Postdoktor inom ekoevolutionär mikrobiomforskning och termobiologi

Lund University; Lunds kommun; On-site; SEK 520,000 - 700,000; Full time

Job summary

Lund University söker en postdoktor i evolutionär ekologi/mikrobiologi med inriktning mot HOTGUT-forskning. Anställningen är tvåårig och placeras vid Biologiska institutionen, Lunds universitet, och inleds 1 mars 2027.

Du kommer att leda och samordna forskningsaktiviteter i projektet. Arbetsuppgifter inkluderar fältarbete, insamling av prover, mikrobiometänkande, analys av 16S rRNA och utveckling av reproducerbara bioinformatiska arbetsflöden samt bidrag till publikationer och presentationer.

Qualifications

• Doktorsexamen i ämnesområde som är relevant för anställningen.
• Goda bioinformatiska kunskaper och reproducerbar analys av data från amplikonsekvensering.
• Goda kvantitativa kunskaper och avancerad statistisk analys i R.
• Mycket god engelska i tal och skrift.
• Giltigt körkort för bil för fältarbete.

Responsibilities

• Planera, etablera, samordna och genomföra experimentella fältstudier.
• Samla in och bearbeta biologiska prover och bidra till laboratorieprotokoll.
• Utföra mikrobiologiskt laboratoriearbete med fokus på mikrobiomet och 16S rRNA.
• Utveckla reproducerbara bioinformatiska och statistiska arbetsflöden.
• Bidra till dataanalyser, publikationer och kommunikation av resultat.

Skills

Bioinformatic skills

Statistical analysis in R

Reproducible sequencing data analysis

Education

Doktorsexamen i evolutionær ekologi

Doktorsexamen i ekologisk fysiologi

Doktorsexamen i mikrobiologi eller bioinformatik

Tools

R

Job description

Ämnesbeskrivning

Tjänsten är en del av forskningsprojektet “From Guts to Growth: Unravelling the Gut Microbiome’s Role in Ontogenetic Trajectories toward Climate Stress Resilience” (HOTGUT). Projektet undersöker hur miljöstress, tarmmikrobiomet och värdorganismens fysiologi samverkar under den tidiga utvecklingen och hur detta påverkar tillväxt, metabolism, temperatureglering och motståndskraft mot klimatrelaterad extremvärme. Forskningen bedrivs på vilda talgoxar (Parus major) och kombinerar kontrollerade fältexperiment med laboratoriebaserad mikrobiologi, fysiologiska mätningar och bioinformatiska analyser. Den anställde kommer att ha en ledande operativ roll i planeringen, etableringen, samordningen och genomförandet av projektets forskningsaktiviteter. Dessa omfattar experiment om termisk och hormonell stress tidigt i livet samt mikrobiomets funktion och överföring. Anställningen kräver därför en självständig forskare som motiveras av att kombinera fältarbete och experimentella manipulationsstudier med laboratorieanalyser och dataanalys.

Arbetsuppgifter

Huvuduppgiften Är Att Genomföra Och Samordna Forskningen Inom HOTGUT i Nära Samarbete Med Projektledaren Och Samarbetspartners. Arbetsuppgifterna Omfattar Att

• Planera, etablera, samordna och genomföra experimentella fältstudier.
• Samla in och bearbeta biologiska prover, inklusive avförings-, munhåle-, kloak-, blod- och miljöprover, samt bidra till utveckling av laboratorieprotokoll för mikrobiom- och fysiologiska analyser.
• Utföra mikrobiologiskt laboratoriearbete med fokus på mikrobiomet, inklusive DNA-extraktion, biblioteksberedning, kvalitetskontroll och förberedelser för amplikonsekvensering av 16S rRNA.
• Utveckla, underhålla och tillämpa reproducerbara bioinformatiska och statistiska arbetsflöden.
• Bidra till dataanalyser, vetenskapliga publikationer, konferenspresentationer, hantering av data och kod, öppna forskningsmetoder samt kommunikation av resultat till vetenskapliga och bredare målgrupper.

Behörighet

Behörig att anställas som postdoktor är den som avlagt doktorsexamen, eller utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen, inom anställningens ämnesområde och som avlagts högst tre år före datum för anställningsbeslut. Om det finns särskilda skäl kan doktorsexamen ha avlagts tidigare.

Bedömningsgrunder

Detta är en meriteringsanställning främst inriktad på forskning. Anställningen är tänkt som ett inledande steg i karriären och bedömningen av de sökande kommer i första hand att baseras på deras vetenskapliga meriter och potential som forskare. Särskild vikt kommer att fästas vid vetenskaplig förmåga inom ämnesområdet.

Vid anställning av postdoktor ska följande utgöra grund för bedömning:

• God förmåga att utveckla och genomföra forskning av god kvalitet.
• Pedagogisk förmåga.

Kvalifikationskrav

För Anställningen Krävs

• Doktorsexamen i evolutionär ekologi, ekologisk fysiologi, mikrobiologi, bioinformatik, ornitologi eller något annat område som är relevant för anställningen.
• Goda bioinformatiska kunskaper och erfarenhet av reproducerbar analys av data från amplikonsekvensering.
• Goda kvantitativa kunskaper, inklusive avancerad statistisk analys i R och erfarenhet av hierarkiska mixade modeller samt multivariata modeller.
• Mycket god förmåga att uttrycka sig muntligt och skriftligt på engelska.
• Giltigt körkort för personbil för att kunna genomföra fältarbete.

Bedömningsgrunder och övriga meriter

Följande Kvalifikationer Är Meriterande

• Erfarenhet av arbete med vilda fåglar, särskilt hålhäckande tättingar, inklusive fågelhantering, ringmärkning, bokontroller, blodprovstagning eller andra relevanta fältmetoder.
• Erfarenhet av termofysiologiska metoder såsom respirometri och mätning av kroppstemperatur.
• Erfarenhet av endokrina analyser, analyser av oxidativ stress, metabolomik eller andra molekylära och fysiologiska analyser som är relevanta för projektet.

Särskild vikt kommer att läggas vid vetenskaplig mognad, självständighet, noggranna och kontrollerade arbetssätt, problemlösningsförmåga samt förmåga att ta ansvar för det praktiska genomförandet av forskningsprogrammet.

Hänsyn kommer också att tas till hur den sökandes kompetens kompletterar projektgruppen och stärker forskningen i gränslandet mellan evolutionär ekologi, mikrobiologi och bevarandefysiologi.

Anställningsvillkor

Anställningen är en tidsbegränsad anställning som postdoktor på heltid under 2 år med tillträde den 1 mars 2027 eller så snart som möjligt därefter. Anställningen är placerad vid Biologiska institutionen, Lunds universitet. Anställningen tidsbegränsas enligt avtal, “Avtal om tidsbegränsad anställning som postdoktor”, mellan arbetsmarknadens parter daterat 2022-02-01 (Arbetsgivarverket, OFR:s, och Saco-S). Fältarbetet kommer huvudsakligen att genomföras under fåglarnas häckningssäsong och kan kräva flexibla arbetstider under intensiva experimentperioder.

Kontaktuppgifter

Dr Katharina Ruthsatz - projektledare: [e-mail]

Dr Andreas Nord - [e-mail], [phone]