Ingénieur-e en calcul scientifique (H/F)

INSERM CIML; Marseille; Sur place; EUR 60 000 - 80 000; Plein temps

Résumé du poste

Un institut de recherche scientifique à Marseille recherche un Ingénieur-e en calcul scientifique pour analyser des données de transcriptomes. Le candidat idéal travaillera en collaboration dans un environnement dynamique et participera à des projets de recherche innovants. Ce poste proposé sous un contrat CDD de 12 mois comporte un salaire brut mensuel de 2494,3 Euros.

Qualifications

• Débutant accepté.
• Rigueur et précision nécessaires.
• Capacité à travailler en équipe.

Responsabilités

• Analyse des données Single-Cell RNA-seq et bulk RNAseq.
• Établissement de rapports d'analyse clairs.
• Communication scientifique interne et externe.

Connaissances

Analyser, exploiter, structurer des données

Déterminer et développer les méthodes de recherche

Relever, contrôler, ajuster des mesures et dosages

Description du poste

Offre n° 196RXDN
Ingénieur-e en calcul scientifique (H/F)

Le projet consiste à comprendre le rôle des cellules localisées à la surface du cerveau (cellules méningées) dans la protection du cerveau (neuroinfection) et la croissance/fonction du cerveau (neurocognition et maladie neurodevelopmentale). Nous combinons des data single cell RNAseq publiques et de l'équipe (cellules méningées et cérérales) pour comprendre leurs pathways d'activation, leurs interactions potentielles, et leur lien avec des pathologies connues (susceptibilité aux infections, autisme, épilepsie, migraine, etc.) Vous aurez la charge des analyses de données de transcriptomes en Singlecell RNA-seq, bulk RNAseq et spatial transcriptomique en coordination avec le CB2M (Computational Biology, Biostatistics and Modeling) du CIML. Vous devrez établir des protocoles d'analyse adaptés, produire des rapports d'analyse clairs et détaillés et les communiquer à votre équipe.Activités principales- Intégration au projet de recherche cité, assimilation des questions biologiques posées et mise au point un plan d'analyse bio-informatique adapté.- Analyse des données Single-Cell RNA-seq et bulk RNAseq du projet (Analyse en réduction de dimensionnalité (ACP, t-SNE), expression différentielle, enrichissement fonctionnel, étude d'hétérogénéité cellulaire, dynamique, cell-cell communication...).- Communication scientifique interne et externe. Mise en forme des résultats pour publications scientifiques.Activités associées- Communication scientifique interne et externe.- Participation aux lab meeting de son équipe- Participation aux rencontres et aux échanges de la communauté des bioinformaticiens du centre.

Type de contrat CDD - 12 Mois
Contrat travail Durée du travail 38H30/semaineTravail en journée
Salaire

• Salaire brut : Mensuel de 2494.3 Euros sur 12.0 mois

Profil souhaité

Expérience

• Débutant accepté

Compétences

• Analyser, exploiter, structurer des données
• Déterminer et développer les méthodes de recherche, de recueil et d'analyse de données
• Relever, contrôler, ajuster des mesures et dosages

Savoir-être professionnels

• Avoir l'esprit d'équipe
• Organiser son travail selon les priorités et les objectifs
• Faire preuve de rigueur et de précision

Informations complémentaires

• Qualification : Employé qualifié
• Secteur d'activité : Recherche-développement en autres sciences physiques et naturelles

Employeur

50 à 99 salariés

Créé en 1964, l Inserm est un établissement public à caractère scientifique et technologique, placé sous la double tutelle du ministère de la Santé et du ministère de la Recherche. Dédié à la recherche biologique, médicale et à la santé humaine, il se positionne sur l ensemble du parcours allant du laboratoire de recherche au lit du patient. Sur la scène internationale, il est le partenaire des plus grandes institutions engagées dans les défis et progrès scientifiques de ces domaines.Mme Réjane RUA

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