Ingénieur Analyse d’Images & Données — Thérapie Génique

CNRS; Montpellier; Hybrid; EUR 26,000 - 31,000; Full time

Benefits offered by this job

44 jours RTT

Prise en charge 75% transport

Mobilité durable 300€

Job summary

CNRS, à l’Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier (IGMM), recherche un(e) spécialiste en analyse d’images pour prétraitement, segmentation et quantification d’images immunohistochimiques et immunofluorescences sur tissus cérébraux. Vous développerez des workflows semi-automatissés et collaborerez avec biologistes et bioinformaticiens.

Utilisation d’ImageJ, QuPath et Python/R pour des analyses à grande échelle, avec documentation rigoureuse.

Qualifications

• Licence bac+3 avec 3 à 5 ans d'expérience en analyse d'images biologiques.
• Maîtrise des outils d’analyse d’images: Fiji/ImageJ, QuPath, Cellpose, ilastik.
• Connaissances de base en programmation scientifique: Python ou R.
• Capacité à gérer des workflows analytiques et à produire des rapports clairs et reproductibles.
• Maîtrise de l’anglais scientifique, à l’oral et à l’écrit.

Responsibilities

• Prétraitement, segmentation et quantification d’images d’immunohistochimie et immunofluorescence sur tissus cérébraux (modèles murins).
• Développement ou adaptation de workflows automatisés pour l’analyse d’images en grand volume (batch analysis).
• Contribuer à l’analyse de données transcriptomiques et spatiales en lien avec l’imagerie.
• Documentation précise des workflows et traçabilité des analyses; participation à la diffusion scientifique.
• Développement et maintenance d’applications d’analyse d’images et rédaction de la documentation utilisateur.

Skills

Maîtrise des workflows analytiques

Anglais scientifique

Documentation & reproductibilité

Python

R

Education

Licence (bac+3) en analyse d'images biologiques

Tools

Fiji/ImageJ

QuPath

Cellpose

ilastik

Python

R

Git

Job description

CNRS, à l’Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier (IGMM), recherche un(e) spécialiste en analyse d’images pour prétraitement, segmentation et quantification d’images immunohistochimiques et immunofluorescences sur tissus cérébraux. Vous développerez des workflows semi-automatissés et collaborerez avec biologistes et bioinformaticiens.

Utilisation d’ImageJ, QuPath et Python/R pour des analyses à grande échelle, avec documentation rigoureuse.