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Des études récentes montrent que les D-peptidases, des enzymes spécialisées dans la dégradation de peptides contenant des D-aminoacides, menacent l'efficacité d'antibiotiques lipopeptidiques tels que la polymyxin B, la daptomycine et, plus largement, des antibiotiques peptidiques contenant des D-aminoacides. Étudier ce type d'enzyme est important, car il constitue un nouveau mécanisme d'antibiorésistance.
Ces enzymes, produites par des bactéries pour réguler la concentration des antibiotiques qu'elles synthétisent, ont été identifiées par criblage in-silico de génomes bactériens, sans que leur importance environnementale n'ait été étudiée. Ce projet de thèse vise à développer une banque de substrats innovants permettant de détecter, marquer ces D-peptidases par une étiquette fluorescente, et de les isoler dans des échantillons environnementaux. Leur identification pourrait également révéler de nouveaux composés antibiotiques, renforçant ainsi les thérapies existantes menacées par l'antibiorésistance.