Ingénieur.e en Bioinformatique

SFBI; Paris; Sur place; EUR 42 000 - 60 000; Plein temps

Résumé du poste

SFBI recrute un(e) post-doctorant(e) au sein de l’équipe « mRNP et condensats » pour déterminer les perturbations post-transcriptionnelles liées à des mutations de l’hélicase DDX6 dans des cellules humaines. Vous analyserez des jeux de données RNA-seq et développerez des pipelines adaptés en collaboration avec les biologistes.

Le poste est basé au Laboratoire Développement, Adaptation et Vieillissement (UMR8263) rattaché à Sorbonne Université, sur le campus Pierre et Marie Curie.

Qualifications

• Maîtrise des outils RNA-seq : alignement, quantification, analyse différentielle, visualisation.
• Maîtrise des outils d’analyse des isoformes d’ARN.
• Expérience en analyse de transcriptome dans des modèles mammifères.
• Rigueur et autonomie dans un contexte d’équipe biologique.

Responsabilités

• Traitement et contrôle qualité des données RNA-seq.
• Analyse différentielle et fonctionnelle des données.
• Développement et optimisation de pipelines bioinformatiques.
• Comparaison avec des jeux de données publiés.
• Interprétation biologique en lien avec les biologistes de l’équipe.

Connaissances

RNA-seq outils

Analyse des isoformes

Transcriptome mammifère

Rédaction de rapports

Analyse de données

Formation

Doctorat en biologie

Outils

RNA-seq pipelines

Outils d’analyse isoformes

Description du poste

Une opération de maintenance chez notre hébergeur entrainera une interruption de service du lundi 14 au vendredi 18 septembre.

Date de prise de poste : 1 décembre 2026

Mission

Intégrée à une équipe de recherche, la personne recrutée aura pour mission principale de déterminer les perturbations post-transcriptionnelles induites par des mutations dans l’hélicase DDX6 dans les cellules humaines. Elle analysera des jeux de données RNAseq obtenus à partir d’ARN total et polysomal pour identifier les transcrits dérégulés au niveau stabilité et/ou traduction, déterminer les caractéristiques de ces ARN, et proposer les voies de régulation perturbées.

Activités

• Traitement et contrôle qualité des données RNA-seq
• Analyse différentielle et fonctionnelle
• Développement et optimisation de pipelines
• Comparaison avec des jeux de données publiés
• Interprétation biologique en lien avec les biologistes de l’équipe

Compétences attendues

• Maîtrise des outils RNAseq : alignement, quantification, analyse différentielle, visualisation
• Maîtrise des outils d’analyse des isoformes d’ARN
• Expérience en analyse de transcriptome dans des modèles mammifères
• Expérience en analyse des isoformes dans des modèles mammifères
• Rigueur, autonomie, dynamisme, esprit d’initiative.
• Rédaction de rapports clairs, présentation des résultats à des non-bioinformaticiens

Contexte de travail

La personne recrutée exercera son activité dans l’équipe « mRNP et condensats » dirigée par Dominique Weil, au Laboratoire Développement, Adaptation et Vieillissement (UMR8263, unité mixte CNRS-Inserm-Sorbonne Université) à l’Institut de Biologie Paris Seine (IBPS). Ce laboratoire est situé sur le campus Pierre et Marie Curie de Sorbonne Université.

Le poste est financé par l’ANR dans le cadre d’un projet visant à comprendre le rôle de l’hélicase DDX6 et de condensats d’ARN et protéines (P-bodies) dans le neurodéveloppement. Des mutations de cette hélicase sont responsables d’une maladie neurodéveloppementale associée à un déficit de P-bodies. L’équipe travaille sur des modèles de cellules humaines dans lesquelles les mutations des patients ont été introduites. Composée de biologistes, elle comprend quatre chercheuses et enseignants-chercheurs, une ingénieure d’étude, un post-doctorant et une doctorante. La personne recrutée travaillera en collaboration étroite avec le post-doctorant et les chercheurs associés à cet axe de recherche.

Offre publiée le 9 septembre 2026, affichage jusqu'au 30 octobre 2026