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An established public research institution is seeking an Assistant Engineer specializing in geo-natural and anthropized environments. This role involves the identification and analysis of phytoplankton and microphytobenthos, as well as supporting sampling missions and conducting routine physico-chemical measurements. The position offers a unique opportunity to contribute to vital ecological research, working closely with a dedicated team in a collaborative environment. Ideal candidates will possess strong skills in marine biology and image analysis, and be prepared for field missions on research vessels. Join this innovative team and play a key role in advancing environmental science.
Fonction Publique de l'Etat
Catégorie A (cadre)
Emploi ouvert aux titulaires et aux contractuels
Recherche - Experte / Expert en environnement
Vacant
Assistant-e ingénieur-e en études d'environnements géo-naturels et anthropisés H/F
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.
Mission :
Au sein de la plateforme biodiversité de l'UMR EPOC, l'assistant.e ingénieur sera chargé.e de
1/ l'identification du microphytoplancton et du microphytobenthos,
2/ l'analyse automatisée d'images de phytoplancton et leur bancarisation;
3/ l'appui aux missions d'échantillonnage du microphytbenthos et du phytoplancton et
4/ la réalisation des mesures physico-chimiques de routine associées à ces organismes
Activité :
-Identification et dénombrement des organismes phytoplanctoniques et microphytobenthiques par microscopie optique et par microscopie électronique à balayage.
-Préparation des échantillons de phytoplancton en vue de leur analyse (filtration, extraction, etc...)
-Préparation des échantillons de microphytobenthos en vue de leur analyse (extraction, conservation...)
-Réalisation de mesures automatisées du microphytoplancton (type Flowcam ou PlanktoScope)
-Traitement des images de phytoplancton par EcoTaxa
-Réalisation des mesures de routine en écologie du phytoplancton (turbidité, fluorescence, dosage chlorophylle) et du microphytobenthos
-Maintenance, déploiement et maniement de capteurs in situ, à la fois dans la colonne d'eau mais aussi au niveau du sédiment
-Appuis aux missions terrain pour la collecte du microphytobenhtos et du phytoplancton incluant, entre autres, celles du Service National d'Observation (SNO) PHYTOBS
-Validation de données suivant démarche qualité de type SNO et bancarisation des données
Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
Contexte :
La personne recrutée sera affectée au sein de l'Unité Mixte de Recherche EPOC (Environnements, Paléoenvironnements Océaniques et Continentaux). Membre de l'équipe de recherche ECOBIOC (Ecologie et Biogéochimie des systèmes Océaniques et Continentaux), elle sera positionnée sur le site de la station marine d'Arcachon au sein de la Plateforme Biodiversité. Son activité consistera principalement, en association avec le responsable scientifique de cette plateforme biodiversité et la scientifique spécialiste du volet phytoplancton au sein de cette plateforme, en l'observation et le dénombrement de microalgues phytoplanctoniques et phytobenthiques sous microscope, microscope inversé et/ou loupe binoculaire. Le profil de poste inclue des embarquements réguliers d'une durée d'une demi-journée sur le navire océanographique Planula IV (rythme bimensuel, durée 1/2 journée) mais peut, en fonction des programmes, impliquer des missions plus longues, sur d'autres navires côtiers voire hauturiers. Des missions terrains sur l'estran, souvent très envasé, avec ou sans embarquement, sont à prévoir pour les travaux en lien avec le microphytobenthos.
L'assistant.e ingénieur apportera ainsi un support technique aux recherches réalisées au sein de l'équipe sur l'écologie des organismes/communautés benthiques et planctoniques. Elle/Il apportera également un support technique au service d'observation national (SNO) PHYTOBS de l'Infrastructure de Recherche ILICO.
Competence :
Savoirs :
- Taxinomie du (micro-)phytoplancton et du microphytobenthos marin,
- Biologie et Ecologie marine, Analyse d'image, Réglementation en matière d'hygiène et de sécurité,
- Démarche qualité et bonnes pratiques de laboratoire appliquées aux techniques utilisées en taxinomie,
- Techniques d'analyses physicochimiques relatives aux organismes photosynthétiques (dosage Chlorophylle, mesures des teneurs en MES des eaux..),
- Démarche qualité appliquée au cycle de vie de la donnée,
- Langue anglaise : B1.
Savoir-faire :
- Identification du (micro-)phytoplancton, Identification du microphytobenthos,
- Maîtrise des techniques de fixation et d'extraction du phytoplancton,
- Maîtrise des techniques de fixation et d'extraction du microphytobenthos,
- Maîtrise des techniques d'acquisition d'image (Flowcam/Planktoscope, optionnellement, Zooscan),
- Maîtrise des outils informatiques d'analyse d'images (type EcoTaxa),maîtrise des techniques d'analyse des paramètres physico-chimique de routine (dosages de chlorophylle, teneur en MES, pH,...) - Permis B.
Savoir-être :
- être capable de transmettre des connaissances et de travailler en interaction avec les responsables de programmes de recherche et de services d'observation.
Oui
Campgane printemps 2025
Europe, France, Nouvelle Aquitaine, Gironde (33)
33600 PESSAC (France)
Niveau 5 Diplômes de niveau bac +2
Sciences naturelles (biologie-géologie)
Français (Seuil)