Datascientist antibioticaresistentie

Rijksinstituut voor Volksgezondheid en Milieu (RIVM); Bilthoven; Hybrid; EUR 39,000 - 62,000; Full time

Benefits offered by this job

IKB (Individueel Keuzebudget)

Studiefaciliteiten

Bedrijfsfitness

OV-reiskostenvergoeding

Ouderschapsverlof

Job summary

Rijksinstituut voor Volksgezondheid en Milieu (RIVM) in Bilthoven zoekt een Datascientist antibioticaresistentie die 28-36 uur werkt. Je bouwt en moderniseert datapipelines om antibioticaresistentie in Nederland in kaart te brengen en omzet SAS-processen naar schaalbare R-code.

Je werkt nauw samen met epidemiologen en medisch specialisten, levert duidelijke tabellen en dashboards en versterkt data packages binnen DIS en ZIA. Ruimte voor hybride werk en professionele groei wordt geboden.

Qualifications

• Minimaal een afgeronde HBO-opleiding in data science of vergelijkbaar.
• Ervaring met R en data pipelines in epidemiologische context is een pré.
• Kennis van SAS en automatisering van dataworkflows is wenselijk.

Responsibilities

• Bouwen, moderniseren en automatiseren van datapipelines voor antibioticaresistentie.
• Converteer SAS-scripts naar R en ontwikkel generieke functies.
• Verzamel en vertaald lab-data naar tabellen, grafieken en dashboards.
• Samenwerken met epidemiologen en medisch specialisten binnen ZIA en DIS.

Skills

Analytical thinking

Communicatie met epidemiologen

Teamwork

Education

HBO-opleiding data science

Tools

R

Tidyverse

R Markdown

Quarto

R Shiny

Git

Python

SAS

Job description

Als Datascientist antibioticaresistentie in Bilthoven werk je 28 - 36 uur bij het RIVM.

Dit ga je doen

Als data scientist bouw en moderniseer je de datapipelines die antibioticaresistentie in Nederland in kaart brengen. In deze rol combineer je de verdieping van complexe data-puzzels in R met de dynamiek van nauwe samenwerking met epidemiologen en medisch specialisten. Je krijgt de vrijheid om bestaande SAS-processen slim te herstructureren naar schaalbare code. Binnen een maatschappelijk gedreven omgeving ontwikkel je jezelf zo door op het snijvlak van data science en epidemiologie, terwijl jouw werk bijdraagt aan besluiten over de nationale volksgezondheid.

Wat ga je doen

Je werkt als data scientist aan het in kaart brengen van antibioticaresistentie in Nederland. Het RIVM verzamelt hiervoor gegevens via het Infectieziekten Surveillance Informatie Systeem – Antimicrobiële Resistentie (ISIS-AR). In dit systeem komen data uit de dagelijkse diagnostiek van Nederlandse medisch-microbiologische laboratoria samen. Jij bouwt, moderniseert en automatiseert de gegevensstromen en pipelines die van deze ruwe laboratoriumdata heldere inzichten maken.

Het grootste deel van de werkweek werk je binnen de afdeling Zorggerelateerde Infecties en Antimicrobiële resistentie (ZIA). Samen met epidemiologen zet je bestaande data-pipelines die nu nog in SAS draaien om naar de programmeertaal R. Je schrijft scripts voor datatransformatie en vertaalt gegevens naar duidelijke tabellen, grafieken, kaarten en rapporten.

Ongeveer één dag per week sluit je aan bij je directe collega-data scientists van de afdeling Data, Innovatie en Surveillance (DIS). Binnen DIS werk je aan het technisch versterken van de packages en standaarden die het hele centrum Epidemiologie en Surveillance van Infectieziekten (EPI) gebruikt. Hierbij maak je gebruik van hulpmiddelen zoals Tidyverse voor datapipelines, GitLab voor versiebeheer, R Markdown voor automatische rapportages en R Shiny voor dashboards.

Je verdiept je in een reeks complexe SAS-scripts die worden gebruikt om laboratoriumuitslagen te interpreteren. Met jouw ervaring in R zie je hoe dit proces sneller kan en waar dubbel werk wordt gedaan. Je ontwerpt generieke functies om deze processen te bundelen en stemt deze aanpak af met de betrokken epidemiologen. Wanneer blijkt dat verschillende laboratoria hun gegevens net anders aanleveren, pas je de code aan. Je herkent de patronen in de afwijkende data en bouwt de R-functies zo op dat ze flexibel omgaan met deze verschillen. Zo zorg je voor betrouwbare en herbruikbare code die voldoet aan onze interne kwaliteitsstandaarden.

Bij deze werkzaamheden krijg je de ruimte om te vernieuwen, waardoor er volop gelegenheid is om kennis en expertise op te bouwen op het snijvlak van epidemiologie en data science. Je werk gaat direct over het bewaken van antibioticaresistentie in Nederland.

Over het team

Het centrum Epidemiologie en Surveillance van Infectieziekten (EPI) heeft tot doel om de gezondheid van Nederland op het gebied van infectieziekten te analyseren en te bewaken. Vanuit de afdeling DIS ondersteunen we met 25 medewerkers de rest van het centrum op het gebied van data science, data management, data engineering, rapportages en privacy compliance. Je werkt nauw samen met de afdeling ZIA, een multidisciplinair team van artsen, epidemiologen en deskundigen infectiepreventie.

De werksfeer binnen beide teams is open, vriendelijk, gedreven en nieuwsgierig. Iedereen is druk bezig met uiteenlopende projecten, maar staat toch open voor vragen en springt bij als dit nodig is. Jouw collega’s zijn over het algemeen zeer leergierig; innovatie en nieuwe ideeën worden aangemoedigd. Een goede, ontspannen werksfeer wordt bevorderd door een dagelijkse lunchwandeling in het bos, werkuitjes en borrels. Naast de werkdagen op kantoor (minimaal 2 dagen per week) is er ook ruimte om vanuit huis te werken en zo jouw privé-werk balans optimaal in te richten.

Dit krijg je

• Schaal 10
• €3.496 - €5.535 (bruto)
• Arbeidsovereenkomst voor bepaalde tijd
• 1 jaar
• 28 - 36 uur
• Het salaris is gebaseerd op een werkweek van 36 uur.

Deze functie houdt verband met een aantal onderzoeksprojecten, die in ieder geval 12 maanden lopen. De kans is groot dat dit continueert. We komen dan ook graag in contact met kandidaten die zich voor langere tijd aan ons willen verbinden. Op dit moment kunnen wij hiervoor echter geen garantie geven. Je zult vanzelfsprekend tijdig geïnformeerd worden, over de (on)mogelijkheid om jouw arbeidsovereenkomst te verlengen.

Dit bieden we nog meer

Naast het salaris ontvang je een Individueel Keuzebudget (IKB). Het IKB bestaat uit geld (16,50% van je bruto jaarsalaris) en tijd. Met het IKB maak jij de keuzes die bij jou passen en kun je een deel van je arbeidsvoorwaarden zelf samenstellen. Je kunt er bijvoorbeeld voor kiezen om een deel van je maandinkomen te laten uitbetalen wanneer jij dat wenst. Ook kun je dit budget omzetten in verlof en andersom of besteden aan fiscaal vriendelijke doelen. De Rijksoverheid hecht sterk aan persoonlijke groei en loopbaanontwikkeling en biedt daarvoor tal van mogelijkheden. Tot de secundaire arbeidsvoorwaarden behoren onder meer verschillende studiefaciliteiten, bedrijfsfitness, volledige vergoeding van je OV-reiskosten woon-werkverkeer en gedeeltelijk betaald ouderschapsverlof.

Dit vragen wij

Wat breng jij mee

• Je hebt minimaal een afgeronde hbo-opleiding in data science of een vergelijkbare richting en je hebt affiniteit met epidemiologische- of gezondheidsdata. Heb je dit niet, maar spreekt deze vacature jou wel aan, reageer dan alsnog en laat in jouw motivatie weten waarom deze vacature jou aanspreekt.
• Je hebt aantoonbare ervaring met R en Tidyverse, en idealiter ook met hulpmiddelen als R Markdown, Quarto, R Shiny, Git of Python.
• De bereidheid om bestaande SAS-scripts te leren lezen, zodat je kunt bijdragen aan de omzetting naar R. Ervaring met SAS is geen vereiste.
• Je doorgrondt zowel de hoofdlijnen als de fijnmazige details van dataprocessen en kunt hier zelfstandig keuzes in maken om de kwaliteit van de code te verhogen.
• Je bent wendbaar in je werkstijl en bent zo nodig bereid om bij een actuele crisissituatie extra bij te springen. Tijdens een infectieziekte uitbraak, zoals COVID-19, draaien we overuren en in dit soort uitzonderlijke gevallen ben je bereid extra te werken in het weekend of op feestdagen.
• Je zoekt actief de verbinding met collega's en kunt complexe technische concepten helder uitleggen aan epidemiologen en andere professionals zonder technische achtergrond. Hiervoor is het nodig dat je goed Nederlands en Engels spreekt en schrijft.

Hier kom je te werken

Over RIVM

Als Rijksinstituut voor Volksgezondheid en Milieu (RIVM) zijn we een deskundige, betrouwbare en onafhankelijke adviseur voor overheid, professionals en burgers. Ons doel: een gezonde bevolking en een duurzame, veilige en gezonde leefomgeving. We bewaken gezondheid, ziekten, de kwaliteit van de leefomgeving én het milieu. Daarvoor doen we onderzoek en we verzamelen kennis voor toegankelijke informatie en toepasbare adviezen.

Bijzonderheden

• Bij je indiensttreding vragen we altijd om een Verklaring Omtrent Gedrag (VOG);
• Voor een volledig beeld van de zakelijke achtergrond van sollicitanten raadplegen we soms LinkedIn