Etude de la réactivité des rhizodépôts vis-à-vis du fer et des éléments en traces métalliques

European Commission; France; Sur place; EUR 16 000 - 22 000; Plein temps

Résumé du poste

Le Laboratoire Sols et Environnement à Nancy propose une thèse de doctorat sur la réactivité des rhizodépôts vis-à-vis des éléments en traces métalliques. Le candidat devra réaliser des analyses métabolomiques et travailler en équipe sur des projets interdisciplinaires.

Qualifications

• Une première expérience en LC-MS en métabolomique non ciblée serait un plus.
• Appétence pour les approches expérimentales et l’analyse de données.

Responsabilités

• Identifier les exsudats racinaires de plantes dicotylédones.
• Étudier les facteurs d’exsudation et caractériser leur réactivité vis-à-vis des ETM.

Connaissances

Analyse chromatographique

Approches expérimentales

Analyse de données

Formation

Master 2 en chimie

Diplôme d’ingénieur en chimie

Outils

LC-MS

Description du poste

Laboratoire Sols et Environnement UMR INRAE/UL 1120

12 Jun 2025 - 22:00 (UTC)

Environnement de travail, missions et activités

Vous serez accueilli(e) au sein du Laboratoire Sols et Environnement (LSE), une Unité Mixte de Recherche de l’Université de Lorraine et de l’INRAE (UMR 1120), pour réaliser une thèse de doctorat intitulée « Étude de la réactivité des rhizodépôts vis-à-vis du fer et des éléments en traces métalliques ». La recherche sera encadrée par Thibault Sterckeman (Ingénieur de Recherche, INRAE) et Pierre Leglize (Maître de Conférences, Université de Lorraine).

Les éléments en traces métalliques (ETM), tels que Cd, Cu, Ni, Pb ou Zn, sont parmi les principaux polluants des sols. Absorbés par les racines des plantes cultivées, ils peuvent contaminer la chaîne alimentaire et menacer la santé humaine. Le flux d’absorption des ETM dépend de leur spéciation dans la rhizosphère. Seules les formes ioniques libres (M2+) peuvent généralement traverser la membrane des cellules racinaires via des systèmes de transport spécifiques. Les complexes formés par les ions métalliques avec divers ligands peuvent se dissocier à proximité des racines, libérant des ions libres absorbables. Ces ligands proviennent de la matière organique du sol, des sécrétions microbiennes et des exsudats racinaires, dont la composition reste peu connue mais est cruciale pour la compréhension de la biodisponibilité des ETM.

Pour modéliser la quantité d’ETM prélevée par une plante, il est nécessaire de connaître la nature des ligands, leur flux d’exsudation, leur constante de stabilité avec le métal, ainsi que leurs vitesses d’association et de dissociation.

Les objectifs de cette thèse sont d’identifier les exsudats racinaires de plantes dicotylédones, d’étudier leurs facteurs d’exsudation, et de caractériser leur réactivité vis-à-vis des ETM et du fer.

Le projet débutera par une caractérisation chimique des exsudats racinaires et de leurs facteurs de production via une analyse métabolomique dans différentes conditions expérimentales, en comparant notamment différents génotypes d’Arabidopsis thaliana et de Noccaea caerulescens en hydroponie et en sol. La recherche poursuivra avec l’identification des ligands des ETM et du fer par analyse métabolomique en présence d’ETM modèles et de chromatographie d’affinité (IMAC). Enfin, des mesures de spéciation dynamique des ETM dans les solutions d’exsudats racinaires seront réalisées par des techniques électrochimiques (SCP, AGNES).

Ce travail s’appuiera sur les moyens de culture de la plateforme PEPLor, l’analyse HPLC-MS du PASM de l’ENSAIA, et la collaboration de chercheurs de l’Institut Jean-Pierre Bourgin (analyse métabolomique), du LRGP (IMAC) et du LIEC (analyse électrochimique).

Financement : Contrat doctoral

Titre du doctorat : Doctorat en Sciences Agronomiques

Pays : France

Lieu : Nancy

Formation recommandée : Master 2 ou diplôme d’ingénieur en chimie, chimie analytique ou chimie des substances naturelles

Connaissances souhaitées : Analyse chromatographique

Expérience appréciée : Une première expérience en LC-MS en métabolomique non ciblée serait un plus

Aptitudes recherchées : Appétence pour les approches expérimentales et l’analyse de données, goût pour le travail en équipe et environnement interdisciplinaire

Nombre d’offres : 1

Organisme : Laboratoire Sols et Environnement UMR INRAE/UL 1120

Pays : France

Ville : Nancy