Bioinformatiker/ Omics Engineer (m/w/d)

Limbach Gruppe SE; Mainz; Vor Ort; EUR 55.000 - 75.000; Vollzeit

Zusammenfassung

Ein führendes Unternehmen in der medizinischen Diagnostik in Mainz sucht einen Bioinformatiker. Sie verantworten den Aufbau und Betrieb von Speichersystemen für NGS-Daten und optimieren Analyse-Workflows. Voraussetzung ist ein Hochschulabschluss in Bioinformatik oder Informatik sowie sehr gute Programmierkenntnisse in Python. Die Stelle bietet Flexibilität und ein modernes Arbeitsumfeld.

Leistungen

Regelmäßige Fort- und Weiterbildungen

Moderne Geräteausstattung im Labor

Flexibles Arbeitsmodell mit Home-Office-Möglichkeiten

Qualifikationen

• Strukturierte Arbeitsweise und Erfahrung in der Dokumentation.
• Erfahrung in einem regulierten Bereich ist ein Plus.
• Fähigkeit zur Entwicklung moderner Web-Anwendungen ist von Vorteil.

Aufgaben

• Aufbau und Betrieb von Speichersystemen für NGS-Daten.
• Wartung und Optimierung von Analyse-Workflows.
• Gestaltung des eigenen Aufgabenbereichs.

Kenntnisse

Python

Git

Bioinformatische Fragestellungen

TypeScript

SQL

Bash

Snakemake

Ansible

Docker

Ausbildung

Hochschulabschluss in Bioinformatik/Informatik oder vergleichbar

Jobbeschreibung

Uns ist bewusst, dass sich unsere ambitionierten Ziele nur mit einem exzellenten Team verwirklichen lassen, daher suchen wir zum nächstmöglichen Zeitpunkt in Vollzeit für unseren Standort Mainz:

Ihre Aufgaben

• Aufbau und Betrieb von Systemen für die Speicherung und den Transfer großer NGS- Datenmengen sowie biomedizinischer Phänotypdaten, auch über Standortgrenzen hinweg
• Aufbau, Wartung und Betrieb von Workflows für die Analyse von NGS Daten mit dem Schwerpunkt genomischer Varianten
• Optimierung von programmatischen Arbeitsabläufen hinsichtlich Monitoring und Robustheit der eingesetzten Workflows

Erfolgreicher Hochschulabschluss (Bachelor, Master, oder vergleichbar) in einem Fach wie Bioinformatik/Informatik oder vergleichbare Qualifikation

Sie arbeiten sehr strukturiert und haben Erfahrung mit der Dokumentation Ihrer Arbeit

Erfahrung mit bioinformatischen Fragestellungen für die Auswertung humangenetischer Daten ist ein starkes Plus

Sie haben sehr gute Programmierkenntnisse in Python und Erfahrung mit Git. Erfahrungen in TypeScript/R/SQL/Bash/etc. sind ein starkes Plus

Erfahrung mit Workflow Management Systemen wie Snakemake ist ein starkes Plus

Erfahrung mit "shared code ownership" und Code Reviews ist ein Plus

Kenntnisse in der Verwendung von Konfigurationsmanagementsystemen wie Ansible und im Einsatz von Container-basierten Methoden wie Docker sind ein Plus

Erfahrung in einem regulierten Bereich mit Qualitätsmanagementsystemen und relevanten DIN/ISO Normen ist ein Plus

Erfahrung bei der Entwicklung moderner Web-Anwendungen ist ein Plus

Große Flexibilität und Freiheit, eigene Ideen umzusetzen und ein modernes Arbeitsumfeld mitzugestalten

Möglichkeit des Aufbaus und der Mitgestaltung des eigenen Aufgabenbereichs zur effizienten Ausgestaltung der vielfältigen Aufgabenbereiche

Ein sicherer Arbeitsplatz mit langfristiger Perspektive und Wachstumspotenzial

Herausfordernde und verantwortungsvolle Aufgaben in einem sich rasant entwickelnden und innovativen Bereich der medizinischen Diagnostik mit großem nationalen und internationalen Netzwerk

Ein motiviertes und lösungsorientiertes Team, in dem Sie sich gemeinsam mit dem Unternehmen weiterentwickeln und wachsen können

Regelmäßige Fort- und Weiterbildungen

Laborneubau mit modernster Geräteausstattung

Ein modernes, zeitgemäßes Arbeitsmodell mit Flexibilität und Offenheit für Home-Office-Arbeitsweisen

Wenn wir Ihr Interesse geweckt haben, freuen wir uns über Ihre vollständige Bewerbung unter Angabe Ihrer Gehaltsvorstellung und des frühestmöglichen Eintrittstermins.

Für eine erste Kontaktaufnahme steht Ihnen Frau Anita Dyrbusch, Tel. gerne zur Verfügung.