campus pasteur.
- Travail prolongé sur écran, avec risques associés (vision, posture, isolement).
- Obligation de respecter le secret professionnel et les contraintes de calendrier (Charge de travail variable) liés aux projets.

Vacant à partir du 06/01/2025

Experte / Expert en production, traitement et analyse de données

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