Wissenschaftliche/rMitarbeiter/in (m/w/d)

Universität Rostock Zentr.UniVerwaltung Land MV

Rostock

Presencial

EUR 48.000 - 68.000

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Ventajas ofrecidas por este puesto de trabajo

Flexible Arbeitszeit
30 Tage Jahresurlaub
Jahressonderzahlung/ Betriebliche Vors
Familienbüro
Gesundheitsmanagement & Hochschulsport
Welcome Center
Weiterbildungsmöglichkeiten (IT, Spra­
Mobiles Arbeiten
Karriereberatung für Nachwuchswscient士
Fahrradleasing
Mitarbeiterparkplatz 24.12. & 31.12."
Mensa - Mitarbeitendentarif Willkommen
Möglichkeit zur Promotion

Descripción de la vacante

Die Universität Rostock sucht eine/n Wissenschaftliche/n Mitarbeiter/in (m/w/d) im Bereich Systembiologie & Bioinformatik im Rahmen des MICRO-NEST-Projekts. Die Position ist befristet bis 31.08.2031 und konzentriert sich auf die Integration heterogener biomedizinischer Daten sowie die Entwicklung datengetriebener Modelle.

Sie arbeiten an der Vernetzung von Transkriptom-, Bildgebungs- und anderen Datensätzen, kooperieren eng mit Klinik, Experiment und Datenanalyse und tragen zur Veröffentlichung

Formación

  • Abgeschlossenes Hochschulstudium in Systembiologie/Bioinformatik o.ä. mit sehr gutem Ergebnis.
  • Sehr gute Erfahrungen in computergestützter Analyse biomedizinischer Daten.
  • Sehr gute Programmierkenntnisse in Python und/oder R.
  • Englischkenntnisse fließend.
  • Teamfähigkeit und interdisziplinäre Kommunikationsstärke.

Responsabilidades

  • Forschung im Bereich Systemmedizin.
  • Entwicklung von Integrations- und Analyse-Workflows zur Integration heterogener biomedizinischer Daten.
  • Analyse multimodaler Datensätze (Transkriptom, Bildgebung) und Integration in Modelle.
  • Aufbau und Analyse netzwerkbasierter biologischer Methoden zur Identifizierung prädiktiver Marker.
  • Integration von Datenbanken, Signalinformationen und externen Quellen in computergestützte Analysen.
  • Mitwirkung an patienten­spezifischen Computermodellen und digitalen Zwillingen für Autismus.
  • Enge interdisziplinäre Zusammenarbeit und Koordination mit Partnern aus Klinik, Experiment und Datenanalyse.

Conocimientos

Englisch fließend
Teamarbeit
Interdisziplinäre Zusammenarbeit
Problemlösefähigkeit
Forschungsorientierung

Educación

Master oder Diplom in Systembiologie/Bioinformatik

Herramientas

Python
R
Datenbanken/APIs

Descripción del empleo

Die Universität Rostock bietet Ihnen eine vielfältige, abwechslungsreiche und anspruchsvolle Tätigkeit in einer traditionsbewussten, aber dennoch innovativen, modernen und familienfreundlichen Hochschule in einer lebendigen Stadt am Meer.

An der Fakultät für Informatik und Elektrotechnik, Lehrstuhl für Systembiologie & Bioinformatik besetzen wir vorbehaltlich der Mittelzuweisung zum nächstmöglichen Zeitpunkt befristet für die Dauer des Projektes MICRO-NEST

bis 31.08.2031 die folgende Stelle:

Wissenschaftliche/r Mitarbeiter/in (m/w/d) -Systembiologie &Bioinformatik

MICRO-NEST ist ein „Horizont Europa“-Projekt, das die Wechselwirkungen zwischen Mikrobiom, Immunsystem und Gehirn im Zusammenhang mit der neurologischen Entwicklung und Autismus untersucht. An der Universität Rostock konzentriert sich das Projekt darauf, heterogene molekulare, bildgebende und klinische Datensätze in eine Autismus-Wissensdatenbank zu integrieren und netzwerkbasierte sowie auf maschinellem Lernen basierende Ansätze anzuwenden, um personalisierte computergestützte Modelle zu entwickeln. Die daraus resultierenden Modelle sollen dazu dienen, Krankheitsmechanismen zu untersuchen und prädiktive Marker sowie potenzielle therapeutische Ansatzpunkte zu identifizieren

DAS SIND IHRE AUFGABEN:
  • Forschung auf dem Gebiet der Sytemmedizin
  • Entwicklung von Methoden und Arbeitsabläufen zur Integration und Analyse heterogener biomedizinischer Daten
  • Analyse und Integration von Transkriptom-, Bildgebungs- und anderen multimodalen biomedizinischen Datensätzen
  • Aufbau, Pflege und Analyse biologischer netzwerkbasierter Methoden zur Identifizierung prädiktiver Marker und therapeutischer Zielstrukturen
  • Integration biologischer Datenbanken, Signalweginformationen und externer Datenquellen in computergestützte Analysen
  • Mitwirkung an der Entwicklung patientenspezifischer Computermodelle und des patientenpersonalisierten digitalen Zwillings für Autismus
  • enge interdisziplinäre Zusammenarbeit und Koordination mit Partnern aus den Bereichen
  • Klinik, Experiment und Datenanalyse
  • Verfassen, Veröffentlichen und Präsentieren wissenschaftlicher Ergebnisse sowie Mitwirkung an der wissenschaftlichen Organisation des Projekts
DAMIT PASSEN SIE ZU UNS:
  • abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium (Master, Diplom oder vergleichbarer Abschluss) in Systembiologie/Bioinformatik, Informatik, Biotechnologie, Biologie oder einer vergleichbaren Fachrichtung mit sehr gutem Ergebnis
  • sehr gute Erfahrungen in der computergestützten Analyse von Transkriptomdaten oder anderen biomedizinischen Daten
  • sehr gute Erfahrung in der Programmierung mit Python und/oder R
  • großes Interesse an interdisziplinärer biomedizinischer Forschung
  • fließende Englischkenntnisse in Wort und Schrift
  • Fähigkeit, in interdisziplinären Teams zu arbeiten und effektiv mit Projektpartnern zu kommunizieren
  • wünschenswert sind Erfahrung mit der Analyse biologischer Netzwerke, Signalwege oder der Zell-Zell-Kommunikation
  • Kenntnisse in maschinellem Lernen und statistischen Methoden zur biomedizinischen Datenanalyse
  • Erfahrung mit bildgebungsbasierten biologischen Daten und biologischen
  • Datenbanken/APIs Erfahrung im FAIRDatenmanagement
  • eine strukturierte, lösungsorientierte und proaktive Arbeitsweise sowie die Fähigkeit, wissenschaftliche Kooperationen aufzubauen und zu koordinieren
  • die Fähigkeit, computergestützte Methoden kritisch zu bewerten und komplexe Ergebnisse gegenüber Kooperationspartnern mit unterschiedlichem wissenschaftliche Hintergrund klar zu vermitteln
WIR ALS ARBEITGEBER:

Chancengleichheit ist uns wichtig. Bewerbungen geeigneter schwerbehinderter oder gleichgestellter Menschen sind uns willkommen. Wir streben eine Erhöhung des Anteils von Frauen in Forschung und Lehre an und bestärken deshalb einschlägig qualifizierte Frauen sich zu bewerben. Bewerbungen von Menschen anderer Nationalitäten oder mit Migrationshintergrund begrüßen wir.

WIR BIETEN IHNEN:
  • Flexible Arbeitszeit
  • 30 Tage Jahresurlaub
  • Jahressonderzahlung/ Betriebliche Altersvorsorge
  • Familienbüro
  • Gesundheitsmanagement & Hochschulsport
  • Welcome Center
  • Weiterbildungsmöglichkeiten (IT, Sprachen, berufliche Weiterbildung)
  • Mobiles Arbeiten
  • Karriereberatung für Nachwuchswissenschaftler/innen
  • Fahrradleasing
  • Mitarbeiterparkplatz 24.12. & 31.12. arbeitsfrei
  • Mensa - Mitarbeitendentarif Willkommenstag
  • Möglichkeit zur Promotion
WEITERE HINWEISE:

Die tarifliche Erfahrungsstufe legen wir unter Berücksichtigung Ihrer bisherigen Berufserfahrung individuell fest. Sofern Sie diese Stelle in Teilzeit ausüben möchten, ist dies unter Berücksichtigung der dienstlichen Werden Sie Teil des Teams Der Lehrstuhl für Systembiologie und Bioinformatik ist auf computergestützte Systembiologie, unterschiedlichem wissenschaftlichem Hintergrund klar zu vermitteln

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