Postdoktor i organisk kemi

Lund University; Lunds kommun; On-site; SEK 420,000 - 540,000; Full time

Job summary

Lorsk universitets Institution för Organisk Kemi vid Lunds universitet söker en postdoktor inom organisk kemi med inriktning mot gränssnittet till kemisk biologi. Projektet syftar till utveckling av BacPROTACs och rekrytering av bakteriens proteolytiska maskineri för selektiv nedbrytning i multiresistenta S.

aureus. Du kommer att arbeta i nära samarbete med infektionsbiologiska forskargrupper och bidra till design, syntes, karakterisering och tillämpning av analysmetoder samt handledning av

Qualifications

• Doktorsexamen inom relevanta ämnesområdet; avlagts högst tre år före beslut.
• Mycket goda kunskaper i engelska i tal och skrift.
• Erfarenhet av flerstegssyntes inom organisk kemi och rening av små molekyler.
• Erfarenhet av biokemiska eller cellbaserade analyser och arbeten i gränssnittet kemi–biologi.

Responsibilities

• Genomföra forskning inom organisk kemi i gränssnittet mot kemisk biologi.
• Utföra flerstegssyntes och rening av små molekyler.
• Bedöma och dokumentera struktur–aktivitet samt nedbrytningssamband.
• Utveckla och tillämpa analysmetoder (assay) för proteinnedbrytning och antibakteriell aktivitet.
• Handledning av examensarbetare och doktorander.
• Delta i grupp- och projektmöten samt administration kopplad till arbetsuppgifterna.

Skills

Organisk kemi

Flerstegs-syntes

PROTACs

Proteinnedbrytning

Engelska flytande

Dokumentation

Självständigt arbete

Education

Doktorsexamen inom relevant ämnesområde

Tools

NMR

LC-MS

HRMS

IR

Job description

Särskild ämnesbeskrivning

Ämnet för anställningen är organisk kemi i gränssnittet mot kemisk biologi. Forskningen avser utveckling av en modulär kemisk plattform för riktad proteinnedbrytning i bakterier (BacPROTACs) som en ny strategi mot antibiotikaresistens. Bifunktionella molekyler designas och syntetiseras för att rekrytera bakteriens eget proteolytiska maskineri, såsom ClpC:ClpP-systemet, och därigenom selektivt bryta ned essentiella proteiner i multiresistenta Staphylococcus aureus istället för att inhibera dem.

Särskild ämnesbeskrivning

Ämnet för anställningen är organisk kemi i gränssnittet mot kemisk biologi. Forskningen avser utveckling av en modulär kemisk plattform för riktad proteinnedbrytning i bakterier (BacPROTACs) som en ny strategi mot antibiotikaresistens. Bifunktionella molekyler designas och syntetiseras för att rekrytera bakteriens eget proteolytiska maskineri, såsom ClpC:ClpP-systemet, och därigenom selektivt bryta ned essentiella proteiner i multiresistenta Staphylococcus aureus istället för att inhibera dem.

Arbetet omfattar hela kedjan från molekyl-design och flerstegssyntes av nedbrytarmolekyler – uppbyggda av målsökande ligander, varierbara linkers och proteasrekryterande motiv – till biokemisk och mikrobiologisk utvärdering av dessa molekyler. Den som anställs förväntas därför arbeta aktivt på båda sidor av detta gränssnitt, och i särskild grad delta i utveckling, validering och tillämpning av analysmetoder (assays) för proteinnedbrytning och antibakteriell aktivitet. Projektet genomförs i nära samarbete med en infektionsbiologisk forskargrupp vid Lunds universitet, som bidrar med etablerade infektionsrelevanta bakteriemodeller och omics-arbetsflöden.

Arbetsuppgifter

I arbetsuppgifterna som postdoktor ingår främst att bedriva forskning. Inom ramen för anställningen ska det ges möjlighet till tre veckors högskolepedagogisk utbildning.

Arbetsuppgifterna Innefattar Även

• Design och flerstegssyntes av bifunktionella nedbrytarmolekyler (BacPROTACs), inklusive ligander, linkers och proteasrekryterande element.
• Utveckling, validering och rutinmässig tillämpning av biokemiska analysmetoder för målinteraktion och proteinnedbrytning, inklusive arbete med rekombinanta bakteriella proteiner.
• Utvärdering av substansers antibakteriella aktivitet mot S. aureus, i samarbete med partnerlaboratoriet.
• Omfattande karakterisering och renhetsbestämning av substanser med NMR, LC-MS, HRMS, IR och kromatografiska metoder.
• Tolkning och dokumentation av struktur–aktivitets- och struktur–nedbrytningssamband som underlag för nästa designcykel.
• Handledning av examensarbetare och doktorander.
• Samverkan med näringsliv och samhälle.
• Deltagande i grupp- och projektmöten samt seminarier.
• Administration kopplat till arbetsuppgifterna ovan.

Behörighet

Behörig att anställas som postdoktor är den som avlagt doktorsexamen, eller utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen, inom anställningens ämnesområde och som avlagts högst tre år före datum för anställningsbeslut. Om det finns särskilda skäl kan doktorsexamen ha avlagts tidigare.

Övriga Krav

• Mycket goda kunskaper i engelska, i tal och skrift.
• Dokumenterad erfarenhet av flerstegssyntes inom organisk kemi, inklusive rening och strukturkarakterisering av små molekyler.
• Dokumenterad erfarenhet av experimentellt arbete i gränssnittet mellan kemi och biologi, såsom biokemiska, enzymatiska, cellbaserade eller mikrobiologiska analysmetoder.
• Förmåga att arbeta självständigt samt på ett strukturerat och tillförlitligt sätt, och att dokumentera och rapportera experimentellt arbete korrekt.

Bedömningsgrunder

Detta är en meriteringsanställning främst inriktad på forskning. Anställningen är tänkt som ett inledande steg i karriären och bedömningen av de sökande kommer i första hand att baseras på deras vetenskapliga meriter och potential som forskare.

Särskild vikt kommer att fästas vid vetenskaplig förmåga inom ämnesområdet.

Vid anställning av postdoktor ska följande utgöra grund för bedömning:

• God förmåga att utveckla och genomföra forskning av god kvalitet.
• Pedagogisk förmåga.

Övriga Meriter

• Förmågan att kombinera syntetisk organisk kemi med kemisk biologi inom ett och samma projekt är starkt meriterande och utgör den centrala kompetens som söks för anställningen.
• Erfarenhet av metodutveckling av analysmetoder (assay development), inklusive att etablera, felsöka och validera nya biokemiska eller cellbaserade analyser, är starkt meriterande.
• Erfarenhet av bifunktionella molekyler såsom PROTACs, molecular glues eller andra riktade proteinnedbrytare är starkt meriterande.
• Erfarenhet av uttryck, rening och hantering av rekombinanta proteiner är meriterande.
• Erfarenhet av mikrobiologi och antibakteriell känslighetstestning, såsom MIC-bestämning, time-kill-analyser eller biofilmsanalyser, är meriterande.
• Erfarenhet av proteomik, kemoproteomik eller transkriptomik är meriterande.
• Erfarenhet av medicinalkemi, inklusive substansdesign och arbete med struktur–aktivitetssamband, är meriterande.
• Erfarenhet av peptid- eller peptidomimetisk kemi är meriterande.
• Erfarenhet av fotoredoxkatalys eller radikalkemi är meriterande.
• Erfarenhet från läkemedelsindustrin eller kontraktsforskning är meriterande.
• Dokumenterad förmåga att publicera forskningsresultat i internationella referentgranskade tidskrifter.

Hänsyn kommer också att tas till god samarbetsförmåga, driv och självständighet samt hur den sökande genom sin erfarenhet och kompetens bedöms komplettera och stärka pågående forskning inom institutionen samt bidra till dess framtida utveckling.

Villkor

Anställningen är tidsbegränsad till max två år och avser heltid. Anställningen tidsbegränsas enligt avtal, “Avtal om tidsbegränsad anställning som postdoktor”, mellan arbetsmarknadens parter daterat 2022-02-01 (Arbetsgivarverket, OFR:s, och Saco-S).