Senior Bioinformatician, Genomics & Nanopore DNA Analysis

IGTP Retreat; Badalona; On-site; EUR 40,000 - 49,000; Full time

Benefits offered by this job

23 dies de vacances

5 dies personals

Retribució flexible (guarderia)

Càpsules formatives

Job summary

IGTP busca un/a bioinformàtic/a sènior per incorporar-se al grup GRENBA (Badalona). La tasca principal és posar a punt i analitzar resultats de seqüenciació de tercera generació, optimitzant fluxos de treball i informes científics, en un entorn multidisciplinari de recerca biomèdica.

Es requereix Doctorat en ciències/ salut, 5 anys de postdoctorat i experiència en anàlisi de dades massives amb ONT/PacBio, HPC i gestió de projectes.

Qualifications

• Doctorat en àrea de ciències o de la salut amb tecnologies de seqüenciació.
• Experiència postdoctoral d'almenys 5 anys.
• Experiència treballant amb anàlisis de dades massives de seqüenciació del DNA i de seqüenciació de tercera generació de lectures llargues (Oxford Nanopore o PacBio).
• Experiència prèvia en entorns HPC (Slurm, SGE) i gestió d’entorns d’analisi amb Bash, Python, Snakemake, Nextflow o similars.

Responsibilities

• Posar a punt i analitzar els resultats de la seqüenciació de tercera generació.
• Planificació, realització i execució d'experiments d'investigació.
• Contribució a informes d'investigació i publicacions.
• Revisió de literatura i desenvolupament de noves idees.
• Demanar i gestionar projectes d'investigació.
• Altres tasques bioinformàtiques relacionades amb altres línies de recerca.

Skills

Bioinformatics

Sequence analysis

Project leadership

HPC experience

Python

Snakemake

Nextflow

Bash

Data analysis

Education

Doctorat en ciències de la salut i tecnologies de seqüenciació

Tools

Oxford Nanopore Technologies

PacBio

Slurm

SGE

Snakemake

Nextflow

Python

Bash

Job description

IGTP busca un/a bioinformàtic/a sènior per incorporar-se al grup GRENBA (Badalona). La tasca principal és posar a punt i analitzar resultats de seqüenciació de tercera generació, optimitzant fluxos de treball i informes científics, en un entorn multidisciplinari de recerca biomèdica.

Es requereix Doctorat en ciències/ salut, 5 anys de postdoctorat i experiència en anàlisi de dades massives amb ONT/PacBio, HPC i gestió de projectes.