Postdoctoral Researcher in Population Pharmacogenetics

Karolinska Institutet; Stockholms kommun; Hybrid; SEK 424,000 - 580,000; Part time

Job summary

Karolinska Institutet söker postdoktor som kommer att ingå i vårt forskningsprogram inom populationsfarmakogenetik och precisionsmedicin, med fokus på genetisk variation i afrikanska populationer och dess betydelse för läkemedelssvar. Projektet kombinerar populationsgenetik och beräkningsbaserad genetik.

Den framgångsrika kandidaten bör ha doktorsexamen inom relevanta området och erfarenhet av NGS-dataanalys, samt programmering i R och/eller Python, och kunna arbeta självständigt i

Qualifications

• Doktorsexamen inom relevanta område.
• Erfarenhet av farmakogenetisk/humangenetisk forskning, gärna afrikanska populationer.

Responsibilities

• Utföra beräkningsbaserade genetiska analyser och tolkning av varianter.
• Genotyp–fenotyp-analys och haplotyp-karakterisering.
• Samarbeta internationellt och bidra till validering med molekylära metoder.

Skills

NGS-dataanalys

R-programmering

Python-programmering

självständigt arbete

internationella samarbeten

Education

Doktorsexamen inom farmakogenetik/farmakogenomik

Postdoktoral erfarenhet

Tools

R

Python

Beräkningsbaserade genetiska analyser

Job description

Vill du bidra till att förbättra människors hälsa?

Den person som anställs kommer att ingå i vårt forskningsprogram inom populationsfarmakogenetik och precisionsmedicin, med fokus på genetisk variation i afrikanska populationer och dess betydelse för läkemedelssvar. Projektet syftar till att identifiera och funktionellt karakterisera farmakogenetiska varianter av betydelse för läkemedelseffekt, farmakokinetik och biverkningar med hjälp av storskaliga genomiska och farmakogenomiska dataset. Arbetet kommer att kombinera populationsgenetik och beräkningsbaserad genetik – inklusive genotyp–fenotypanalyser, karakterisering av haplotyper i farmakogener, analys av sällsynta och strukturella varianter samt beräkningsbaserad prediktion av varianters funktion – med integrering av funktionella och kliniska data. Utvalda varianter kommer att prioriteras för experimentell validering med cellulära och molekylära metoder. Kandidaten förväntas arbeta med en hög grad av självständighet och samtidigt bidra till multidisciplinära och internationella samarbeten.

Vem är du?

För att anställas som postdoktor krävs avlagd doktorsexamen eller en utländsk examen som bedöms motsvara en svensk doktorexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Det är meriterande om du har avlagt din doktorsexamen inom de tre senaste åren, om det finns särskilda skäl kan din examen ha avlagts tidigare.

Den framgångsrika kandidaten bör ha:

• Doktorsexamen inom farmakogenetik/farmakogenomik, humangenetik, molekylär medicin, bioinformatik, farmakologi eller ett närliggande område.
• Dokumenterad erfarenhet av farmakogenetisk eller humangenetisk forskning, företrädesvis med fokus på afrikanska populationer eller andra genetiskt diversifierade och underrepresenterade populationer.
• Erfarenhet av analys och tolkning av data från nästa generations sekvensering (NGS), inklusive riktad sekvensering, hel-exomsekvensering och/eller helgenomsekvensering.
• Gedigen kompetens inom beräkningsbaserade genetiska analyser, inklusive annotering och prioritering av genetiska varianter, genotyp–fenotyp-associationsanalyser samt populationsgenetiska metoder.
• Erfarenhet av farmakogenspecifika analyser, inklusive tolkning av genetisk variation i läkemedelsmetaboliserande enzymer, transportproteiner och/eller läkemedelsmål.
• Erfarenhet av analys och tolkning av sällsynta varianter, haplotyper samt strukturella eller splitsningspåverkande varianter är meriterande.
• Erfarenhet av beräkningsbaserade metoder för att förutsäga funktionella konsekvenser av genetiska varianter är meriterande.
• Goda kunskaper inom programmering och dataanalys, företrädesvis i R, Python och/eller andra relevanta bioinformatiska verktyg.
• Kandidaten ska kunna arbeta självständigt och samtidigt bidra effektivt till multidisciplinära och internationella samarbeten.

En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet en statlig myndighet. Det gör att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal.Medarbetare på KI erbjuds också möjlighet till ett flexibelt arbetssätt. Det innebär att om den verksamhet du jobbar i tillåter, så kan du arbeta en del av din arbetstid på distans. Du får även träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar där utbildad personal finns på plats.

Anställningsform Särskild visstidsanställning

Anställningens omfattning

Löneform Månadslön

Antal lediga befattningar

Sysselsättningsgrad

Referensnummer

Facklig företrädare