Postdoctoral researcher in structural bioinformatics and bacteriophage protein evolution

Lund University; Lunds kommun; On-site; SEK 420,000 - 540,000; Full time

Benefits offered by this job

Generös semester

Tjänstepension

Tillgång till högpresterande beräknres

Lunds universitet – statlig myndighet

Job summary

Lunds universitet söker en postdoktor inom strukturell bioinformatik och evolution av bakteriofagproteiner vid Institutionen för experimentell medicinsk vetenskap i Lund. Du blir en del av Proteinevolution-gruppen och arbetar med proteinstrukturprediktion, jämförande genomik och evolutionsanalyser.

Anställningen är två år, heltid, och placering sker på plats vid Biomedicinskt centrum (BMC) i Lund. Du samarbetar nära forskare inom beräkningsvetenskap och experimentell forskning samt utvecklar

Qualifications

• Doktorsexamen eller motsvarande examen inom bioinformatik, molekylärbiologi, mikrobiologi eller närliggande ämne.
• God förmåga att utveckla och genomföra forskning av hög kvalitet.
• Goda programmeringskunskaper.
• Ingående kunskaper om bakteriofagers molekylärbiologi.
• Omfattande erfarenhet av prediktion av proteinstrukturer och användning i forskning.
• Publicerad forskning om bakteriofager i välrenommerade tidskrifter.

Responsibilities

• Bedriva beräkningsinriktad forskning med Python och storskalig prediktion av proteinstrukturer.
• Arbeta nära forskargruppen och externa samarbetspartners.
• Utveckla din självständighet som forskare.
• Möjlighet att medverka i undervisning och handledning av masterstudenter.

Skills

Forskning inom bioinformatik

Programmeringskunskaper

Publicerad forskning

Tvärvetenskapligt samarbete

Education

Doktorsexamen inom bioinformatik eller närliggande ämne

Job description

Postdoktor inom strukturell bioinformatik och evolution av bakteriofagproteiner

Lunds universitet, Institutionen för experimentell medicinsk vetenskap

Lunds universitet grundades 1666 och rankas återkommande som ett av världens främsta lärosäten. Här finns omkring 46 000 studenter och 8 500 medarbetare i Lund, Helsingborg och Malmö. Vi förenas i vår strävan att förstå, förklara och förbättra vår värld och människors villkor.

Lunds universitet välkomnar sökande med olika bakgrund och erfarenheter. Jämställdhet, lika villkor och mångfald är grundläggande principer för alla delar av vår verksamhet.

Beskrivning av arbetsplatsen

Som postdoktor blir du en del av forskargruppen Proteinevolution, som leds av Gemma C. Atkinson vid Institutionen för experimentell medicinsk vetenskap, Lunds universitet. Vi använder jämförande genomik, känsliga metoder för att förutsäga proteinfunktion och strukturell bioinformatik för att undersöka hur mikrobiella konflikter utvecklas och fungerar på molekylär nivå, särskilt samspelet mellan bakterier och bakteriofager. Vår beräkningsinriktade forskning är nära integrerad med experimentellt arbete genom samarbeten inom mikrobiologi, biokemi och strukturbiologi.

Projektbeskrivning

Bakteriofager kodar för många proteiner vars funktioner och interaktionspartner ännu är okända. I projektet kombinerar du proteinstruktur- och komplexprediktion med jämförande genomik och evolutionsanalyser för att undersöka interaktioner mellan bakteriofagproteiner och mellan fagproteiner och deras bakteriella värdar. Målet är att upptäcka tidigare okända molekylära interaktioner och förstå hur proteiners evolution påverkar deras funktion i fagbiologi och virus–värdinteraktioner. De beräkningsbaserade förutsägelserna ger upphov till hypoteser som kan undersökas experimentellt tillsammans med våra samarbetspartner.

Arbetsuppgifter och ansvarsområden

Du kommer att bedriva beräkningsinriktad forskning med Python-programmering och storskalig prediktion av proteinstrukturer med hjälp av högpresterande beräkningsresurser. Du kommer att arbeta nära andra medlemmar i forskargruppen och externa samarbetspartner. Anställningen ger dig möjlighet att utveckla din självständighet som forskare och bredda din vetenskapliga kompetens. Det kan även finnas möjlighet att medverka i undervisning och få erfarenhet av handledning av masterstudenter.

Kvalifikationer

Krav för anställningen är:

• Du har doktorsexamen eller motsvarande utländsk examen inom bioinformatik, molekylärbiologi, mikrobiologi eller ett närliggande ämne. Doktorsexamen ska vara avlagd senast vid tidpunkten då anställningsbeslut fattas.
• Du har god förmåga att utveckla och genomföra forskning av hög kvalitet.
• Du har goda programmeringskunskaper.
• Du har ingående kunskaper om bakteriofagers molekylärbiologi.
• Du har omfattande erfarenhet av prediktion av proteinstrukturer och av att använda sådana prediktioner i biologisk forskning.
• Du har publicerat forskning om bakteriofager i välrenommerade vetenskapliga tidskrifter.

Meriterande för anställningen är:

• Främst kommer den sökande i fråga som avlagt examen högst tre år före sista ansökningsdag.
• Du har erfarenhet av att förutsäga funktioner hos proteiner med okänd funktion genom att integrera information om sekvens, struktur och genomisk kontext.
• Du har erfarenhet av tvärvetenskapliga forskningssamarbeten.
• Du har utvecklat bioinformatiska verktyg med öppen källkod.
• Du har god pedagogisk förmåga.

Bedömningen av de sökande kommer i första hand att baseras på deras vetenskapliga meriter och potential som forskare. Särskild vikt kommer att fästas vid vetenskaplig förmåga inom ämnesområdet.

Vi erbjuder en tvärvetenskaplig forskningsmiljö där bioinformatik, mikrobiologi, biokemi och strukturbiologi möts för att undersöka proteiners funktion och evolution. Du kommer att samarbeta nära med forskare inom både beräkningsvetenskap och experimentell forskning och ha tillgång till högpresterande beräkningsresurser. Anställningen ger dig möjlighet att utveckla egna forskningsidéer, bygga internationella samarbeten och få erfarenhet av undervisning och handledning.

Lunds universitet är en statlig myndighet vilket innebär att du får särskilda förmåner, generös semester och en förmånlig tjänstepension. Läs mer på universitetets webbplats om att vara anställd hos oss Jobba hos oss .

Om anställningen

Anställningen är en visstidsanställning på två år, 100% med startdatum 2027-02-01 eller enligt överenskommelse. Anställningar vid Lunds universitet bedrivs i Sverige och du kommer att vara placerad vid Biomedicinskt centrum (BMC) i Lund och förväntas utföra ditt arbete på plats.

Anställningen är tidsbegränsad till minst två år, max tre år enligt kollektivavtal om tidsbegränsad anställning som postdoktor (Arbetsgivarverket). En anställning som postdoktor är tänkt som ett inledande steg i karriären och som en möjlighet att ytterligare fördjupa och bredda forskningskompetens.

Mer information om Medicinska fakulteten

Medicinska fakulteten är ett verksamhetsområde inom Lunds universitet, med ansvar för utbildning och forskning inom medicin, vård och hälsa. Utbildningen sker i nära samverkan med sjukvården och är väl förankrad i fakultetens starka forskningstradition. Fakultetens forskning spänner över ett brett fält inom experimentell grundforskning, patientnära klinisk forskning och hälsovetenskaplig forskning. Medicinska fakulteten, med drygt 1800 anställda och 3000 studenter i Lund, Malmö och Helsingborg, är en kunskapsintensiv mötesplats för studenter, lärare och forskare från hela världen.

Vi undanber oss alla kontakter från annonsförsäljare, rekryterings- och bemanningsföretag på grund av statliga upphandlingsregler.

Anställningsform Tidsbegränsad anställning

Anställningens omfattning

Tillträde

Tillträde 2027-02-01 eller enligt överenskommelse

Löneform Månadslön

Antal lediga befattningar

Sysselsättningsgrad

Län Skåne län

Referensnummer

Facklig företrädare

• OFR/ST:Fackförbundet ST:s kansli, 046-2229362, [e-mail]
• SACO:Saco-s-rådet vid Lunds universitet, 046-2220000, [e-mail]