Technicien-ne en phytopathologie et écologie microbienne

INRAE; Avignon; Sur place; EUR 19 000 - 26 000; Plein temps

Résumé du poste

INRAE Avignon recherche un(e) spécialiste en biologie végétale et microbiologie pour rejoindre l’équipe MISTRAL de l’unité Pathologie Végétale. Vous contribuerez à des projets biosphares et au développement de biosolutions contre les maladies des plantes.

Le poste implique la conduite d’expériences en laboratoire et en conditions semi-contrôlées, avec des analyses moléculaires et un travail en équipe. Maîtrise des protocoles et anglais technique souhaités.

Qualifications

• Formation recommandée: Une formation en biologie est souhaitée, incluant des connaissances en microbiologie, biologie moléculaire et biologie végétale.
• Compétences en hygiène et sécurité en laboratoire.
• Maîtrise des outils informatiques courants (Pack Office).

Responsabilités

• Conduire des essais sur plantes en conditions contrôlées pour évaluer des biosolutions.
• Réaliser des prélèvements et analyses de biologie moléculaire ( ADN/ARN, PCR, qPCR).
• Gérer les expérimentations en conditions semi-contrôlées et suivre les protocoles expérimentaux.
• Renseigner et communiquer les résultats des expérimentations lors des réunions d’équipe.

Connaissances

Microbiologie

Biologie moléculaire

Biologie végétale

Anglais technique

Organisation

Rigueur

Esprit d'équipe

Formation

Formation en biologie

Outils

Pack Office

Description du poste

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales , implantées dans 18 centres sur toute la France.INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Vous serez accueilli(e) au sein de l’équipe MISTRAL de l’unité de Pathologie Végétale d’INRAE Avignon. Ce poste sera encadré par Marc Bardin (DR INRAE) et Clémentine Lepinay (CR INRAE), dont les expertises complémentaires portent sur l’évaluation de stratégies alternatives de protection contre les maladies fongiques de la tomate et la caractérisation du microbiote associé aux plantes. Vous travaillerez en collaboration avec un-e post-doctorant-e dédié-e au projet BIOSPHAERE.

Face aux défis actuels auxquels est confrontée l’agriculture, le développement de biosolutions innovantes constitue un levier stratégique essentiel pour favoriser des systèmes de production plus durables. Le biocontrôle, qui repose entre autres sur l’utilisation d’agents microbiens ou de substances d’origine microbienne, végétale ou minérale, représente une alternative prometteuse aux pesticides chimiques.

Votre poste s’inscrit dans le cadre du projet BIOSPHAERE qui a pour ambition de développer de nouvelles solutions de biocontrôle. Les biosolutions développées seront évaluées pour leur efficacité contre des insectes ravageurs, des bactéries et des champignons phytopathogènes de la tomate. Ce projet collaboratif réunit des partenaires académiques et industriels autour de la conception, de la caractérisation et de la validation de substances actives innovantes, notamment des enzymes, des lipopeptides et des métabolites naturels d’origine microbienne.

Votre poste contribuera plus précisément au développement de nouvelles solutions de biocontrôle pour la protection de la tomate contre Oidium neolycopersici, Botrytis cinerea et Passalora fulva.

• Conduire des essais sur plantes en conditions contrôlées pour évaluer l’efficacité de biosolutions
• Mettre en œuvre des expérimentations (tests in vitro, in planta et observations microscopiques) visant à caractériser les modes d’action des substances actives retenues
• Mettre en place et suivre des essais en conditions semi-commerciales (tunnels de culture) pour valider les biosolutions les plus prometteuses et identifier les facteurs influençant leur efficacité
• Réaliser des prélèvements et effectuer des analyses de biologie moléculaire pour identifier les communautés microbiennes associées aux plantes et évaluer l’impact des biosolutions sur ces communautés

Vous intègrerez un environnement expérimental favorable au sein de l’unité Pathologie Végétale, bénéficiant d’un accès à des infrastructures et plateformes en microbiologie, microscopie, biologie moléculaire, ainsi que des dispositifs expérimentaux permettant l’évaluation des biosolutions, depuis des conditions contrôlées jusqu’à des conditions de production semi-commerciales.

Vous serez plus particulièrement en charge de:

Vous serez amené-e àmettre en œuvre diverses techniques :

• Microbiologie (préparation de milieux de culture et de suspensions, repiquage de souches bactériennes et fongiques, dénombrements)
  • Phénotypage sur plante (inoculation de plantes, notation de symptômes, suivi de la croissance des plantes)
    • Biologie moléculaire (extractions d'ADN et d’ARN, gels d'électrophorèse, PCR, qPCR)

Vous serez en charge des activités suivantes:

• S’approprier, adapter et mettre en œuvre des protocoles expérimentaux, y compris en anglais
  • Gérer des échantillons (prélèvements en conditions contrôlées et sur le terrain, stockage, traçabilité)
    • Planifier les expérimentations en interaction avec les utilisateurs des équipements et laboratoires
      • Appliquer la réglementation (hygiène et sécurité, biosécurité)
      • Gérer les stocks et les commandes liées aux expérimentations
      • Tenir un cahier de laboratoire
      • Saisir les données
      • Rassembler et mettre en forme les résultats
      • Communiquer oralement sur son travail lors de réunions d’équipe

Vous travaillerez régulièrement sous une hotte à flux laminaire pour assurer des conditions stériles. Vous serez amené-e à réaliser des expérimentations en laboratoire et au sein d’installations expérimentales (chambres climatiques, serres, parcelles expérimentales). Vous respecterez les consignes de sécurité biologique adéquates.

Formations et compétences recherchées

Formation recommandée: Une formation en biologie est souhaitée, incluant des connaissances théoriques et techniques en microbiologie, biologie moléculaire et biologie végétale ; ainsi que des bases en matière d'hygiène et de sécurité à respecter dans les laboratoires de microbiologie et de biologie moléculaire.

Les compétences recherchées sont :

- Bonne pratique de la microbiologie et de la mycologie: techniques d’asepsie, préparation de milieux de culture, repiquage de souches, production d’inoculum, dénombrements;

- Connaissance de base et pratique de la biologie moléculaire: extraction d'ADN et/ou ARN, PCR, gel d'électrophorèse;

- Notions en biologie végétale;

- Maîtrise des outils informatiques courants (pack office);

- Anglais technique pour comprendre des protocoles et documents scientifiques (niveau A2 à B1)

- Rigueur et minutie dans la réalisation des expérimentations

- Sens de l'organisation, adaptabilité, autonomie

- Aptitude au travail en équipe,qualitésrelationnelles et capacité de communication

- Sens de l'éthique et transparence dans la conduite et le rendu des travaux

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez(selon le type de contrat et sa durée) :

Les personnes accueillies à INRAE, établissement public de recherche, sont soumises aux dispositions du Code de la fonction publiquenotamment en ce qui concerne l’obligation de neutralité et le respect du principe de laïcité. A ce titre, dans l’exercice de leurs fonctions, qu’elles soient ou non au contact du public, elles ne doivent pas manifester leurs convictions, par leur comportement ou leur tenue, qu’elles soient religieuses, philosophiques ou politiques.> En savoir plus : site fonction publique.gouv.fr

Référence de l'offre

• Contrat : Mission temporaire
• Durée :24 mois
• Début du contrat : 01/01/2027
• Rémunération :selon grille salariale : 2018,34 Euros brut/mois