Stage - Etude de l'évolution spatiale des populations de cellules de Schwann par analyse d'image H/F

CEA; Fontenay-aux-Roses; On-site; EUR 13,000 - 17,000; Full time

Benefits offered by this job

Restaurant d’entreprise

Transport pris en charge à 75%

Job summary

Le CEA recherche un stagiaire ingénieur pour étudier l'évolution spatiale des populations de cellules de Schwann par analyse d'image et méthodes de graphes. Le stage se déroule au sein de l’Institut Jacob, Fontenay-aux-Roses, avec accès à l'infrastructure de calcul et à l'équipe traitement de l'image.

Vous appliquerez Python et PyTorch pour développer un suivi temporel fiable et collaborative, en lien avec les chercheurs et les plateformes de MIRCen.

Qualifications

• Étudiant en école d'ingénieurs ou Master 2, traitement du signal/image.
• Maîtrise de Python et d'apprentissage profond (PyTorch).
• Connaissance des bibliothèques de graphes (NetworkX / PyTorch Geometric).
• Notions de théorie des graphes et optimisation combinatoire.
• Bonne connaissance Linux et calcul haute performance (CPU/GPU).
• Gestion de version avec git ou GitHub.

Responsibilities

• Mettre en place un protocole de suivi temporel et spatial des populations de Schwann par graphes.
• Analyser des séquences vidéo de microscopie et développer des méthodes de suivi.
• Travailler avec l'équipe traitement de l'image et l'infrastructure CEA.

Skills

Python

Apprentissage profond (PyTorch)

Théorie des graphes

Environnement Linux

Calcul haute performance

Gestion de versions (git/GitHub)

Education

Bac+5 - Diplôme École d'ingénieurs

Tools

NetworkX

PyTorch Geometric

PyTorch

GitHub

Job description

Stage - Etude de l'évolution spatiale des populations de cellules de Schwann par analyse d'image H/F

Description du poste

Mathématiques, information scientifique, logiciel

Intitulé de l'offre

Stage - Etude de l'évolution spatiale des populations de cellules de Schwann par analyse d'image H/F

Sujet de stage

Suivi temporel de la distribution spatiale de populations de cellules de Schwann par méthodes de graphes sur des séquences acquises par microscopie de fluorescence

Description de l'offre

L'objectif de ce stage ingénieur sera de mettre en place un protocole complet de suivi temporel et spatial de populations de cellules de Schwann par des méthodes de graphes, dans le cadre de l'étude de séquences vidéo de microscopie optique de fluorescence acquises pour l'étude in vitro de cultures cellulaires modèles de tumeurs (fibroblastomes, tumeurs NF1)(Figure). La finalité de cette étude serait d'implémenter une méthode de suivi temporel et spatial fiable de chaque cellule individualisée, permettant ensuite, au sein du projet, d'étudier les comportements des différentes populations cellulaires, saines ou pathologiques à l’échelle du système de culture in vitro.

Profil du candidat

Vousêtesactuellement en école d'ingénieur ou Master 2, filière traitement du signal/image, informatique ou mathématiques appliquées

Compétences techniques et comportementales :

Au cours de ce stage, vous serez amené.e à interagir principalement avec l'équipe de traitement de l'image de MIRCen (informaticiens, méthodologistes en traitement de l'image, etc.).

• Maîtriser la programmation en Python,
• Avoir de bonnes bases en apprentissage profond (PyTorch)
• Première expérience des bibliothèques de graphes (NetworkX, PyTorch Geometric ou équivalent),
• Notions de théorie des graphes et d'optimisation combinatoire (recherche de chemin, appariement).
• Bonne connaissance de l'environnement Linux, du calcul haute performance (CPU/GPU, cluster de calcul) et d'un outil de gestion de sources (git/GitHub).

Vous bénéficierez de l'encadrement des équipes du CEA et de l'infrastructure informatique existante (serveurs de calcul internes, plateforme logicielle).

De bonnes capacités d'adaptation, de coordination et de travail en équipe sont requises pour ce projet.

Pourquoi nous rejoindre ? ….

En rejoignant l'Institut Jacob, vous intégrez un environnement de recherche dynamique et innovant où vous avez l’opportunité d’apprendre, de grandir et de jouer un rôle clé au sein d’une entité/unité d’excellence.

Les à-côtés de votre mission principale peuvent vous intéresser :

• Un écosystème de recherche à la pointe, dédié à des thématiques à fort enjeu sociétal.
• Des avantages pratiques : restaurant d’entreprise, transport pris en charge à 75%, et bien plus encore.
• Un cadre de travail verdoyant au cœur de la ville de Fontenay aux Roses, à quelques minutes de Paris en transports

Conformément aux engagements pris par le CEA en faveur de l'intégration des personnes handicapées, cet emploi est ouvert à toutes et à tous. Le CEA propose des aménagements et/ou des possibilités d'organisation pour l'inclusion des travailleurs handicapés

Localisation du poste

Fontenay-aux-Roses

Ville

Fontenay aux Roses

Diplôme préparé

Bac+5 - Diplôme École d'ingénieurs

Formation recommandée

école d'ingénieur ou Master 2, filière traitement du signal/image, informatique ou mathématiques app

Entité de rattachement

Le CEA est un acteur majeur de la recherche, au service des citoyens, de l'économie et de l'Etat.

Il apporte des solutions concrètes à leurs besoins dans quatre domaines principaux : transition énergétique, transition numérique, technologies pour la médecine du futur, défense et sécurité sur un socle de recherche fondamentale. Le CEA s'engage depuis plus de 75 ans au service de la souveraineté scientifique, technologique et industrielle de la France et de l'Europe pour un présent et un avenir mieux maîtrisés et plus sûrs.

Implanté au cœur des territoires équipés de très grandes infrastructures de recherche, le CEA dispose d'un large éventail de partenaires académiques et industriels en France, en Europe et à l'international.

Les 20 000 collaboratrices et collaborateurs du CEA partagent trois valeurs fondamentales :

• La conscience des responsabilités
• La coopération
• La curiosité

Référence

2026-42479

Description de l'unité

L'Institut de Biologie François-Jacob a pour mission de conduire des recherches en radiobiologie et radiotoxicologie, en génomique humaine, en génomique environnementale et en recherche translationnelle dans le domaine des affections neurodégénératives, infectieuses et hématologiques, en s'appuyant sur les plateformes de haute technologie et l'expertise des unités de la DRF situées sur les sites de Fontenay aux Roses et d'Evry.

MIRCen - Molecular Imaging Research Center - est une installation de recherche préclinique développée par le CEA et l'INSERM. Cette installation, basée sur le site CEA de Fontenay-aux-Roses, est constituée d'un ensemble de plateformes dédiées au développement et à la validation de modèles animaux pertinents de pathologies humaines. Ces modèles sont utilisés pour le développement et la validation de nouvelles techniques permettant de détecter des déficits à un stade précoce de la maladie. Ils sont également utilisés pour évaluer des thérapies innovantes dans le domaine des maladies neurodégénératives.