Ingénieur-e en Biologie moléculaire

INRAE; Colmar; Hybride; EUR 25 000 - 37 000; Plein temps

Résumé du poste

INRAE recrute un(e) chercheur(se) en biologie moléculaire et génétique végétale pour travailler sur les interactions plante-virus et vecteurs d’insectes, au sein de Colmar.

Vous développerez des approches moléculaires et participerez à des analyses GWAS et à la validation fonctionnelle des gènes candidats, avec l’équipe Virologie et Vection de l’unité SVQV.

Le poste implique des expériences en laboratoires de confinement C2 et une communication en français et en anglais.

Qualifications

• Master 2 ou diplôme d’ingénieur en biologie moléculaire ou génétique végétale.
• Connaissances en virologie végétale et interactions plantes-virus-insectes.
• Maîtrise des techniques de biologie moléculaire et de clonage.
• Expérience en caractérisation d’expression génique chez les plantes.
• Curiosité, rigueur et bonnes capacités de communication.

Responsabilités

• Caractériser l’expression de gènes candidats par qRT-PCR.
• Sélectionner et caractériser des mutants d’Arabidopsis disponibles.
• Moduler l’expression des gènes par transformation, RNAi ou VIGS.
• Contribuer à la localisation cellulaire des protéines candidates.

Connaissances

Biologie moléculaire

Génétique végétale

Virologie végétale

Interactions plantes-virus

Formation

Master 2

Diplôme d’ingénieur

Description du poste

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales , implantées dans 18 centres sur toute la France.INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Les études comportementales du puceron combinées à un phénotypage à haut débit du comportement du puceron Myzus persicae vecteur de nombreux virus, dont les virus de la jaunisse ou de la mosaïque du navet et celui de la mosaïque du chou-fleur qui font l’objet de cette étude. Les études comportementales du puceron combinées à des analyses génétiques d’association à l’échelle du génome (GWAS) permettent d’identifier des gènes candidats potentiellement impliqués dans la manipulation de la plante hôte ou du vecteur.
Vous contribuerez à la validation fonctionnelle des gènes candidats en développant des approches de biologie moléculaire. Vous travaillerez en étroite collaboration avec le doctorant impliqué dans le projet ayant conduit les études comportementales et l’identification des gènes candidats, avec l’ingénieure d’étude de l’équipe, ainsi qu’avec l’ensemble des membres de l’équipe Virologie et Vection de l’unité SVQV.

Vos activités

Vous serez plus particulièrement en charge de :

• - caractériser l’expression de gènes candidats chez différentes accessions d’Arabidopsis, en conditions saines et infectées par qRT-PCR;
• - sélectionner et caractériser des mutants d’Arabidopsis disponibles dans les banques et affectés dans l’expression des gènes candidats ;
• - si les mutants d’Arabidopsis ne sont pas disponibles, mettre en œuvre différentes approches permettant de moduler l’expression (sur- ou sous-expression) des gènes candidats par transformation génétique stable ou transitoire d’Arabidopsis, RNA interférence, VIGS… ;
• - contribuer, lorsque pertinent, à la caractérisation des protéines candidates, notamment par l’étude de leur localisation cellulaire et subcellulaire.

Vous serez amené à travailler dans des laboratoires de confinement C2 pour la manipulation des plantes transgéniques

Formations et compétences recherchées

Master/Ingénieur (Bac+5)

Formation recommandée: Master 2 ou diplôme d’ingénieur en biologie moléculaire, biologie végétale, génétique, génomique, biotechnologies ou domaine équivalent.

Connaissances souhaitées:

• * Biologie moléculaire et génétique végétale ;
• * Biologie et physiologie des plantes ;
• * Des connaissances générales en virologie végétale et en interactions plantes-virus-insectes seraient appréciées

Expérience appréciée:

• * Expérience en biologie moléculaire, notamment en analyse d’expression génique chez les plantes ;
• * Expérience en clonage moléculaire, transformation végétale ou expression transitoire ;
• * Des compétences en microscopie et en étude de la localisation cellulaire et subcellulaire de protéines seraient un plus.

Aptitudes recherchées:

• * Maîtrise des techniques courantes de biologie moléculaire et capacité à mettre en œuvre et adapter des protocoles expérimentaux ;
• * Rigueur dans la réalisation des expériences et la traçabilité des résultats ;
• * Capacité à analyser, structurer et interpréter des données expérimentales.

Le candidat réalisera des expériences de manière autonome dans des conditions de laboratoire contrôlées. Le candidat doit être curieux, méticuleux et avoir de bonnes capacités de communication (en français et en anglais) pour interagir efficacement avec les membres de l’équipe.

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez(selon le type de contrat et sa durée) :

Les personnes accueillies à INRAE, établissement public de recherche, sont soumises aux dispositions du Code de la fonction publiquenotamment en ce qui concerne l’obligation de neutralité et le respect du principe de laïcité. A ce titre, dans l’exercice de leurs fonctions, qu’elles soient ou non au contact du public, elles ne doivent pas manifester leurs convictions, par leur comportement ou leur tenue, qu’elles soient religieuses, philosophiques ou politiques.> En savoir plus : site fonction publique.gouv.fr

• Rémunération :de 2244,79€ à 3332,73€ brut mensuel selon expérience professionnelle