2026_146_BIOINFORMATIC/A SENIOR

IGTP; Badalona; Presencial; EUR 40 000 - 49 000; Tempo integral

Vantagens oferecidas por esta oferta de emprego

23 dies de vacances

5 dies personals

Retribució flexible (guarderia)

Càpsules formatives

Resumo da oferta

IGTP busca un/a bioinformàtic/a sènior per incorporar-se al grup GRENBA (Badalona). La tasca principal és posar a punt i analitzar resultats de seqüenciació de tercera generació, optimitzant fluxos de treball i informes científics, en un entorn multidisciplinari de recerca biomèdica.

Es requereix Doctorat en ciències/ salut, 5 anys de postdoctorat i experiència en anàlisi de dades massives amb ONT/PacBio, HPC i gestió de projectes.

Qualificações

• Doctorat en àrea de ciències o de la salut amb tecnologies de seqüenciació.
• Experiència postdoctoral d'almenys 5 anys.
• Experiència treballant amb anàlisis de dades massives de seqüenciació del DNA i de seqüenciació de tercera generació de lectures llargues (Oxford Nanopore o PacBio).
• Experiència prèvia en entorns HPC (Slurm, SGE) i gestió d’entorns d’analisi amb Bash, Python, Snakemake, Nextflow o similars.

Responsabilidades

• Posar a punt i analitzar els resultats de la seqüenciació de tercera generació.
• Planificació, realització i execució d'experiments d'investigació.
• Contribució a informes d'investigació i publicacions.
• Revisió de literatura i desenvolupament de noves idees.
• Demanar i gestionar projectes d'investigació.
• Altres tasques bioinformàtiques relacionades amb altres línies de recerca.

Conhecimentos

Bioinformatics

Sequence analysis

Project leadership

HPC experience

Python

Snakemake

Nextflow

Bash

Data analysis

Formação académica

Doctorat en ciències de la salut i tecnologies de seqüenciació

Ferramentas

Oxford Nanopore Technologies

PacBio

Slurm

SGE

Snakemake

Nextflow

Python

Bash

Descrição da oferta de emprego

DESCRIPCIÓN DE LA OCUPACIÓN

El Grup de REcerca Neuromuscular de Badalona (GRENBA) del Institut de Recerca Germans Trias i Pujol (IGTP) i ubicat en el àrea de recerca en neurociències, busca un/abioinformàtic/a sènior amb experiència sòlida en anàlisi de dades massives de seqüenciació del DNAaplicada a la recerca biomèdica i capacitat de lideratge en gestió de projectes. Es busca, un/acientífic/a altament motivat amb gran interès en el camp de la genètica i en el camp de les malalties minoritàries.Aquest/a candidat/a s’incorporará en el grup GRENBA, un grup multidisciplinar i dinàmic integrat per investigadors fundamentals i clínics del IGTP i del Hospital Germans Trias i Pujol (HGTiP).

FUNCIONES

La funció principal de la persona que s'incorpori serà posar a punt i analitzar els resultats de la seqüenciació de tercera generació a través de Oxford Nanopore Technologies per:

• Planificació, realització i execució de experiments d’investigació
• Anàlisi, interpretació i presentació de resultats d’investigació
• Contribució a informes d’investigació i publicacions
• Revisió de la literatura científica i desenvolupament de noves idees
• Demanar i gestionar projectes d’investigació

Altres tasques a realitzar seran tasques bioinformàtiques en relació a altres línies de recerca del grup.

SE REQUIERE

Requistis imprescindibles:

• Doctorat en el àrea de ciències o de la salut i tecnologies de seqüenciació
• Experiència post doctoral d'almenys 5 anys en aquest camp
• Experiència treballant amb anàlisis de dades massives de seqüenciació del DNA i de seqüenciació de tercera generació de lectures llargues com Oxford Nanopore Tecnologies o PacBio.
• Experiència prèvia en tractament de dades en entorns HPC (Slurm, SGE, etc) i gestió de entorns d’analisi i manteniment d’entorns de treball utilitzant Bash, Python, Snakemake, Nextflow o similars.

Requisits valorables:

• Es valorara positivament experiència prèvia en DM1 i molt positivament en anàlisi de caracterització de repeticions utilitzant seqüenciació de lectura llarga.
• Es valorarà positivament la experiència prèvia en anàlisi de RNA-seq, de single-cell, de splicing i de epigenòmica.
• Es valorarà positivament l’experiència en gestió de projectes i col·laboracions amb hospitals i entorns clínics i publico-privades.
• Es valorarà positivament les habilitats d’anàlisi estadístiques de dades clíniques de pacient
• Es valorarà molt positivament tenir coneixement i experiència prèvia en aplicació de intel·ligència artificial o aprenentatge màquina en eines de diagnòstic o estratificació de pacients basats en dades òmiques i moleculars.

Habilitats:

• Coneixements d'anglès oral i escrit.
• Dots excel·lents d’organització, comunicació i documentació.
• Persona organitzada, treballadora, proactiva, automotivada, entusiasta i amb capacitat de treballar en equip

SE OFRECE

• Contracte indefinit (Llei de la ciència 2011/14 - Indefinit per activitats cientificotècniques) lligat al projecte GRENBA.
• Data d’inici: Gener de 2027.
• Sou: 44.970 euros bruts/anuals
• Les retribucions brutes anuals inherents a la plaça objecte de la present convocatòria, seran fixades en funció de l'experiència aportada i les aptituds de la persona candidata, distribuïdes en 12 pagues.
• 23 dies de vacances + 5 dies personals anuals.
• Retribució flexible (tiquet guarderia).
• Càpsules formatives a càrrec de l’empresa.
• Formar part d'un centre de recerca multidisciplinari excel·lent amb el distintiu HRS4R.
• Ubicació al Campus Can Ruti, un entorn de recerca translacional de primer nivell de l'àrea de Barcelona, en un entorn científic molt estimulant. L'IGTP ofereix un ecosistema de suport, amigable i col·laboratiu per promoure el desenvolupament professional i ajudar-lo a assolir els seus objectius de recerca. Salari brut anual segons la vàlua del candidat/a.

PARA MÁS INFORMACIÓN

• https://www.germanstrias.org/en/research/neuroscience/5/group-of-research-in-neuromuscular-diseases-from-badalona-grenba
• https://orcid.org/0000-0002-7414-212X
• https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/?term=nogales-gadea+g&sort=date