Chimiste en modélisation moléculaire - Stage - H/F

Pierre Fabre; Toulouse; Hybride; EUR 11 000 - 16 000; Plein temps

Avantages offerts par ce poste

Restauration d’entreprise

Titres-restaurants

Télétravail 1 jour/semaine

Gratification attractive

Résumé du poste

Le laboratoire Pierre Fabre à Toulouse, site Langlade, propose un stage de chimie computationnelle en modélisation moléculaire dans le cadre de la recherche en oncologie. Vous travaillerez sur le développement d'une pipeline de prédiction de résistance et contribuerez à la construction de jeux de données publics et internes, avec une mission d'évaluation et de documentation.

Ce stage offre une gratification attractive, un jour de télétravail par semaine après intégration, et des échanges avec

Qualifications

• Master 2 en chimie computationnelle, chimie computationnelle, biologie structurale, biologie computationnelle, bioinformatique ou domaine équivalent.
• Bonne compréhension des interactions protéine–ligand.
• Bonne connaissance des bases COSMIC, cBioPortal et TCGA.
• Connaissance de la base de données MdrDB est un plus.
• Bonnes connaissances en biologie structurale et en modélisation de protéines.
• Bases en génomique du cancer et en biologie moléculaire (mutations somatiques, mécanismes de résistance).
• Notions de base en manipulation de fichiers de séquences/structures (FASTA, PDB).
• Savoir travailler avec Linux et coder en Python.
• Rigueur, autonomie et esprit critique, notamment pour la validation méthodologique.
• Bon niveau de rédaction scientifique (français et/ou anglais).

Responsabilités

• Concevoir et tester une pipeline de prédiction de résistance.
• Créer un jeu de données public et interne pour validation.
• Exécuter les outils de prédiction et évaluer les performances (sensibilité, spécificité, faux positifs/négatifs).
• Identifier les limites et développer une méthode applicable à différentes cibles thérapeutiques.
• Documenter le protocole et les résultats, et formuler des recommandations sur l'usage des outils.
• Présenter l'avancement et les conclusions à l'équipe tout au long du stage.

Connaissances

Protein–ligand interactions

Python

Linux

Biologie structurale

Cancer Genomics

Data handling

Formation

Master 2 en chimie computationnelle

Outils

COSMIC

cBioPortal

TCGA

MdrDB

Description du poste

## Chimiste en modélisation moléculaire - Stage - H/FPostuler: France - Toulouse - Langlade: Temps plein: Offre publiée aujourd'hui: JR114014# Qui sommes-nous ?Nous sommes les Laboratoires Pierre Fabre, leader mondial qui allie expertise pharmaceutique et dermo-cosmétique pour accompagner les consommateurs et les patients à chaque étape de leur parcours de soins. Notre portefeuille compte plusieurs franchises médicales et marques internationales dont Eau thermale Avène, Ducray, A-Derma, Klorane, René Furterer et Pierre Fabre Oral Care. En nous rejoignant, vous intégrez une entreprise riche de sens, où la dimension humaine est essentielle. Vous devenez acteur du \"We Care Movement\", un mouvement qui valorise l'excellence et l'innovation au sein d'équipes passionnées. Ensemble, nous repoussons les limites de la science pour unir santé et beauté au bénéfice de tous, car à chaque fois que nous prenons soin d’une seule personne, nous rendons le monde meilleur. Présents dans 120 pays et une équipe de plus de 10 000 collaborateurs, nous sommes fiers de créer un impact scientifique et humain, aujourd'hui et demain! Si prendre soin est au cœur de vos valeurs, rejoignez les Laboratoires Pierre Fabre et devenez un acteur clé du \"We Care Movement\".# Votre mission**Votre rôle au sein d’une entreprise pionnière en pleine expansion.***Dans le cadre de nos activités de recherche en oncologie, nous souhaitons développer une méthode de prédiction des mutations de résistance aux traitements anticancéreux. L'objectif du stage est de tester la robustesse et la pertinence d’outils existants et de developer une pipeline de prédiction de résistance applicable à différentes cibles thérapeutiques.*## Dans le cadre de votre stage, vos missions principales seront :* Création d’un jeu de données publiques et internes pour la validation d’outils.* Exécuter les outils de prédiction et évaluer leurs performances (sensibilité, spécificité, faux positifs/négatifs)* Identifier les limites et développer une méthode applicable à différentes cibles thérapeutiques* Documenter le protocole et les résultats, et formuler des recommandations sur l'usage des outils (cas d'application, limites)* Présenter l'avancement et les conclusions à l'équipe tout au long du stage Les plus du stage :* Missions diversifiées* Gratification attractive* Possibilité de réaliser un jour de télétravail par semaine après un mois d'intégration* Dotations produits* Restaurant d'Entreprise ou Titres Restaurants Le stage se déroulera sur notre sit**e Langlade, à Toulouse (31)** et débutera à partir de **janvier 2027.** Merci d’indiquer vos dates de disponibilités dans votre CV.\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_ ## **Your role within a pioneering, rapidly expanding company.***As part of our oncology research activities, we aim to develop a method for predicting resistance mutations to anticancer treatments. The goal of the internship is to test the robustness and relevance of existing tools and to develop a resistance-prediction pipeline applicable to different therapeutic targets.* ## *Main Tasks** *Building a public and internal dataset for tool validation.** *Running prediction tools and evaluating their performance (sensitivity, specificity, false positives/negatives)** *Identifying limitations and developing a method applicable to different therapeutic targets** *Documenting the protocol and results, and making recommendations on tool usage (use cases, limitations)** *Presenting progress and conclusions to the team throughout the internship* Internship Benefits:* Diverses missions* Attractive compensation* Possibility to work one day remotely per week after one month of integration* Product allowances* Company Restaurant or Meal Vouchers The internship will take place on our site **Langlade, Toulouse (31)** and start **january 2027.**Please indicate your availability dates in your CV. # Young People# Qui êtes-vous ?**Vos compétences au service de projets novateurs.****Nous recherchons un étudiant(e) en Master 2 (chimie informatique, chimie computationnelle, biologie structurale, biologie computationnelle, bio-informatique, ou équivalent).*** Une bonne compréhension des interactions protéine-ligand est nécessaire* Savoir exploiter les bases de données publiques COSMIC, cBioPortal, TCGA, ...* La connaissance de la base de données MdrDB est un plus.* Bonnes connaissances en biologie structurale et en modélisation de protéines* Bases en génomique du cancer et en biologie moléculaire (mutations somatiques, mécanismes de résistance aux traitements)* Notions de base en manipulation de fichiers de séquences/structures (FASTA, PDB)* Savoir travailler avec les lignes de commandes Linux et coder en Python* Rigueur, autonomie et esprit critique, notamment pour la validation méthodologique* Bon niveau de rédaction scientifique (français et/ou anglais)## \\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_\\_ **Put your skills to work on innovative projects**## ***Candidate Profile : Master’s student (2nd year) in cheminformatics, computational chemistry, structural biology, computational biology, bioinformatics, or a related field**** *A good understanding of protein–ligand interactions is required** *Ability to work with public databases such as COSMIC, cBioPortal, TCGA, ...** *Familiarity with the MdrDB database is a plus.** *Good knowledge of structural biology and protein modeling** *Basic knowledge of cancer genomics and molecular biology (somatic mutations, treatment-resistance mechanisms)** *Basic skills in handling sequence/structure files (FASTA, PDB)** *Comfortable working with the Linux command line and coding in Python** *Rigor, autonomy, and critical thinking, particularly for methodological validation** *Good scientific writing skills (French and/or English)**La première richesse des Laboratoires Pierre Fabre, sont les femmes et les hommes qui les composent* disait M. Pierre Fabre.Fiers de cet héritage, et convaincus que la diversité des parcours, des expériences et des identités renforce notre performance collective, nous nous engageons à promouvoir l’égalité des chances et à garantir un environnement inclusif pour tous. Dans le respect des lois en vigueur, toutes les candidatures sont étudiées avec la même attention, sans distinction d’origine, de sexe, d’âge, de situation de handicap, d’orientation sexuelle, d’identité de genre, de croyances ou de toute autre caractéristique protégée par la loi.