Chercheur / Chercheuse en chémoinformatique - CDD de projet 13 mois

Unistra; Strasbourg; Sur place; EUR 36 000 - 52 000; Plein temps

Résumé du poste

Université de Strasbourg cherche un chercheur/chercheuse en chémoinformatique en CDD de projet de 13 mois. Développera et appliquera des méthodes pour l’analyse et la visualisation de l’espace chimique, la conception et la priorisation de chimiothèques, en collaboration avec un partenaire industriel du secteur pharmaceutique.

Maîtrise de RDKit et programmation Python requises; déploiement en flux reproductibles, API et notebooks, avec une forte autonomie et esprit collaboratif dans un contexte

Qualifications

• Doctorat en chémoinformatique ou domaine proche.
• Solide expertise en chémoinformatique: représentation et standardisation des structures chimiques, mesures de similarité, analyse et visualisation de l’espace chimique.
• Connaissance des approches computationnelles de conception et d’optimisation de chimiothèques.
• Maîtrise de l’anglais scientifique, à l’écrit comme à l’oral.

Responsabilités

• Développer des flux de travail reproductibles pour le traitement, la standardisation, la représentation, la comparaison et l’analyse des structures chimiques et des données associées.
• Concevoir des visualisations claires, statiques et interactives, des espaces chimiques, des squelettes moléculaires et des paysages de propriétés ou d’activités.
• Concevoir et évaluer des chimiothèques ciblées et diversifiées et prioriser les composés.
• Implémenter ces méthodes sous forme de paquets Python/RDKit maintenables et d’outils en ligne de commande, en collaboration avec les chimistes du partenaire industriel.

Connaissances

Python

RDKit

Bash/Linux

Git

CI/CD

Data visualization

Teamwork

Autonomy

Formation

Doctorat en chémoinformatique

Outils

RDKit

Description du poste

Chercheur / Chercheuse en chémoinformatique - CDD de projet 13 mois

Publié le 30 Sep. 2026 - Ouvert jusqu'au 21 oct. 2026

• Type de contrat Contractuel

Personnel des bibliothèque, ingénieur, administratif, technique, pédagogique, social et de santé (BIATPSS)

CDD de projet 13 mois

Démarrage à compter du 01/11/2026

Catégorie : A Corps : Ingénieur de recherche

Emploi ouvert aux agents contractuels uniquement

Rémunération selon grille de la Fonction Publique

Affectation : Laboratoire de Chémoinformatique– UMR 7140

Développer et appliquer des méthodes de chémoinformatique pour l’analyse et la visualisation de l’espace chimique, l’analyse des relations structure-activité ainsi que la conception, la sélection et la priorisation de chimiothèques, dans le cadre d’un projet de 12 mois mené en étroite collaboration avec un partenaire industriel du secteur pharmaceutique. L’objectif est d’automatiser et de fluidifier ces flux de travail afin qu’ils soient reproductibles, réutilisables et transposables à l’ensemble des projets de découverte de médicaments.

-Développer des flux de travail reproductibles pour le traitement, la standardisation, la représentation, la comparaison et l’analyse des structures chimiques et des données associées.
-Concevoir des visualisations claires, statiques et interactives, des espaces chimiques, des squelettes moléculaires (scaffolds), des séries d’analogues et des paysages de propriétés ou d’activités.
-Concevoir et évaluer des chimiothèques ciblées et diversifiées : couverture de l’espace chimique, analyse de diversité, sélection de sous-ensembles et priorisation des composés.
-Implémenter ces méthodes sous forme de paquets Python/RDKit maintenables, d’outils en ligne de commande, de notebooks, d’API ou d’applications légères, en collaboration étroite avec les chémoinformaticiens et les chimistes médicinaux du partenaire industriel.

Activités associées :

-Documenter, tester et maintenir les outils développés afin d’en assurer la réutilisation par le laboratoire et le partenaire.
-Participer aux réunions d’avancement régulières avec le partenaire industriel et présenter les résultats.
-Rédiger des rapports scientifiques et, le cas échéant, des publications et communications en congrès.
-Contribuer à la vie scientifique du laboratoire (séminaires, encadrement ponctuel d’étudiants).

-Doctorat, de préférence en chémoinformatique ou dans un domaine proche (chimie computationnelle, modélisation moléculaire, chimie médicinale).
-Solide expertise en chémoinformatique : représentation et standardisation des structures chimiques, mesures de similarité, analyse et visualisation de l’espace chimique.
-Connaissance des approches computationnelles de conception et d’optimisation de chimiothèques.
-Maîtrise de l’anglais scientifique, à l’écrit comme à l’oral.

Compétences opérationnelles :

-Excellente maîtrise de la programmation Python et expérience pratique de RDKit ou d’une bibliothèque de chémoinformatique équivalente.
-Capacité à construire des flux de travail reproductibles et des visualisations statiques et interactives de données chimiques.
-Maîtrise de Bash/Linux, de Git et des pratiques modernes de développement logiciel : tests, packaging, intégration et déploiement continus (CI/CD), conteneurs, API, documentation et développement collaboratif.
-Une expérience des outils de codage agentiques constituerait un atout.

Compétences comportementales :

-Autonomie, rigueur scientifique et sens de l’organisation.
-Goût du travail en équipe dans un environnement international et interdisciplinaire.
-Bonnes qualités de communication et aptitude à dialoguer avec des interlocuteurs académiques et industriels.
-Discrétion et respect de la confidentialité liée au partenariat industriel.

Pour postuler, veuillez adresser votre CV et lettre de motivation au plus tard le 21/10/2026 à l'attention de M. Dr Alexey Orlov, mail : [e-mail]

Située au carrefour géographique et historique de l’Europe, l’Université de Strasbourg compte parmi les plus importants établissements d’enseignement supérieur et de recherche (ESR) pluridisciplinaires. Grande université de recherche intensive, labellisée depuis 2012 Initiative d’excellence (Idex), elle entretient des liens étroits et privilégiés avec les principaux organismes de recherche, tels le CNRS et l’Inserm. Elle joue un rôle moteur dans la construction de l’espace européen de l’ESR au travers notamment du campus européen Eucor et de l’alliance universitaire européenne EPICUR.

Reconnue pour l’excellence de sa recherche et la richesse de son offre de formation, l’Université de Strasbourg assure sa mission de production et transmission des savoirs et de développement de compétences. S’appuyant sur ses valeurs fondamentales, dont l’ouverture, la créativité et l’inclusivité, elle veille à accompagner sa communauté – étudiants et personnels – dans la construction de leurs parcours adaptés à leurs profils, leurs talents et leurs aspirations.

Un patrimoine exceptionnel

• Un studium
• Un planétarium
• Un jardin botanique
• Six musées universitaires
• Un observatoire astronomique
• Un campus historique inscrit au patrimoine mondial de l’Unesco

Une qualité de vie au travail

• Parcours d’intégration des nouveaux nommés
• Dispositif d’accompagnement des nouveaux maîtres de conférences
• Une maison dédiée aux personnels avec une offre de plus de 100 activités sportives et culturelles
• Des campus verts et écoresponsables
• Forfait mobilité durable et contribution aux frais de déplacement et de restauration
• Prise en charge partielle de la mutuelle et prestations sociales en faveur des personnels et de leur famille
• Une cellule de prise en charge des situations de violence psychologique
• Une cellule d’écoute et d’accompagnement des violences sexistes, sexuelles et homophobes

Les informations que vous nous transmettrez ne seront utilisées qu’aux seules fins de recrutement par l’Université de Strasbourg. Elles seront traitées par la Direction des ressources humaines (DRH) et par l'entité de l’Université de Strasbourg concernée par ce recrutement. Elles seront conservées pour une durée maximum de 4 mois.

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