Etude des liens entre dérégulations du métabolisme et des marques épigénétiques dans la maladie[...]

CEA; Grenoble; Sur place; EUR 30 000 - 40 000; Plein temps

Résumé du poste

Une opportunité passionnante pour un doctorat dans un domaine de recherche innovant. Ce projet vise à explorer les liens complexes entre le métabolisme et les modifications épigénétiques dans la maladie de Huntington, en utilisant des modèles murins avancés. Le candidat idéal aura une solide formation en épigénétique, biochimie et protéomique, et sera impliqué dans des techniques de pointe comme la protéomique et l'analyse des modifications post-traductionnelles. Rejoignez une équipe dynamique à l'Université Grenoble Alpes et contribuez à des recherches qui pourraient avoir un impact significatif sur le développement de nouvelles thérapies.

Qualifications

• Connaissances approfondies en épigénétique et protéomique.
• Expérience avec des modèles animaux et techniques de biologie moléculaire.

Responsabilités

• Étudier les dérégulations épigénétiques dans la maladie de Huntington.
• Analyser les liens entre métabolisme et modifications post-traductionnelles.

Connaissances

épigénétique

biochimie

protéomique

Formation

Doctorat en biologie

Master en biochimie

Outils

ChIPseq

CUT&tag

Description du poste

Description du sujet de thèse

Domaine

Sciences du vivant

Sujets de thèse

Etude des liens entre dérégulations du métabolisme et des marques épigénétiques dans la maladie de Huntington

Contrat

Thèse

Description de l'offre

Notre objectif est d'étudier les dérégulations épigénétiques dans la maladie de Huntington (HD). A l'aide de modèles souris, nous appréhenderons les liens entre altérations du métabolisme énergétique et défauts épigénétiques dans les neurones striataux, afin de mieux comprendre le mécanisme de vulnérabilité striatale dans la HD et de définir un nouveau cadre pour le développement de thérapies. Nous voulons obtenir des cartes détaillées des modifications post-traductionnelles (PTMs) des histones, en particulier des méthylations, de l'acétylation et de la lactylation récemment décrite. En effet, ces PTMs sont étroitement régulées par l'état métabolique des cellules. Nous utiliserons la protéomique qui est l'approche la mieux adaptée pour identifier et quantifier les multiples PTMs des protéines. Nous envisageons de travailler sur le striatum de souris WT, transgéniques R6/1 et du modèle plus progressif Q140 knock-in à différents stades de la maladie, afin de suivre l'évolution des PTMs d'histones et du métabolisme lors du vieillissement. En outre, pour obtenir une vision dynamique des liens entre les déséquilibres métaboliques et épigénétiques dans la maladie, nous injecterons du 13C-glucose par voie intrapéritonéale à des souris HD et contrôles, et nous analyserons l'incorporation du 13C dans les PTMs d'histones en fonction du temps. Enfin, il a été démontré que l'acétyl-CoA, le précurseur de l'acétylation des lysines des histones, est produit localement dans le noyau, par l'acétyl-CoA synthétase 2 (ACSS2), l'ATP-citrate lyase (ACLY) ou le complexe pyruvate déshydrogénase. Où et par quelles enzymes le lactate est produit reste une question ouverte. L'ACSS2 est un très bon candidat, car elle peut catalyser la production de molécules d'acyl-CoA à partir des acides gras correspondants. Pour appréhender la possible production de métabolites à proximité de la chromatine dans les cellules striatales, nous obtiendrons les distributions génomiques d'ACSS2 et d'ACLY par ChIPseq/CUT&tag et les comparerons aux distributions de marques d'histones acétylées et lactylées.

Université / école doctorale

Chimie et Sciences du Vivant (EDCSV)
Université Grenoble Alpes

Localisation du sujet de thèse

Site

Grenoble

Critères candidat

Formation recommandée

épigénétique, biochimie, protéomique

Demandeur

Disponibilité du poste

01/12/2024

Personne à contacter par le candidat

PFLIEGER Delphine [e-mail]
CNRS
UA13 Inserm/CEA/Université Grenoble Alpes
EDYP/BGE/DS/IRIG
CEA de Grenoble
17 rue des Martyrs
38054 GRENOBLE cedex 09
0438782265

Tuteur / Responsable de thèse

PFLIEGER Delphine [e-mail]
CNRS
UA13 Inserm/CEA/Université Grenoble Alpes
EDYP/BGE/DS/IRIG
CEA de Grenoble
17 rue des Martyrs
38054 GRENOBLE cedex 09
0438782265

En savoir plus

https://www.edyp.fr/web/2019/10/22/integrative-omics/
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