Postdoctoral scholar in single cell proteomics

Karolinska Institutet; Huddinge kommun; On-site; SEK 469,000 - 603,000; Full time

Job summary

Karolinska Institutet i Stockholm söker en postdoktor som kommer att arbeta med karakterisering av avancerade tekniker för läkemedelsleverans och undersöka deras mål och mekanismer med proteomikbaserade metoder.

Projektet fokuserar på målmolekyler, EV och lipidnanopartiklar samt kvantitativ proteomik inklusive encellsproteomik och fosfoproteomik i sjukdomsmodeller.

Qualifications

• Doktorsexamen i masspektrometri/baserad proteomik eller nära sammanhang.
• Praktisk erfarenhet av proteomik och provberedning för LC-MS/MS.
• Meriterande med encellsproteomik och fosfoproteomik.

Responsibilities

• Karakterisering av tekniker för läkemedelsleverans och deras verkningsmekanismer.
• Undersöka mål som EV och lipidnanopartiklar i cellmodeller.
• Utveckla masspektrometribaserade arbetsflöden och analysera komplexa prover.

Skills

Mass spectrometry

LC-MS/MS analysis

Quantitative proteomics

Single-cell proteomics

Phosphoproteomics

Team collaboration

Education

PhD in relevant field

Tools

LC-MS/MS

Job description

Vill du bidra till medicinsk forskning av högsta kvalitet?

Institutionen för laboratoriemedicin består av sju avdelningar som bedriver både forskning och undervisning. Vår forskning omfattar både grundforskning och tillämpad forskning. Samtliga avdelningar arbetar i nära samarbete med kliniskt verksamma forskare och läkare vid Karolinska Universitetssjukhuset. Avdelningen för biomolekylär och cellulär medicin (BCM) fokuserar på användningen av modifierade biomolekyler, celler och cellprodukter som nya terapeutiska behandlingar, samt på identifiering och studier av lämpliga biomolekylära och cellulära mål för terapi och diagnostik. Avdelningen är även knuten till Karolinska ATMP Center.

Vår forskning i EL Andaloussis forskargrupp fokuserar på en av de största utmaningarna inom modern terapi: att leverera makromolekyler till specifika målceller in vivo. Trots att framsteg inom biomedicinsk forskning har gett oss en aldrig tidigare skådad kunskap om sjukdomar och deras mekanismer är många lovande terapeutiska metoder fortfarande inte tillgängliga för klinisk användning. En viktig anledning är att det saknas effektiva metoder för att leverera dessa terapier till rätt organ och i rätt dos. Vår forskning är därför inriktad på att utveckla nya och innovativa tekniker för läkemedelsleverans som på ett säkert och effektivt sätt kan transportera proteiner, RNA eller genterapier till de vävnader där de behövs.

En av de leveransmodaliteter som vi arbetar med är extracellulära vesiklar (EV), naturliga nanopartiklar som kan transportera genetiskt material från en cell till en annan. Vi har utvecklat ett flertal gentekniska strategier för att modifiera EV för användning inom läkemedelsleverans. Ett annat forskningsområde är användningen av modifierade lipidnanopartiklar för cellmodifiering in vivo.

Som postdoktor kommer du att arbeta med karakterisering av avancerade tekniker för läkemedelsleverans samt undersöka deras mål, verkningsmekanismer och biologiska effekter med hjälp av masspektrometribaserad proteomik. Arbetet kommer att fokusera på leveranssystem som utvecklats för terapeutiska makromolekyler, inklusive ASO, siRNA, proteiner och andra nukleinsyrabaserade terapier, samt leveransplattformar såsom extracellulära vesiklar och lipidnanopartiklar (LNP).

En stor del av forskningen kommer att baseras på avancerade kvantitativa proteomikmetoder, inklusive provberedning, LC-MS/MS-analys och bioinformatisk analys av proteomikdata. Arbetet kommer dessutom att omfatta encellsproteomik för att undersöka cellspecifika svar på läkemedelsleverans samt fosfoproteomik för att karakterisera signalvägar och verkningsmekanismer. Dessa metoder kommer att tillämpas på sjukdomsrelevanta cell- och vävnadsmodeller för att utvärdera molekylära effekter, specificitet och biologiska konsekvenser av olika leveranstekniker och terapeutiska interventioner.

Vem är du?

Behörig sökande till denna postdoktorstjänst ska ha avlagt doktorsexamen högst sju år före den sista dagen för anställningen som postdoktor. Denna tidsperiod kan förlängas vid särskilda omständigheter.

Den sökande ska ha en gedigen bakgrund inom masspektrometribaserad proteomik. Tjänsten kräver praktisk laboratorieerfarenhet av provberedning för proteomik, LC-MS/MS-analys samt kvantitativ analys av proteomikdata.

Erfarenhet av avancerade proteomikmetoder, inklusive encellsproteomik och fosfoproteomik, är särskilt meriterande. Erfarenhet av proteomikbaserade studier av läkemedelssvar, verkningsmekanismer, cellsignalering eller tekniker för läkemedelsleverans är en fördel. Den ideala kandidaten har dessutom erfarenhet av utveckling och optimering av masspektrometribaserade arbetsflöden för proteomik samt analys av komplexa biologiska prover.

Mycket goda kunskaper i engelska, både i tal och skrift, är ett krav. Vi söker en engagerad, driven och passionerad person som trivs med att arbeta i team och aktivt bidrar till forskargruppens arbete.

Vi erbjuder en kreativ och inspirerande forskningsmiljö med bred kompetens och ett stort spektrum av forskningsområden. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vi bedriver medicinsk forskning i internationell framkant och erbjuder Sveriges bredaste utbud av medicinska utbildningar.

På KI får du möjlighet att samarbeta med forskare från olika discipliner och därigenom ta del av ett brett spektrum av metoder, kompetenser och vetenskapliga perspektiv. Tvärvetenskapligt samarbete är en central del av KI internationellt ledande forskning. Närheten till hälso- och sjukvården bidrar samtidigt till att både utbildning och forskning förblir kliniskt relevanta och kan skapa konkret nytta.

Tjänsten är placerad i EL Andaloussis forskargrupp, som har omfattande erfarenhet av EV-baserad läkemedelsleverans, genredigering, sjukdomsmodellering och translationell forskning. Projektet uppmuntrar tvärvetenskapligt tänkande och erbjuder goda möjligheter till karriärutveckling för forskare med olika vetenskapliga bakgrunder.

Anställningsform Tidsbegränsad anställning

Anställningens omfattning

Tillträde

Tillträde Enligt överenskommelse

Löneform Månadslön

Antal lediga befattningar

Sysselsättningsgrad

Referensnummer

Facklig företrädare

• Tarja Schröder, OFR, [e-mail]