Cancer Transcriptomics & Biostatistics Bioinformatician – Paris

PSL Research University; Paris; On-site; EUR 32,000 - 39,000; Full time

Benefits offered by this job

Restauration collective

Transport annuel

Mutuelle d’entreprise

Job summary

Le Centre de recherche de l’Institut Curie recrute pour l’équipe RACER (Rare Cancers Exploration and Research) afin de conduire des analyses transcriptomiques translationnelles sur les sarcomes, notamment le liposarcome dédifférencié, en collaboration avec les bioinformaticiens du hub.

Le poste s’inscrit dans le projet ATTILAS, financé par l’ANR, et implique l’intégration de données RNA-seq bulk et single-cell, l’analyse de CNV et les validations fonctionnelles, avec publication attendue et

Qualifications

• Master 2 ou diplôme d'ingénieur en bioinformatique ou équivalent, ou doctorat en analyse transcriptomique.
• Au moins 2 ans d'expérience en analyse de données haut débit et scRNA-seq.
• Connaissance RNA-seq bulk et single-cell, normalisation et intégration multi-omics.
• Maîtrise des outils statistiques et de bioinformatique pour la survie et l'enrichissement.

Responsibilities

• Analyser les données RNA-seq bulk et scRNA-seq, contrôle qualité et normalisation.
• Déconvolution et annotation cellulaire, inférence de CNV et analyses trajectoires.
• Intégrer les résultats transcriptomiques aux résultats fonctionnels du projet.
• Collaborer avec biologistes et cliniciens, présenter les résultats et contribuer aux publications.

Skills

R

Python

Bash

Unix

Git

SLURM

Nextflow

Conda

Docker

Singularity

Anglais scientifique

Education

Master 2 en bioinformatique / biostatistique / science des données

Ingénieur/Biology data science

Doctorat en analyse transcriptomique

Tools

R

Python

Bash

Unix

Git

SLURM

Nextflow

Conda

Docker

Singularity

Job description

Le Centre de recherche de l’Institut Curie recrute pour l’équipe RACER (Rare Cancers Exploration and Research) afin de conduire des analyses transcriptomiques translationnelles sur les sarcomes, notamment le liposarcome dédifférencié, en collaboration avec les bioinformaticiens du hub.

Le poste s’inscrit dans le projet ATTILAS, financé par l’ANR, et implique l’intégration de données RNA-seq bulk et single-cell, l’analyse de CNV et les validations fonctionnelles, avec publication attendue et