Bio-Informaticien (H/F)

LIMAGRAIN; Chappes; Sur place; EUR 35 000 - 55 000; Plein temps

Résumé du poste

Une entreprise innovante et leader mondial dans le domaine des semences recherche un(e) Bioinformaticien(ne) passionné(e) pour rejoindre son équipe dynamique. Ce rôle clé implique le développement et la maintenance d'outils bioinformatiques pour exploiter les ressources génomiques. Vous travaillerez dans un environnement international et multiculturel, contribuant à des projets de pointe qui façonnent l'avenir de l'agriculture. Si vous êtes motivé(e) par la science et l'innovation, cette opportunité est faite pour vous.

Qualifications

• Titulaire d'un Master en bioinformatique avec compétences en analyse de génomes.
• Maîtrise des langages de programmation Python et R, ainsi que du scripting en Bash.

Responsabilités

• Réaliser des analyses génomiques et créer de nouveaux outils d'annotation.
• Gérer la donnée génomique et son intégration dans les différentes plateformes.

Connaissances

Analyse de génomes

Python

R

Scripting en Bash

Principes DevOps

Git

Outils d'annotation

Snakemake

Nextflow

Environnement Unix

Formation

Master en bioinformatique

Outils

Galaxy

Description du poste

Avec pour maison-mère une coopérative agricole française installée dans la plaine de Limagne-Val d’Allier, au cœur de l’Auvergne, Limagrain est un groupe semencier et agroalimentaire fort de plus de 9 600 collaborateurs et présent dans 53 pays.

4e semencier mondial, Limagrain a réalisé un chiffre d’affaires de 2 522 millions d’euros en 2023-2024, auquel s’ajoutent 729 millions d’euros de chiffre d’affaires des activités réalisées conjointement avec ses partenaires stratégiques.

Finalité du poste

Le Groupe Limagrain, leader mondial dans le domaine des semences et des produits céréaliers, recherche un(e) Bioinformaticien(ne) pour rejoindre l’équipe de Bioinformatique de la Business Line LVS (Limagrain Vegetable Seeds). Au sein de cette Business Line, N°1 mondiale des semences potagères, vous intégrerez plus particulièrement l’organisation Trait & Technologie pour participer au développement des activités génomiques et bioinformatiques.

L’équipe Bioinformatique a pour mission de fournir un accès aux données génomiques (génomes, annotations, variations) ainsi que des outils et méthodologies à une communauté étendue d’utilisateurs non experts en bioinformatique. En tant que Bioinformaticien(ne), vous participerez à développer et maintenir des outils et approches pour faciliter l’exploitation des ressources génomiques à disposition.

Vos Missions

Basé au Centre de Recherches de Chappes, vous travaillerez au sein d’une équipe multi-site et internationale pour réaliser des analyses génomiques et créer de nouveaux outils. Vous travaillerez notamment sur la mise en place d’outils d’annotation structurelle et fonctionnelle de génomes. Vous participerez également à la gestion de la donnée génomique et son intégration dans les différentes plateformes.

CDD à pourvoir dans le cadre d’un remplacement d’un congé maternité dès juillet à Chappes (63).

Vous êtes titulaire d’un Master en bioinformatique et possédez des compétences en analyse de génomes. Vous maîtrisez les langages de programmation Python et R, ainsi que le scripting en Bash. Une connaissance des workflows tels que Snakemake ou Nextflow constitue un atout.

Vous appliquez les bonnes pratiques de code, incluant les principes DevOps et l’utilisation de Git. Une expérience dans le déploiement d’outils sous Galaxy est également un plus. Habitué(e) à travailler sur des grilles de calcul dans un environnement Unix, vous faites preuve d’autonomie et de rigueur dans vos missions.

Doté(e) d’un bon relationnel, vous savez travailler en équipe et interagir dans un environnement international, multiculturel et multidisciplinaire. Vous maîtrisez l’anglais, aussi bien à l’écrit qu’à l’oral.