Ingénieur(e) biologiste en traitement de données

Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement (INRAE); Provence-Alpes-Côte d'Azur; Hybride; EUR 30 000 - 50 000; Plein temps

Résumé du poste

Une organisation de recherche de premier plan cherche un ingénieur biologiste pour traiter des données liées à la résilience des vergers fruitiers. Vous serez impliqué dans des projets innovants visant à identifier des variétés plus durables face aux défis environnementaux. Ce poste offre l'opportunité de travailler avec une équipe multidisciplinaire, d'utiliser des outils statistiques avancés et de contribuer à des recherches essentielles pour l'agriculture durable. Si vous êtes passionné par la biologie et l'analyse de données, cette position pourrait être votre prochaine grande aventure professionnelle.

Qualifications

• Connaissances requises en biologie et production végétale.
• Capacité à travailler de manière autonome et en équipe.

Responsabilités

• Collecte, gestion et analyse des données sur le serveur INRAE.
• Traitement des données en langage R pour analyses statistiques.

Connaissances

Analyse de données

Statistiques descriptives

Génétique d'association (GWAS)

Biologie végétale

Travail en équipe

Rigueur et organisation

Formation

Licence ou Master en statistiques

Diplôme en bio-informatique

Diplôme en génétique quantitative

Outils

R

Description du poste

Ingénieur(e) biologiste en traitement de données

Veuillez pour partager sur Facebook, Twitter et LinkedIn.

• Fonction publique : Fonction publique de l'État
• Employeur : Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement (INRAE)
  INRAE Centre Provence-Alpes-Côte d'Azur - Unité Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes (GAFL)
• Localisation : Domaine Saint Maurice : 67 Allée des chênes, CS 60094-84143 Montfavet cedex

• Nature de l’emploi : Emploi ouvert uniquement aux contractuels
• Nature du contrat : CDD d'1 an
• Expérience souhaitée : Débutant
• Rémunération : Fourchette indicative pour les contractuels Non renseignée, Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
• Catégorie : Catégorie A (cadre)
• Management : Non renseigné
• Télétravail possible : Oui

Dans un contexte de réduction du parapluie phytosanitaire imposé par l’union européenne, il devient urgent d’identifier des résistances ou tolérances aux différents bioagresseurs dommageables à la production fruitière, des variétés mieux adaptées à leur environnement et plus résilientes pour construire des vergers plus durables. L’équipe DADI coordonne deux projets dans lesquels vous serez directement impliqué-e:

• Le projet CASDAR RésiDiv : Il vise à identifier les différentes composantes de la résilience des vergers fruitiers en conditions de basse protection phytosanitaire pour aider la création variétale. Il ambitionne également d’identifier des individus résilients en conditions de ‘zéro pesticides’ qui permettront de construire les variétés nécessaires à des vergers plus durables.

Les travaux menés dans le cadre de ces projets reposent sur deux dispositifs expérimentaux chez l’abricotier et le pêcher appelés «core-collections», qui sont constitués d’un assemblage d’accessions (150 accessions et 206 individus respectivement) et dont les données de génotypage sont disponibles.

• Vous exercerez vos missions d’ingénieur·e d’études au sein de l’équipe Prunus (11 permanents) du GAFL
• Vous serez encadré·e par les responsables des projets de recherche (2 chercheurs et un ingénieur)
• Vous serez mobilisé·e sur la collecte, le stockage, la gestion des données sur le serveur INRAE et la mise en forme des données de phénotypage pour la préparation des analyses statistiques
• Vous prendrez en charge le traitement des données dans le langage R pour mettre en œuvre des statistiques descriptives et des modèles statistiques pour l’étude de la relation génotype-phénotype, notamment via la génétique d’association (GWAS)
• Vous serez en lien avec l’équipe informatique, bio-analyses et biostatistiques de l’unité
• Vous participerez ponctuellement à la caractérisation phénotypique des core collections en vergers pour venir en appui aux techniciens de l’équipe
• Vous rendrez compte régulièrement de l’avancée de vos résultats aux responsables de projets
• Vous participerez aux réunions de projets et vous serez amené·e à présenter vos résultats

Vous serez impliqué·e dans la logistique des projets : organisation des meetings, reporting des réunions, interactions avec les partenaires, compilation des documents, rédaction des rapports…

Vous participerez aux réunions bimensuelles d’équipe.

Profil recherché

Licence ou Master dans le domaine de formation souhaité : statistiques, bio-statistiques, bio-analyses, bio-informatique, génétique quantitative.

• Connaissances de bases requises en biologie et production végétale
• Rigueur et organisation pour la manipulation et l’analyse de données
• Faculté à travailler en équipe et de manière autonome
• Interagir au quotidien avec les responsables des projets
• Interagir avec de multiples interlocuteurs de diverses disciplines (généticiens, bio-informaticiens, chercheurs, ingénieurs et techniciens) et horizons (instituts techniques et sélectionneurs, partenaires des projets français et européens)
• Garantir la qualité et la pertinence des outils d'analyse et des résultats
• Transmettre des résultats sous forme de compte-rendu et de présentation orale
• Anglais écrit et parlé nécessaire

Niveau d'études minimum requis

• Niveau : Niveau 7 Master/diplômes équivalents
• Spécialisation : Chimie-biologie, biochimie, Mathématiques, Sciences de la vie

Localisation

Localisation : INRAE GAFL, Avignon

Éléments de candidature

Documents à transmettre

Pour postuler à cette offre, l'envoi du CV et d'une lettre de motivation est obligatoire.

Personnes à contacter

Qui sommes-nous?

Premier organisme de recherche spécialisé au monde en agriculture, alimentation et environnement, INRAE est né le 1er janvier 2020 de la fusion entre l’INRA et IRSTEA. Nous sommes une communauté de travail de 12 000 personnes, avec plus de 200 unités de recherche et une quarantaine d’unités expérimentales implantées dans 18 centres sur toute la France.

Notre Mission?

Face à l’augmentation de la population, au changement climatique, à la raréfaction des ressources et au déclin de la biodiversité, INRAE construit des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources.

Rejoignez une communauté engagée et agissez pour l’intérêt général !

Descriptif du service

L'unité GAFL (Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes) du centre d’Avignon développe des recherches dont l’objectif est de contribuer à la transition écologique et de répondre aux enjeux d’adaptation des systèmes horticoles à la réduction des intrants de synthèse et au changement climatique. Il s’agit de faire de la diversité génétique un levier pertinent et efficace pour accroître la capacité des fruits et légumes et de maintenir une production de qualité face aux stress biotiques et abiotiques dans des systèmes agroécologiques, en synergie avec des leviers techniques complémentaires issus des autres disciplines. La stratégie consiste à i) cibler les caractères primordiaux d'adaptation aux stress biotiques et abiotiques, ii) identifier des sources de résistance, iii) comprendre la fonction des déterminants de résistance dans les interactions plantes × bioagresseurs × environnement pour raisonner les associations de gènes et QTL de façon à protéger ces résistances et assurer leur durabilité.

Plus d'informations ici : https://jobs.inrae.fr/ot-25745

Susceptible d'être vacant à partir du 01/07/2025

Experte / Expert en production, traitement et analyse de données