Stage Bioinformatique ML pour données de spectrométrie

bioMérieux SA; Marcy-l'Étoile; On-site; EUR 11,000 - 17,000; Full time

Benefits offered by this job

Restaurant d’entreprise

Remboursement des transports

Conciergerie sur les sites

Job summary

bioMérieux recrute pour un stage de six mois au sein du Département de Recherche en Microbiologie, sur le site de Marcy-l’Étoile. Vous participerez au développement d’outils d’analyse de données issues de VITEK-MS et à l’amélioration des méthodes de caractérisation de microorganismes.

Le parcours combine microbiologie, informatique et bioinformatique, avec formation et encadrement par un tuteur expérimenté.

Qualifications

• Stage de six mois en informatique, data science et bioinformatique.
• Formation pratique aux outils et ressources de calcul et à la collaboration en laboratoire.
• Profil Master 2 ou ingénieur, dominante informatique ou bioinformatique.

Responsibilities

• Participer au développement d’outils d’analyse de données de spectrométrie de masse.
• Évoluer les outils d’analyse et permettre des analyses à grande échelle.
• Travailler en collaboration avec le Laboratoire de Spectrométrie de Masse.
• Déployer l’outil validé sur la plateforme interne.

Skills

R et Python

Linux CLI

Snakemake / Nextflow

Shiny / Streamlit

Bioinformatique - notions

Education

Troisième année ingénieur ou Master 2

Tools

Snakemake

Nextflow

Git

GitLab

Linux CLI

Shiny

Streamlit

Job description

bioMérieux recrute pour un stage de six mois au sein du Département de Recherche en Microbiologie, sur le site de Marcy-l’Étoile. Vous participerez au développement d’outils d’analyse de données issues de VITEK-MS et à l’amélioration des méthodes de caractérisation de microorganismes.

Le parcours combine microbiologie, informatique et bioinformatique, avec formation et encadrement par un tuteur expérimenté.