Dynamique des variants d'histones H3.3 et CENP-A lors d'une infection virale par HSV-1

Institut NeuroMyoGène - Unité PGNM; France; Sur place; EUR 20 000 - 40 000; Plein temps

Résumé du poste

Une institution de recherche recrute un(e) stagiaire Master 2 pour étudier la dynamique des variants d'histones H3.3 et CENP-A lors d'infections virales. Sous la supervision d'une enseignante-chercheuse, le/la stagiaire travaillera dans un environnement propice à l'apprentissage, avec un accent sur les techniques de biologie moléculaire et l'épigénétique.

Qualifications

• Doit être titulaire d'un master 1 ou d'un diplôme universitaire équivalent.
• Excellentes notes et compétences en communication requises.
• Formation en génétique moléculaire et en épigénétique est un atout.

Responsabilités

• Analyser la dynamique des variants d'histones H3.3 et CENP-A lors d'une infection par le virus HSV-1.
• Utiliser des techniques de perte de fonction par siRNA et CRISPR-Cas9 pour identifier les acteurs moléculaires.

Connaissances

Compétences en communication

Intérêt pour la recherche

Formation

Master 1 en biologie ou diplôme équivalent

Outils

Immunoprécipitation

Microscopie confocale

CRISPR-Cas9

Description du poste

Dynamique des variants d'histones H3.3 et CENP-A lors d'une infection virale par HSV-1

Institut NeuroMyoGène - Unité PGNM

Sujet de stage :

Le virus HSV-1 possède un génome à ADN double-brin qui est chromatinisé lors de son entrée dans le noyau. Il a été montré que le variant d'histone H3.3 s’associe avec l’ADN viral lors d'une infection lytique ou latente. Nos données préliminaires démontrent notamment une association rapide du variant H3.3 avec les génomes viraux entrants dans le noyau de la cellule infectée, à condition que la protéine virale ICP0, une E3 ubiquitine ligase, ne soit pas exprimée. En revanche, lors d'une infection lytique avec un virus exprimant ICP0, H3.3 ne s'associe plus aux génomes viraux entrants, mais colocalise transitoirement aux centromères endommagés, à la place du variant d'histones CENP-A, une cible d’ICP0.

L'objectif du projet est donc de déterminer plus précisément la dynamique des variants d'histones H3.3 et CENP-A lors d'une infection par le virus HSV-1. L'association de ces variants d'histones avec le génome viral et le génome cellulaire sera analysée grâce à des techniques d'immunofluorescence, de FISH, d'IF-FISH, ou de ChIP. L'étudiant(e) utilisera des approches de perte de fonction, via siRNA ou le système CRISPR-Cas9, pour identifier les acteurs moléculaires responsables de la dynamique de ces variants d'histones. Ce projet permettra de mieux comprendre le rôle des variants d'histones dans le contrôle de l'infection virale par HSV-1.

Encadré(e) par Armelle Corpet, maîtresse de conférences disposant d'une large décharge d'enseignements lui permettant un fort investissement dans la recherche, l’étudiant(e) bénéficiera d’un environnement de travail à la fois stimulant et bienveillant pour son stage de Master 2. Il/elle intégrera une équipe reconnue pour son expertise sur les variants d’histones et le HSV-1, au sein de l’Institut NeuroMyoGène, qui offre l’ensemble des équipements nécessaires à la réalisation de ce projet.

Modèle et techniques utilisées:

Cellules humaines primaires (BJ, RPE-1) ou cancéreuses (HeLa, T, U20S)

Immunoprécipitation de chromatine, CUT&RUN, PiCH

Microscopie fluorescente, confocal, ou de super-résolution (STORM)

Publications d’intérêt:

Le/La candidat(e) doit être titulaire d'un master 1 (ou d'un diplôme universitaire équivalent) et manifester un intérêt marqué pour la recherche en biologie avec l'objectif de poursuivre en thèse. Il/Elle devra posséder d'excellentes notes sur le parcours universitaire et de bonnes compétences en communication, tant pour les présentations orales que pour la rédaction scientifique. Une formation universitaire en génétique moléculaire et en épigénétique serait un atout.