Chargé de projet épidémiologiste / modélisation dynamique et analyses de réseaux (H/F)

French Agency for Food, Environmental and Occupational Health & Safety (ANSES); Ploufragan; Sur place; EUR 42 000 - 65 000; Plein temps

Résumé du poste

L’agence ANSES recrute un(e) Épidémiologiste en modélisation dynamique et analyses de réseaux à Ploufragan (22440). Contrat public CDD de 24 mois, prise de fonctions dès que possible, rémunération selon l’expérience et le niveau de formation.

Vous intégrez le laboratoire de Ploufragan-Plouzané-Niort et l’unité EPISABE, et vous développerez des modèles sur graphes orientés pour étudier les échanges et les mouvements.

Qualifications

• Expérience sur les analyses de réseaux et modélisation épidémiologique.
• Maîtrise de R et Python pour l’analyse statistique et la modélisation.
• Capacité à piloter des projets scientifiques et à communiquer les résultats.

Responsabilités

• Structurer et valoriser les données pour la modélisation et la surveillance.
• Analyser les dynamiques de mouvements pour anticiper les risques sanitaires.
• Développer et mobiliser des modèles épidémiologiques sur graphes orientés.

Connaissances

R

Python

Git

Analyse de données de mouvements

Modélisation sur graphes orientés

Communication écrite et orale

Formation

Doctorat ou équivalent en épidémiologie et modélisation

Outils

Description du poste

Epidémiologiste en modélisation dynamique et analyses de réseaux (H/F)

Poste basé à Ploufragan (22440)

- Contrat à durée déterminée de droit public de 24 mois -

Date de prise de fonctions : Dès que possible

Rémunération : Selon l’expérience et le niveau de formation par référence aux grilles indiciaires des agences sanitaires.

Conditions particulières : Déplacements

Rattaché(e) au laboratoire de Ploufragan-Plouzané-Niort, vous intègrerez le consortium du projet HODAS. Ce programme PEPR PREZODE a pour objectif d’étudier et d’évaluer des mesures de surveillance pour l’émergence de pathogènes à l’interface entre la faune sauvage et les animaux d’élevage, en intégrant des données populationnelles. Les mouvements d’animaux d’élevage jouent un rôle important dans la diffusion de pathogènes au sein des différentes filières. Vous serez amené à développer des approches d’analyses de réseaux afin de caractériser la vulnérabilité et le potentiel de propagation de pathogènes au sein des filières porcines et avicoles.

Votre équipe

La direction pilote, le Laboratoire de Ploufragan-Plouzané-Niort, regroupe plus de 200 agents répartis au sein de 8 unités de recherche, 1 unité mixte technologique, 3 services expérimentaux, 1 service administratif et financier, 1 service management de la qualité. Le laboratoire de Ploufragan-Plouzané-Niort détient 17 mandats nationaux de référence. Au sein de cette direction, l’Unité Epidémiologie, Santé et Bien Être (EPISABE) oriente ses activités de recherche vers l’acquisition de connaissances destinées à la compréhension et la gestion des dangers sanitaires, dans les filières animales essentiellement porcine, avicoles et cunicole, de même que sur les dangers zoonotiques au sein de ces filières, les pratiques d’usage des antibiotiques en relation avec l’émergence de résistances et l’amélioration du bien-Être animal. L’unité contribue à la surveillance des maladies règlementées ou pénalisantes pour les filières étudiées. Des travaux de recherche portent aussi sur le développement d’outils et de méthodes (statistiques, modélisation) adaptés aux besoins spécifiques des thématiques traitées. Ainsi, vous rejoindrez une équipe multidisciplinaire d’une trentaine d’agents permanents et temporaires, avec une forte mobilisation sur le terrain et une capacité analytique reconnue.

Votre quotidien

Activité 1 - Structurer et valoriser les données pour la modélisation et la surveillance

Vous concevez et pilotez des dispositifs d’acquisition et de transformation de données, afin de disposer de jeux de données homogènes, fiables et mobilisables pour la modélisation.

Votre contribution se concentre sur la construction d’une chaîne de traitement cohérente, intégrant standardisation, qualité et reproductibilité, au service des besoins scientifiques et opérationnels.

Activité 2 - Analyser les dynamiques de mouvements pour anticiper les risques sanitaires

Vous exploitez les données de mouvements pour comprendre les structures de contacts des filières, détecter les signaux d’alerte et développer des approches analytiques innovantes pour renforcer la surveillance des émergences.

Cette activité vise à identifier les vulnérabilités systémiques et à orienter les stratégies de prévention et de détection précoce.

Activité 3 - Développer et mobiliser des modèles épidémiologiques sur graphes orientés

Vous élaborez des modèles dynamiques intégrant la structure directionnelle des échanges, afin de simuler les processus de transmission et d’évaluer les leviers de surveillance.

Votre expertise permet de transformer des mécanismes complexes en indicateurs actionnables, utiles pour guider les décideurs dans les filières et les institutions.

Votre profil

Formation et expérience requises :

• Doctorat en épidémiologie et modélisation serait très apprécié (Bac + 3 minimum)
• Expérience sur les analyses de réseaux et modélisation épidémiologique

Compétences :

• Programmation scientifique : R, Python, Git, environnements reproductibles.
• Analyse avancée de données de mouvements et analyse de réseaux (mobilité, réseaux d’échanges, flux).
• Modélisation sur graphes orientés et compréhension des structures de contact.
• Capacité à développer et évaluer des approches innovantes pour la détection précoce.
• Évaluation de modèles : sensibilité, incertitude, robustesse.
• Compétences en visualisation scientifique pour valoriser les analyses et modèles.
• Notions de calcul distribué, optimisation de scripts, gestion de volumes de données importants.
• Aptitude à piloter des projets scientifiques (coordination, reporting, animation).
• Compétences en communication écrite et orale.
• Autonomie, rigueur méthodologique, sens de la qualité et de la reproductibilité.

Infos pratiques :

Le poste est basé à Ploufragan

TGV Saint-Brieuc

Bus/vélo/voiture

L’Anses recrute, accompagne et valorise les talents dans leur diversité pour s’engager au service de la santé publique.