Administrateur système d'information CropTraits (H/F)

Cnrs Inc

Montpellier

On-site

EUR 32,000 - 42,000

Full time

5 days ago
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Job summary

Le CNRS, via le laboratoire CEFE à Montpellier, recherche un ingénieur dont les missions incluent le maintien et le développement de la base CropTraits et l’assistance aux utilisateurs. Vous intégrerez de nouvelles données fonctionnelles et veillerez au respect des règles FAIR, tout en résolvant les incidents d’intégration et en planifiant les modifications d’application.

Le candidat idéal dispose de solides connaissances en agronomie et écologie fonctionnelle, maîtrise les langages R et Python

Qualifications

  • Connaissances poussées en agronomie et écologie fonctionnelle.
  • Anglais technique suffisant pour lire et extraires des informations scientifiques.
  • Maîtrise des langages R et Python pour manipuler des données et analyses.

Responsibilities

  • Maintenir et développer la base CropTraits et soutenir les utilisateurs.
  • Intégrer de nouvelles données de traits et méta-données en respect des règles FAIR.
  • Résoudre ou remonter les incidents liés à l’intégration des données.

Skills

Agronomie
Ecologie fonctionnelle
Anglais technique
R et Python

Education

Master en agronomie / écologie

Tools

R
Python

Job description

Missions
  • Assurer le maintien et le développement de la base de données CropTraits ainsi que l'assistance aux utilisateurs de la base de données
  • Intégrer de nouvelles données de traits fonctionnels et méta-données associées dans la base de données CropTraits dans les respect des règles du FAIR.
  • Résoudre ou faire remonter les incidents quant à l'intégration de nouvelles données.
  • Contrôler et planifier de manière efficace les modifications d'application.
  • Chercher de nouvelles sources d'informations dans la littérature scientifique.
Contexte de travail

Au sein du laboratoire CEFE à Montpellier, l’équipe ECOPAR a développé une expertise dans la structuration et la gestion de bases de données sur les traits fonctionnels des espèces sauvages. Depuis cinq ans, nous travaillons à la mise en place d’une base de données de traits fonctionnels dédiée aux espèces cultivées: CropTraits. Ce projet repose sur une collaboration interdisciplinaire entre écologues et informaticiens, visant à concevoir une base de données relationnelle robuste, accompagnée d’un webservice permettant une interrogation efficace des données.

Le développement de la base CropTraits est soutenu par le programme de recherche européen via une bourse ERC Strating Grant (ERC OrphanCrops) obtenu par Lucie Mahaut en 2026.

Conditions particulières d'exercice

Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde: 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers) , en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Profil recherché
  • Competences: Applications métiers: connaissances approfondies en agronomie et écologie fonctionnelle connaissances des différents partenaires et des réseaux professionnels en lien avec l'écologie fonctionnelle et l'agronomie
  • Anglais technique (connaissance générale) - être capable de lire et d'extraire de l'information pertinente à partir de la littérature scientifique
  • Langage de programmation: R et Python
  • Contraintes et risques:
Présentation de Cnrs

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.

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