Ingénieur d’études en bio-informatique (H/F)

TN France; Gif-sur-Yvette; Sur place; EUR 60 000 - 80 000; Plein temps

Résumé du poste

Une opportunité passionnante s'offre à vous en tant qu'Ingénieur d’études en bio-informatique, où vous serez au cœur de l'innovation scientifique. Dans un laboratoire dynamique, vous aurez l'occasion de travailler avec des données génomiques de pointe, en utilisant des outils bio-informatiques pour analyser et traiter des informations cruciales. Vous serez également responsable de la formation des nouveaux membres de l'équipe et de la promotion des meilleures pratiques scientifiques. Si vous êtes passionné par la bio-informatique et désireux de contribuer à des projets de recherche innovants, cette position est faite pour vous.

Qualifications

• Connaissance des analyses bio-informatique et gestion de données génomiques.
• Maîtrise des langages pour l'analyse de données de séquence.

Responsabilités

• Recenser les outils bio-informatiques utilisés au laboratoire.
• Définir et mettre en œuvre les procédures de maintenance logicielle.
• Former les nouveaux entrants et promouvoir les bonnes pratiques.

Connaissances

Analyse bio-informatique

Gestion de données génomiques

Unix

Python

Java

R

Conda

Travail en équipe

Langue anglaise

Formation

BAC+5

Outils

Outils bio-informatiques

Description du poste

Ingénieur d’études en bio-informatique (H/F), Gif-sur-Yvette

Informations générales

Intitulé de l'offre : Ingénieur d’études en bio-informatique (H/F)
Référence : UMR9191-ARNLER-005
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : GIF SUR YVETTE
Date de publication : jeudi 1 mai 2025
Type de contrat : IT en contrat CDD
Durée du contrat : 12 mois
Date d'embauche prévue : 1 septembre 2025
Quotité de travail : Complet
Rémunération : 2 540,99 € et 2 711,10 € brut mensuel selon expérience
Niveau d'études souhaité : BAC+5
Expérience souhaitée : 1 à 4 années
BAP : A - Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type : Ingénieur-e biologiste en analyse de données

CDD 12 mois, Ingénieur d’études en bio-informatique et génomique pour l’administration logicielle et la gestion, le traitement et l’analyse des données.

Activités

- Recenser et répertorier les outils bio-informatiques et bio-statistiques fréquemment utilisés au laboratoire (par exemple dans le domaine de l’annotation, la génétique d’association, phylogénie, génomique des populations et évolution moléculaire, analyse d’image, etc). Tester et comparer les logiciels concurrents.
- En collaboration avec les services informatiques du laboratoire EGCE et de l’institut IDEEV, définir et mettre en œuvre les procédures de maintenance de la pile logicielle dédiée aux analyses bio-informatiques sur les serveurs communs du laboratoire.
- Assurer la mise en place d’une procédure d’accueil et de formation des nouveaux entrants, animer un atelier bio-informatique à destination des utilisateurs. Promouvoir les bonnes pratiques scientifiques (reproduction, traçabilité, Open Science) et techniques (utilisation d’infrastructures communes, serveurs du laboratoire et plateformes collaboratives).
- Apporter conseil et aide dans les projets de recherche développés au laboratoire.

Compétences

Connaissance générale des analyses bio-informatiques, en particulier sur des données génomiques et transcriptomiques. Maîtrise des outils de gestion et langages de la pile logicielle courante pour l’analyse de données de séquence (Unix, shell, python, java, R, conda) et de l’administration de systèmes Unix pour la bio-informatique.
Avoir le sens de l’organisation, du travail en équipe, et savoir transmettre des connaissances et animer un groupe de travail.
Langue anglaise : B1 minimum.

Contexte de travail

Le laboratoire EGCE est une des trois UMR installées dans l'Institut Diversité, Ecologie et Evolution du Vivant (IDEEV) situé dans le campus de l'Université Paris Saclay. L'UMR EGCE regroupe des équipes de recherche utilisant de plus en plus de grandes quantités de données de séquences, obtenues par des technologies de séquençage “haut débit”, pour étudier des questions multiples en écologie et en évolution. Le traitement, la gestion et l’analyse de ces données génomiques représentent un fort goulet d’étranglement, qui ne peut que s’accroître étant donnés le développement rapide et la baisse des coûts des technologies de séquençage haut-débit. Pour rester à la pointe de la recherche en écologie et évolution, y compris en termes de bonnes pratiques scientifiques (données ouvertes, archivage, reproductibilité), il apparaît indispensable de disposer d’un appui technique avec des compétences dans l’analyse de données génomiques.