Ingénieur.e en bioinformatique: étude du micro-environnement tumoral en contexte de myelome multiple

SFBI; Toulouse; Sur place; EUR 40 000 - 55 000; Plein temps

Résumé du poste

Une organisation de recherche positive à Toulouse recherche un Ingénieur.e en bioinformatique pour étudier le micro-environnement tumoral dans le cadre de projets sur le myélome multiple. Le candidat idéal possède un Bac+5 en bioinformatique, maîtrise R et Python, et a des connaissances en analyse de données. Les missions incluent l'analyse de données scRNAseq et la gestion du biobanking. Poste à pourvoir avant le 9 octobre 2025.

Qualifications

• Maîtrise des langages R (bioconductor, Seurat) et Python.
• Connaissances en analyse de données scRNAseq.
• Capacité à travailler en environnement UNIX.

Responsabilités

• Caractériser le micro-environnement tumoral via des analyses bioinformatiques.
• Participer à la gestion du biobanking.
• Exécuter des analyses de données scRNAseq.

Connaissances

Analyse de données scRNAseq

R

Python

Environnement UNIX

Connaissances en immunologie

Git

Formation

Bac+5/master en bioinformatique

Outils

Genotoul, HPC

Description du poste

En raison d'une opération de maintenance chez notre hébergeur, le site de la SFBI sera interrompu du 6 octobre au 8 octobre.

Ingénieur.e en bioinformatique: étude du micro-environnement tumoral en contexte de myelome multiple

scRNAseq recherche cancer myélome multiple Immunologie Analyse de données

L’équipe GENIM (Oncogénomique et Immunologie du Myélome), co-dirigée par Jill Corre et Ludovic Martinet, est basée au centre de recherche de cancérologie de Toulouse CRCT.
Nos travaux portent sur l’étude des profils génomiques et épigéntiques du compartiment immunitaire du myélome multiple.
Le/la candidat·e travaillera dans l’axe “immunologie du myélome”, en collaboration avec chercheurs et doctorants, principalement sur des projets murins.
Le but principal de ce projet de recherche serait donc de caractériser le micro-environnement tumoral via des approches bioinformatiques (principalement analyses de données scRNASeq).

• Analyse de données scRNAseq
• Demultiplexage et alignement de données
• Participation à la gestion du biobanking

Profil Recherché

Bac+5/master en bioinformatique ou équivalent
- Maîtrise de langages de programmation : R (principalement des packages bioconductor et Seurat), Python.
- Enironnement UNIX (bash)
- Connaissances en analyse de données scRNAseq
- Connaissances en immunologie
- Utilisation d’un cluster de calcul (Genotoul, HPC)
- Anglais écrit a minima
- Aprécié : Git, connaissances en statistiques
Compétences humaines:
- Rigueur, autonomie
- Bonne communication et esprit d’équipe
- Capacité à respecter les délais et ponctualité

Procédure : Envoyez les documents suivant à Ludovic Martinet ([e-mail]) et Hélène Daunes ([e-mail]) :- CV- Lettre de motivation- Relevé de notes de master, si premier emploi- Optionnel : lettre(s) de recommendation, coordonnées de référence(s) professionnelle(s)Date limite de candidature : 9 octobre 2025Prestataire s'abstenir

Offre publiée le 9 septembre 2025, affichage jusqu'au 9 octobre 2025