Ingénieur Data: Analyse et Automatisation d’Images — Paris

France - BioImaging; Paris; Sur place; EUR 26 000 - 31 000; Plein temps

Résumé du poste

France-BioImaging recherche un ingénieur en analyse et traitement d’images pour rejoindre la plateforme FBI à Paris. Vous analyserez et traiterez des images 2D/3D/4D, développerez des plugins dans ImageJ/Fiji et Python, et créerez des workflows reproductibles adaptés à des problématiques biologiques.

Vous rédigerez des tutoriels, accompagnerez les utilisateurs et assurerez une veille technologique sur les outils open-source et les standards de données.

Qualifications

• Expérience en analyse d’images 2D/3D/4D et traitement de données.
• Capacité à développer des plugins et macros dans des outils d’imagerie.
• Maîtrise de Python et au moins d’un autre langage scientifique.
• Connaissance des workflows reproductibles et documentés.
• Bonnes compétences pédagogiques et d’assistance aux utilisateurs.
• Connaissance des formats et bases de données d’images (OMERO est un plus).
• Autonomie, rigueur et esprit analytique en biologie cellulaire.

Responsabilités

• Identifier et analyser les besoins en analyse d’images via enquêtes et groupes de travail.
• Développer et tester des plugins dans ImageJ/Fiji et Python.
• Créer des workflows complets répondant à des problématiques biologiques.
• Rédiger notes techniques, tutoriels et documentations.
• Conseiller les utilisateurs sur outils et limites des approches.
• Former étudiants et chercheurs via cours et workshops.
• Concevoir des outils innovants d’automatisation et de smart microscopy.
• Veiller aux évolutions logiciels et standards de données.

Connaissances

Image analysis

Plugin development

Python

Java

Matlab

Workflow design

Documentation

Training

Collaboration

Formation

BAC+3/4

Outils

ImageJ/Fiji

Icy

Napari

CellProfiler

ilastik

Imaris

NIS

Description du poste

France-BioImaging recherche un ingénieur en analyse et traitement d’images pour rejoindre la plateforme FBI à Paris. Vous analyserez et traiterez des images 2D/3D/4D, développerez des plugins dans ImageJ/Fiji et Python, et créerez des workflows reproductibles adaptés à des problématiques biologiques.

Vous rédigerez des tutoriels, accompagnerez les utilisateurs et assurerez une veille technologique sur les outils open-source et les standards de données.