Doktorand*in (w/m/d) für KI-gestützte Bildanalyse und Optimierung von Wirkstofftransportsystemen

Technische Hochschule Mannheim Land BW

Mannheim

On-site

EUR 47,000 - 67,000

Part time

4 days ago
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Benefits offered by this job

Betriebliche Altersvorsorge
Vermögenswirksame Leistungen
Jahressonderzahlung
Bildungszeit
Jobticket

Job summary

Die Technische Hochschule Mannheim sucht eine*n Doktorand*in (w/m/d) für KI‑basierte Bildanalyse und Optimierung von Wirkstofftransportsystemen im Projekt OncoSnipR. Die Stelle ist zu 80% (31,6 Std./Woche) ausgeschrieben und EG 13 TV-L zugeordnet.

Sie arbeiten in einer interdisziplinären Umgebung und kooperieren mit Industriepartnern; Ziel ist die Weiterentwicklung personalisierter Krebstherapien. Die Bewerbungsphase, Arbeitsgruppe Prof. Sauer, bietet Promotion über BW‑CAR.

Qualifications

  • Abgeschlossenes Hochschulstudium (Master/Uni Diplom) in Bioinformatik, Biotechnologie oder vergleichbar
  • Kenntnisse in KI-Methoden zur Segmentierung zellbiologischer Bilddaten
  • Umfangreiche Programmiererfahrung, idealerweise in Python
  • Englische Sprachkenntnisse mind. C1; Deutschgrundkenntnisse A2

Responsibilities

  • Entwicklung und Anwendung von in-silico Methoden zur Analyse von 3D‑Mikroskopiedaten
  • Computergestützte Versuchsplanung zur Optimierung des Wirkstofftransportsystems
  • Interdisziplinäre Zusammenarbeit mit akademischen/industriellen Partnern
  • Wissenschaftliche Auswertung, Präsentation und Publikation der Ergebnisse

Skills

KI‑Methoden zur Segmentierung zellbiol
Python
Statistische Versuchsplanung
Teamfähigkeit
Analysefähigkeit

Education

Master in Bioinformatik oder Biotechnologie (computational methods)
Noten überdurchschnittlich (mind. 2,0)

Tools

Python programming

Job description

Die Technische Hochschule Mannheim ist eine moderne Technische Hochschule. In neun Fakultäten werden hier über 5.000 Studierende qualifiziert. Die Hochschule ist im Forschungsbereich unter den Hochschulen für Angewandte Wissenschaften führend und kooperiert mit vielen bedeutenden Unternehmen. Wir bieten ein familienfreundliches, attraktives Umfeld inmitten der Metropolregion Rhein‑Neckar.

Die Technische Hochschule Mannheim sucht für das Projekt „OncoSnipR“ zum 01.01.2027 eine* Doktorand*in (w/m/d) für KI‑gestützte Bildanalyse und Optimierung von Wirkstofftransportsystemen.

EG 13 TV-L, Beschäftigungsumfang 80% (31,6 Std./ Woche) Kennziffer 6111 P für die Fakultät Biotechnologie (Arbeitsgruppe Prof. Sauer).

Informationen zum Projekt

Das durch das Bundesministerium für Forschung, Technologie und Raumfahrt geförderte interdisziplinäre Projekt „OncoSnipR“ widmet sich der Weiterentwicklung und dem besseren mechanistischen Verständnis einer neuartigen personalisierten Krebstherapie, die auf Technologien aus dem Bereich CRISPR/Cas und RNA‑Vakzine beruht. In einer Kooperation aus zellbasierter biomedizinischer Forschung, Informatik und Industrie werden mit KI‑Unterstützung neue Wirkstoffformulierungen aus Nanopartikeln und RNA‑Molekülen erforscht, um deren Effizienz, Zelltypspezifität und Gewebepenetration zu optimieren und die Mechanismen dahinter besser zu verstehen.

Aufgabenschwerpunkte
  • Entwicklung und Anwendung von in‑silico‑Methoden zur Analyse von 3D‑Mikroskopiedaten, insbesondere Algorithmen zur Bildsegmentierung und Klassifikation
  • Computergestützte Versuchsplanung zur Optimierung des Wirkstofftransportsystems
  • Interdisziplinäre Zusammenarbeit mit akademischen und industriellen Partnern
  • Wissenschaftliche Auswertung, Präsentation und Publikation der erzielten Ergebnisse
Anforderungsprofil
  • Abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium (Master/Uni Diplom) der Bioinformatik, Biotechnologie (mit Schwerpunkt auf computational methods) oder vergleichbarer Fächer mit überdurchschnittlichem Ergebnis, mind. Note 2,0
  • Kenntnisse in der Entwicklung und Adaption von KI‑Methoden zur Segmentierung von zellbiologischen Bilddaten
  • Kenntnisse in Statistischer Versuchsplanung; Kenntnisse in Bayes'scher Optimierung sind wünschenswert
  • Umfangreiche Programmiererfahrung, idealerweise in Python
  • Grundkenntnisse in zellbiologischen Fragestellungen und Laborabläufen
  • Befähigung und Bereitschaft zu selbstständigem wissenschaftlichem und zielorientiertem Arbeiten einschließlich Publikation
  • Ergebnisorientierung und Teamfähigkeit
  • Fähigkeit, in einem interdisziplinären Team eigene Ergebnisse und Methoden effektiv zu kommunizieren
  • Sehr gute Englischkenntnisse in Wort und Schrift (mindestens C1) sowie grundlegende Deutschkenntnisse (A2)
  • Hohe Selbstständigkeit, Analysefähigkeit und Entscheidungsfähigkeit
Wir bieten Ihnen:
  • Praxisrelevante Forschung in Zusammenarbeit mit einem hochinnovativen Industriepartner und mit der experimentellen Arbeitsgruppe Prof. Rudolf
  • Die Möglichkeit zur Promotion über den Promotionsverband der Hochschulen für Angewandte Wissenschaften Baden-Württemberg (BW‑CAR)
  • Die Leistungen des öffentlichen Dienstes auf Grundlage des TV‑L, wie z.B. Betriebliche Altersvorsorge, vermögenswirksame Leistungen und eine Jahressonderzahlung
  • Work‑Life Balance und Vereinbarkeit von Familie und Beruf durch Gleitzeit, zentrale Beratungsangebote über „Zusammen am Campus“ und voiio
  • Anspruch auf Bildungszeit
  • Arbeitsfreie Tage am 24.12. und 31.12.
  • Maßnahmen des betrieblichen Gesundheitsmanagements, Hochschulsport und Firmenfitness
  • Arbeiten in verkehrsgünstiger Lage mit bester VRN‑ und DB‑Anbindung, nextbike Sharing und JobBike
  • Fahrkostenzuschüsse bei Nutzung des Jobtickets

Die Technische Hochschule Mannheim trägt das Prädikat „Total E‑Quality“.

  • Der Gehaltsrahmen in EG13 beträgt 47.459,29€ – 67.455,86€ pro Jahr.
  • Schwerbehinderte Bewerber*innen (w/m/d) werden bei entsprechender Eignung vorrangig berücksichtigt.
  • Um den Anteil von Mitarbeiterinnen zu erhöhen, werden qualifizierte Frauen ausdrücklich zur Bewerbung aufgefordert. Bei Fragen rund um die Gleichstellung, wenden Sie sich gerne an die Gleichstellungsbeauftragte, Frau Prof. Dr. Jessica Steinberger, E‑Mail: gleichstellung(at)th-mannheim.de.
Ansprechpartner*innen
  • Fachliche Fragen beantwortet Ihnen Prof. Dr. Simeon Sauer (s.sauer(at)th-mannheim.de).
  • Personalfragen wenden Sie sich bitte an den Geschäftsbereich Personal (bewerberfragen(at)th-mannheim.de).

Die eingereichten Bewerbungsunterlagen werden nach Beendigung des Auswahlverfahrens datenschutzkonform gelöscht bzw. vernichtet. Beachten Sie hierzu auch unsere Datenschutzerklärung.

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