Bioinformatiker

Karolinska Institutet; Solna kommun; Hybrid; SEK 400 000 - 600 000; Full time

Job summary

Ett ledande medicinskt universitet i Sverige söker en bioinformatiker för att arbeta i ett team som fokuserar på att förstå cellulära och molekylära mekanismer för kronisk smärta. I rollen kommer du att utveckla avancerade metoder och använda maskininlärning för analys av biomedicinska data. Tjänsten erbjuder möjlighet till distansarbete och en kreativ arbetsmiljö.

Benefits

Flexibelt arbetssätt

Träning i friskvårdsanläggningar

God förmåner genom kollektivavtal

Qualifications

• Masterexamen inom datavetenskap, bioinformatik, bioteknik eller motsvarande.
• Erfarenhet av att utveckla och optimera djupa neurala nätverk.
• Färdigheter inom GPU-accelererad bildanalys.

Responsibilities

• Utveckla och tillämpa avancerade metoder för att studera cellulära processer.
• Kombinera maskininlärning med omics-teknologier för forskning.
• Arbeta i tvärvetenskapliga team för att lösa komplexa problem.

Skills

Utveckling av djupa neurala nätverk

Maskininlärningsmetoder för biomedicinska data

Bildanalys

Python

R

Bash

Education

Masterexamen inom datavetenskap eller motsvarande

Tools

MONAI

PyTorch

TensorFlow

FIJI-ML

Matlab

Job description

Översikt

Vi välkomnar ansökningar till en tjänst som bioinformatiker i professor Camilla Svenssons forskargrupp, som utforskar de cellulära och molekylära mekanismerna bakom kroniska smärttillstånd. Tjänsten är placerad vid Institutionen för fysiologi och farmakologi vid Karolinska Institutet, som erbjuder en kollegial, internationell och dynamisk forskningsmiljö. Vi erbjuder en spännande, öppen och samarbetande arbetsplats och forskningsprojekt där du ges möjlighet att verkligen göra skillnad.

I denna roll blir du en del av ett team som arbetar för att tänja gränserna för vår förståelse av smärta. Du kommer att utveckla och tillämpa avancerade beräkningsmässiga och experimentella metoder för att studera cellulära och molekylära processer med hög upplösning. Genom att kombinera banbrytande maskininlärning med toppmoderna bild- och omics-teknologier kommer ditt arbete att direkt bidra till upptäckter som kan förändra vår förståelse av kronisk smärta och i förlängningen förbättra livet för patienter.

Vem är du?

Vi söker dig som har:

• Masterexamen inom datavetenskap, bioinformatik, bioteknik, systembiologi eller motsvarande relevant naturvetenskapligt/tekniskt område
• Erfarenhet av att utveckla, designa och optimera djupa neurala nätverk, särskilt konvolutionella nätverk, med ramverk som MONAI, PyTorch och TensorFlow
• Färdigheter inom GPU-accelererad bildanalys samt utveckling av pipelines och adaptiva algoritmer för biomedicinska data
• Erfarenhet av pipeline-utveckling med FIJI-ML, Python, R, Matlab och Bash
• Förmåga att designa och implementera nya maskininlärningsmetoder för storskaliga och multidimensionella datamängder
• God kompetens inom bioinformatik och biostatistik

Det är meriterande om du har:

• Praktisk erfarenhet av våtlabbsmetoder, exempelvis konfokalmikroskopi, flödescytometri, immunohistokemi eller molekylärbiologiska tekniker (DNA, RNA, protein)
• Erfarenhet av analys av data från olika omics-teknologier (genomics, transcriptomics, proteomics, metabolomics)
• Förmåga att koppla samman storskaliga dataset för att identifiera biologiska mekanismer och mönster

Vi söker dig som är kreativ och lösningsorienterad med en stark vilja att driva forskningen framåt. Du tar initiativ, arbetar självständigt och ser möjligheter där andra ser hinder. Samtidigt är du en lagspelare som trivs med att samarbeta i tvärvetenskapliga team. Ditt engagemang och din nyfikenhet märks i ditt arbetssätt, och du har förmågan att både bidra med nya idéer och omsätta dem i praktiken.

Vi lägger stor vikt vid personliga egenskaper i denna rekrytering.

En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet en statlig myndighet. Det gör att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal. Medarbetare på KI erbjuds också möjlighet till ett flexibelt arbetssätt. Det innebär att om den verksamhet du jobbar i tillåter, så kan du arbeta en del av din arbetstid på distans. Du får även träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar där utbildad personal finns på plats.

Varmt välkommen med din ansökan senast den 17 oktober.

Ansökan och villkor

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi. I denna rekrytering söker du med ditt CV utan personligt brev. I ansökningsformuläret kommer du istället att få svara på några frågor om varför du söker jobbet.

Vid tillsvidareanställning tillämpar KarolinskaInstitutet 6 månaders provanställning.